Haplogrupp N (mtDNA)

I human populationsgenetik är haplogrupp N en av haplogrupperna som identifieras genom analys av den mitokondriella DNA- sekvensen (mtDNA). Detta är en ovanligt utbredd haplogrupp, bärarna av dess subclades lever på flera kontinenter [6] , därför kallas den för en makro-haplogrupp. I sin tur är N-makrogruppen själv en av grenarna av L3-haplogruppen , från vilken den separerades i västra delen av Asien för 50-80 tusen år sedan. TMRCA för den basala icke-afrikanska haplogruppen N är cirka 51 tusen år (95 % konfidensintervall: 55,1-46,9 tusen år) [7] . Ancestral haplogrupp L3 kommer i sin tur från ättlingarna till en hypotetisk mitokondriell Eva från Afrika. Stephen Oppenheimer föreslog namnet Nasrin-klanen för makrogrupp N, och Brian Sykes  - Naomi.

Nästan alla haplogrupper i Europa , Oceanien , såväl som talare av indiska och många asiatiska språk härstammar från haplogrupp N. Den bildades i västra delen av Asien ungefär samtidigt som en annan utbredd M - makrogrupp . Båda finns i ett litet antal på Afrikas horn , där de introducerades som ett resultat av återvandringen av sina bärare för cirka 30 tusen år sedan. N9b-subhaplogruppen existerar med en relativt hög frekvens i populationerna i sydöstra Sibirien: Udege - 30,4%, Ulchi - 6,9% (Starikovskaya et al., 2005).

Andra utbredda makrogrupper härstammar från N-makrogruppen: A, N1, R, I, S, W, X, Y. Av dessa:

• N* subclade hittades i representanter för Cardiac Ware-kulturen [8] .
• haplogrupp A finns i Central- och Östasien, såväl som bland indianerna [9] ;
• haplogrupp R  är stamfadern till ett antal vanliga grupper, B, F, JT, P, såväl som HV , K och U , brett representerade i Europa [10] ;
• haplogrupp S hittades i australiensiska aboriginer [11] ;
• haplogrupp W är fördelad huvudsakligen i västra Eurasien [12] ;
• haplogrupp X1 hittades i Nordafrika och haplogrupp X2  - i Europa, Sibirien och Amerika [13] ;
• haplogrupp Y är vanlig bland Nivkhs och Ainu , och även, i litet antal, bland koreaner, mongoler, korjaker, itelmen, kineser, japaner, invånare i den malaysiska skärgården och vissa turkiska folk [14] [15] .

