Serpin

Serpins ( eng.  Serpins , förkortning för engelska  serine protease inhibitors , "serine protease inhibitors") är en grupp av proteiner som har en viss strukturell likhet med varandra och många av dem hämmar serinproteaser , det vill säga proteaser som har serin i aktivt centrum .

Introduktion

Ursprungligen betecknade denna term en klass av proteiner som specifikt hämmar vissa serinproteaser (till exempel är antitrombin en serpin som specifikt hämmar serinproteaset trombin ). Senare visade det sig dock att vissa proteiner som strukturellt liknar serpiner inte har hämmande aktivitet (till exempel det huvudsakliga äggviteproteinet ovalbumin ), men ändå klassificeras de också som serpiner.

Klassificering

År 2001 publicerades en klassificering av serpiner, enligt vilken 500 proteiner klassificerade som serpiner delades in i 16 clades (grupper som uppstod från en enda prekursor). Se (Silverman et al.) Bibliografi.

Klassens främsta representanter

Följande proteiner tillhör klassen av serpiner:

• Serinproteaser:
  • Alfa-antitrypsin ;
  • Alfa antichymotrypsin ;
  • alfa-antiplasmin (fibrinolysinhibitor ) ;
  • Antitrombin (en koagulationshämmare , specifikt faktor X , faktor IX och trombin ;
  • Cl-hämmare ;
  • Neuroserpin ;
  • Plasminogenaktivator-1- hämmare och Plasminogenaktivator-2- hämmare ( fibrinolysinhibitor );
  • Protein Z-liknande proteashämmare (ZPI, inaktiverar faktor X och faktor XI )

• Bindande globuliner och andra proteiner:
  • Transcortin
  • tyroxinbindande globulin
  • Angiotensin
  • Ovalbumin

Bibliografi

• Silverman GA, Bird PI, Carrell RW, Church FC, Coughlin PB, Gettins PG, Irving JA, Lomas DA, Luke CJ, Moyer RW, Pemberton PA, Remold-O'Donnell E, Salvesen GS, Travis J, Whisstock JC. Serpinerna är en växande superfamilj av strukturellt liknande men funktionellt olika proteiner. Evolution, hämningsmekanism, nya funktioner och en reviderad nomenklatur. J Biol Chem 2001;276:33293-6. PMID 11435447 .
• Gettins PGW. Serpin struktur, mekanism och funktion . Chem Rev 2002;102:4751-803. DOI 10.1021/cr010170+ .
• Irving JA, Steenbakkers PJ, Lesk AM, Op den Camp HJ, Pike RN, Whisstock JC. Serpiner i prokaryoter. Mol Biol Evol. 2002 Nov;19(11):1881-90. PMID 12411597 .
• Irving JA, Pike RN, Lesk AM, Whisstock. Phylogeny of the Serpin Superfamily: Implikationer av mönster av aminosyrakonservering för struktur och funktion. Genome Res. 2000; tio; 1845-64. PMID 11116082 .