Den tredje utvecklingsperioden för biogeografi kännetecknas av enorma vetenskapliga förvärv inom naturhistoria. En djup medvetenhet om floristisk-faunistiska och paleontologiska data passar inte längre in i den bibliska världsbilden om världens skapelse. Nya paleontologiska fynd vittnade om att förbättringen av levande varelser från de äldsta till de moderna geologiska skikten där de upptäcktes. Frånvaron av några länkar i denna kedja blev grunden för uppkomsten av en kompromiss mellan den religiösa och vetenskapliga världsbilden av katastrofteorin. Den bygger på det faktum att skaparen i varje geologiskt epos skapar en speciell organisk värld för den, som efter en viss tid förstör den för synder. Efter det börjar en ny skapelseakt och de döda varelserna ersätts av nya - förbättrade. Under existensen av liv på jorden upprepades detta flera gånger.
Teorin om katastrofer har formats under flera decennier, men den franske zoologen och paleontologen J. Cuvier anses vara dess författare. Under denna period fortsatte utvecklingen av biologi och geografi under inflytande av teorin om katastrofer, som J. Cuviers anhängare förde till absurditet. Med tiden, när de saknade länkarna i livets träd hittades, fanns det inget behov av att förklara evolutionsteorin för den organiska världen.
Den tredje perioden är känd för den tyske vetenskapsmannen O. Humboldts verk. Åren 1799 - 1804 . han, tillsammans med fransmannen E. Bonpland, utforskade Central- och Sydamerikas natur. Resultatet av denna expedition blev verket Journey to the Equal Regions of the New World med 30 volymer . 16 volymer, som ägnas åt studiet av växter och djur på denna subkontinent. Systematiseringen av hans eget och det material som hans föregångare samlade in gjorde det möjligt att förstå den allmänna bilden av utbredningen av levande organismer på slätterna och bergssystemen. A. Humboldt bestämde beroendet av utbredningen av olika typer av vegetation av naturförhållanden och framför allt klimat. Han förklarade idén om spridningen av latitudinell zonalitet beroende på motsvarande isotermer, lade grunden för läran om ursprungscentra för odlade växter, som på 1900-talet. fortsatte att utveckla den ryske vetenskapsmannen N. Vavilov . Humboldt lade grunden för läran om växtgrupperingar - fytocenoser , som bildades under efterföljande perioder, liksom läran om växtlivsformer.
Bland de regionala verken från denna period kan vi nämna 4-volymsverket av C. Ledebour Flora i Ryssland, som beskriver mer än 6,5 tusen arter av kärlväxter, inklusive 400 nya arter. Bland verken i den historiska riktningen är det värt att notera de schweiziska forskarna O. (far) och A. Dekandolev. Fadern föreslog en jämförande morfologi (homologi) av växter och förberedde ett 7-volymsverk Inträde i växtrikets naturliga system , som fortsattes av hans son - 8-17 volymer.
Den ekologiska riktningen inom biogeografi utvecklades av professorn vid Moskvas universitet K. Rul'e , som anses vara en av grundarna av ekologi och evolutionär paleontologi. Hans student M. Severtsov skrev den första ekologiska monografin Periodiska fenomen i livet för djur, fåglar och reptiler i Voronezh-provinsen, där han förklarade inflytandet av fysiska och geografiska förhållanden på processerna för migration, reproduktion, bosättning, etc., spåra sambandet mellan djurvärlden och skogs-stäpplandskapen. Principen om aktualism och historicism gjorde det möjligt att förklara idéer om miljöfaktorers inverkan på förändringar i levande organismer. Denna vetenskapsman anses vara författaren till den första holistiska undervisningen om vilda djur. Samtidigt med G. Treviranus introducerade han termen biologi i vetenskapligt bruk . J. Lamarcks verk spelade en positiv roll i det faktum att teorin om katastrofer började förlora sin betydelse.
Detta innebär att den tredje perioden i historien om biogeografins utveckling kännetecknas av att grunden läggs för utvecklingen av vetenskapens huvudområden, införandet och vederläggningen av teorin om katastrofer och förberedelsen av grunden för att förklara evolutionsteorin om livets utveckling på jorden.