Ribosomalt RNA 5.8S (5.8S rRNA) är en icke-kodande RNA-komponent i den stora subenheten av den eukaryota ribosomen , som spelar en viktig roll vid proteintranslation . Det transkriberas av RNA-polymeras I som en del av en 45S-prekursor som också innehåller 18S- och 28S -rRNA . Man tror att dess funktion är att translokera ribosomer [1] . Det är också känt att bilda en kovalent bindning med p53 -tumörsuppressorproteinet [2] . 5,8S rRNA kan användas som en referensgen för miRNA- detektion [3] . Ribosomalt RNA 5,8S används för att bättre förstå andra rRNA-processer och vägar i cellen [4] .
5,8S-rRNA:t är homologt med 5'-änden av den stora subenheten av det icke-eukaryota rRNA:t . I eukaryoter bryter ITS2-insättningen ned den stora subenhetens rRNA till 5.8S och 28S rRNA [5] . I vissa flugor delas 5,8 rRNA:t ytterligare i två delar [6] .
L567.5 rRNA-strukturen är cirka 150 nukleotider stor och består av många veckade strängar, av vilka några anses vara enkelsträngade [7] . Detta ribosomala RNA, tillsammans med 28S och 5S rRNA, och 46 ribosomala proteiner , bildar den stora underenheten av ribosomen . 5,8S rRNA transkriberas initialt tillsammans med 18S och 28S rRNA i 45S preribosomalt RNA, tillsammans med ITS 1 och ITS 2 ( intern transkriberad spacer ) och 5' och 3' ETS ( extern transkriberad spacer ) [8] . 5,8S rRNA är beläget mellan två ITS-regioner, med ITS1 som separerar det från 18S rRNA i 5'-riktningen, medan ITS2 separerar det från 28S rRNA i 3'-riktningen. ITS och ETS klyvs bort under rRNA-mognad. Detta uppnås genom en kontinuerlig klyvningsväg, utförd av både endonukleas och exonukleas , genom att skära av distanserna på specifika platser.