SMART | |
---|---|
Innehåll | |
Beskrivning | Bioinformatik resurs för identifiering av proteindomäner. |
organismer | Allt |
Kontakter | |
Forskningscenter | European Molecular Biology Laboratory |
Laboratorium | EMBL |
Originalpublikation | PMID 18978020 |
Tillgänglighet | |
Hemsida | smart.embl-heidelberg.de |
Övrig | |
Licens | Gratis för akademiker, men inte kommersiella användare |
Version | 7 |
Kuration | Ja |
SMART (Simple Modular Architecture Research Tool) är en databas som används vid identifiering och analys av proteindomäner i proteinsekvenser [1] [2] . SMART använder en algoritm baserad på tillämpningen av Hidden Markov Models på flera anpassningar för att detektera domäner i proteinsekvenser . Från och med januari 2012 innehöll SMART 1009 domänmodeller [3] . SMART-data användes för att skapa Conserved Domain Database ( CDD , Conserved Domain Database) och presenteras också som en del av InterPro- databasen . [fyra]
Databasen är organiserad av European Molecular Biology Laboratory i Heidelberg .