Paleogenetik

• Haplogrupp N identifierades i en kvinnlig skalle i åldern 47-45 tusen år från Konepruska-grottorna på Golden Horse Hill i Tjeckien [16] .
• Haplogrupp N bestämdes i de sena paleolitiska proverna BB7-240 och CC7-335 över 45 tusen år gamla. n. från Bacho Kiro- grottan i Bulgarien [17] .
• Haplogrupp N bestämdes i Oase 1-provet från den rumänska grottan Peshtera-cu-Oase (40 tusen år sedan) [18] och i Oase 2-provet [19] .
• Haplogrupp N1 identifierades i en invånare på Krim-platsen Buran-Kaya , som levde för 36 tusen år sedan. N1 BuranKaya3A bär på tre av de åtta mutationer som förekommer i den sällsynta mitokondriella haplogruppen N1b, mest koncentrerad i Mellanöstern, men utbredd från västra Eurasien till Afrika [20] .
• Haplogrupp N bestämdes i den mongoliska skallen Salkhit (Salkhit) för 34 950-33 900 år sedan [21] .
• Haplogrupp N identifierades i en invånare i den georgiska grottan Dzudzuana (Dzudzuana-grottan), som levde för 26 tusen år sedan [22] .
• N1b hittades i en representant för den Natufian kulturen [23] .
• N1a1a1 hittades hos två anatoliska bönder från staden Boncuklu, som levde 8300-7800 f.Kr., och hos två bönder från Tepecik-Çiftlik, som levde för cirka 6 tusen år sedan [24] .
• N1a1a1 hittades i en individuell Troc5 från Els Trox-platsen i Pyrenéerna , som levde för ungefär 7310-7206 år sedan [25] .
• Haplogrupp N identifierades hos två neolitiska pastoralister från Takarkori (Libyen), som levde i Gröna Sahara för 7 tusen år sedan [26] .
• N1a under den tidiga neolitiska eran var utbredd i Europa bland bärarna av Linear Band Pottery-kulturen [27] , men senare ersattes den av andra haplogrupper.
• N1b1 bestämdes från det eneolitiska (4500-3900/3800 f.Kr.) exemplaret I1177 från en israelitisk grotta nära den drusiska byn Peqi'in Cave [28] .
• N1b1a hittades i det anatoliska exemplaret Tep003 från Tepecik-Ciftlik (för cirka 6 tusen år sedan) [24] .
• N1a1a1a i en neolitisk proto-mongolisk från Shatar Chuluu (Bayankhongor, Mongoliet ) [29] .
• N1b1 identifierades i en potentiell Maykopian (det finns inga artefakter i begravningen) [30] [31] .
• N1 hittades bland representanter för bronsålderns Sintashta-kultur [32] .
• N9a hittades i en invånare i en arkeologisk plats från bronsåldern i Alagios (Valladolid, Centrala Spanien) [33] .
• N1a1a1a hittades i en representant för Sargat-kulturen [34] .
• N9b1 identifierades i representanter för Jōmon-kulturen IK002 (2500 år sedan, centrala Japan) [35] och i representanter för Jōmon-kulturen F5 och F23, som levde på Rebun Island för cirka 3500–3800 år sedan [36] , i exemplar I6341 (Begravning 5, JOM_137 , 1500-1000 f.Kr.) från Funadomari, i prover I13887 (1063 Begravning 7, 2191-1982 f.Kr.) och I13886 (1062 Begravning 6, 2136-1959 f.Kr.) från Rokutsu Shell Mound. Prov I13883 (1050 Burial 2, 984-835 f.Kr., Rokutsu Shell Mound) har en mitokondriell haplogrupp N9b2a [37] .
• Haplogrupp N identifierades i en representant för Koban-kulturen från Zayukovo-3-gravfältet, beläget nära byn Zayukovo i Baksan-regionen i Kabardino-Balkariska republiken (VIII-VII århundraden f.Kr.) [38] .
• N8 bestämdes från ett prov av hängande kistor från norra Thailand, N9a3 från Yunnan [39] .
• N9a, ett exemplar från Krasnoyarsk-regionen (400–100 f.Kr.) hittades [40]
• N5 identifierades i en mumie från det första årtusendet f.Kr. e. - början av vår era från samlingen av Pushkin State Museum of Fine Arts nr 4 (1.1a 5302 Pushkin Museum) [41] [42]
• N9a9 hittades i två barn som hittades i närheten av fästningen Kapidava i Dobruja (880-990) [40]
• N1b1a hittades i en Pskov-kvinna från 10-11-talen (prov VK158) [43] .
• N9a1 identifierade ett prov från Zhenzishan-kyrkogården i kinesiska Shangdu ( XIII-talet) [44] .

Anteckningar

1. ↑ Richards et al. (2006), En modell för spridningen av moderna människor ut ur Afrika  (inte tillgänglig länk) , Nukleinsyror och molekylärbiologi, 10.1007/3-540-31789-9
2. ↑ Chandrasekar et al. (2007), YAP-insättningssignatur i Sydasien Arkiverad 7 november 2017 på Wayback Machine , Ann Hum Biol. 2007 sep-okt;34(5):582-6.
3. ↑ Watson. Mitochondrial Footprints of Human Expansions in Africa  (engelska)  : tidskrift. — 1997.
4. ↑ Kivisild et al. Det genetiska arvet från de tidigaste nybyggarna kvarstår både i indiska stam- och kastpopulationer  (engelska)  : tidskrift. – 2003.
5. ↑ Kivisild et al. Genetiska bevis för moderna mänskliga spridningar i Sydasien // The Evolution and History of Human Populations in South Asia  (engelska) . – 2007.
6. ↑ Haplogroups I&N . Hämtad 1 januari 2009. Arkiverad från originalet 16 februari 2009. (obestämd)
7. ↑ Cosimo Posth et al. Pleistocen mitokondriella genom tyder på en enda större spridning av icke-afrikaner och en senglacial befolkningsomsättning i Europa Arkiverad 14 april 2017 på Wayback Machine , 2016
8. ↑ Ett vanligt genetiskt ursprung för tidiga bönder från Medelhavets hjärt- och centraleuropeiska LBK-kulturer . Hämtad 5 september 2015. Arkiverad från originalet 5 september 2015. (obestämd)
9. ↑ Haplogrupp A. Tillträdesdatum: 1 januari 2009. Arkiverad från originalet 19 februari 2009. (obestämd)
10. ↑ Haplogrupp R* . Datum för åtkomst: 4 januari 2009. Arkiverad från originalet den 19 februari 2009. (obestämd)
11. ↑ Haplogrupp S. Datum för åtkomst: 1 januari 2009. Arkiverad från originalet den 24 juli 2011. (obestämd)
12. ↑ Haplogroup W. Tillträdesdatum: 1 januari 2009. Arkiverad från originalet 19 februari 2009. (obestämd)
13. ↑ Haplogrupp X. Tillträdesdatum: 1 januari 2009. Arkiverad från originalet 19 februari 2009. (obestämd)
14. ↑ Haplogrupp Y. Tillträdesdatum: 1 januari 2009. Arkiverad från originalet 19 februari 2009. (obestämd)
15. ↑ Miroslava Derenko, Boris Malyarchuk, Tomasz Grzybowski, Galina Denisova, Irina Dambueva, Maria Perkova, Choduraa Dorzhu, Faina Luzina, Hong Kyu Lee, Tomas Vanecek, Richard Villems, Ilia Zakharov . Fylogeografisk analys av mitokondrie-DNA i nordasiatiska populationer. // American Journal of Human Genetics, 2007 november; 81(5): 1025-1041.
16. ↑ Kay Prüfer et al. En genomsekvens från en modern mänsklig skalle över 45 000 år gammal från Zlatý kůň i Tjeckien Arkiverad 31 mars 2022 på Wayback Machine 7 april 2021
17. ↑ Jean-Jacques Hublin et al. Initial övre paleolitiska Homo sapiens från Bacho Kiro Cave, Bulgarien Arkiverad 19 juni 2020 på Wayback Machine 11 maj 2020
18. ↑ En tidigmodern människa från Rumänien med en ny neandertalförfader
19. ↑ Siska, Veronica (2019). "Kapitel 2: Palaeolithic Oase-genomet innebär diversifiering och utrotningshändelser över Eurasien" (PDF) . Människans befolkningshistoria och dess samspel med naturligt urval . University of Cambridge (avhandling). DOI : 10.17863/CAM.31536 . Arkiverad (PDF) från originalet 2020-09-25 . Hämtad 2020-05-01 . Utfasad parameter används |deadlink=( hjälp )( Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0) Arkiverad 16 oktober 2017 på Wayback Machine )
20. ↑ Andrew Bennett, Sandrine Prat, Stephane Pean, Laurent Crepin, Alexandr Yanevich, Simon Puaud, Thierry Grange, Eva-Maria Geigl . Ursprunget till Gravettianerna: genomiska bevis från en 36 000 år gammal östeuropeisk arkiverad 29 juni 2019 på Wayback Machine , 2019
21. ↑ Thibaut Deviese et al. Föreningsspecifik radiokoldatering och mitokondriell DNA-analys av Pleistocene hominin från Salkhit Mongolia Arkiverad 30 januari 2019 på Wayback Machine , 30 januari 2019
22. ↑ Iosif Lazaridis et al. Paleolitisk DNA från Kaukasus avslöjar kärnan av västeurasiska härkomst Arkiverad 22 september 2018 på Wayback Machine , 2018
23. ↑ Iosif Lazaridis et al. Den genetiska strukturen för världens första bönder, 2016. Arkiverad 16 juli 2018 på Wayback Machine
24. ↑ 1 2 Gülşah Merve Kılınç et al. Den demografiska utvecklingen av de första bönderna i Anatolien , 10 OKTOBER 2016
25. ↑ Haak, W. et al. (2015), Massiv migration från stäppen är en källa för indoeuropeiska språk i Europa
26. ↑ Stefania Vai et al. Ancestral mitokondriell N härstamning från det neolitiska "gröna" Sahara Arkiverad 6 mars 2019 på Wayback Machine , 5 mars 2019
27. ↑ Haak (2005) och andra, citerad i Dienekes (2005) i Externa länkar, People below
28. ↑ Éadaoin Harney et al. Forntida DNA från det kalkolitiska Israel avslöjar betydelsen av befolkningsblandning i kulturell transformation Arkiverad 20 augusti 2018 på Wayback Machine , 2018
29. ↑ Molekylära bevis på paleogeografiska härkomster av neolitiska proto-mongoler och deras kraniofaciala rekonstruktion . Hämtad 25 maj 2019. Arkiverad från originalet 10 augusti 2020. (obestämd)
30. ↑ På jakt efter Maikop-kulturens rötter (kommentar av Nedoluzhko) . Hämtad 19 juni 2022. Arkiverad från originalet 15 maj 2021. (obestämd)
31. ↑ Sokolov AS et al. Sex kompletta mitokondriella genom från människor från tidig bronsålder i norra Kaukasus Arkiverade 11 maj 2017 på Wayback Machine
32. ↑ Morten E. Allentoft et al. "Befolkningsgenomik i bronsålderns Eurasien" . Hämtad 12 juni 2015. Arkiverad från originalet 30 april 2016. (obestämd)
33. ↑ Sara Palomo-Díez et al. Ett oväntat fall i den iberiska halvöns förhistoria: Biogeografisk ursprungsanalys genom mitokondriellt DNA , 16 september 2017
34. ↑ Pilipenko A. S. et al. Paleogenetisk studie av förhållandet mellan de begravda från Sargat-kulturens gravkärror i Baraba-skogssteppen (västra Sibirien) Arkivexemplar av 22 december 2017 på Wayback Machine
35. ↑ Takashi Gakuhari et al. Jomons genom kastar ljus över östasiatisk befolkningshistoria Arkiverad 22 januari 2022 på Wayback Machine , 2019
36. ↑ Sena Jomon manliga och kvinnliga genomsekvenser från Funadomari-platsen i Hokkaido, Japan . Hämtad 1 juni 2019. Arkiverad från originalet 30 april 2021. (obestämd)
37. ↑ Chuan-Chao Wang et al. Genomiska insikter i bildandet av mänskliga populationer i Östasien Arkiverad 31 juli 2021 på Wayback Machine (kompletterande tabeller // Tabell 1. Nyligen rapporterade forntida individer), 2021
38. ↑ Eugenia Boulygina et al. Mitokondriell och Y-kromosommångfald av den förhistoriska Koban-kulturen i norra Kaukasus , 2020
39. ↑ Xiaoming Zhang et al. Ett matrilineärt genetiskt perspektiv på hängande kistanpassning i södra Kina och norra Thailand 24, 20 april
40. ↑ 1 2 Ioana Rusu, Alessandra Modi, Stefania Vai, Elena Pilli, Cristina Mircea, Claudia Radu, Claudia Urduzia, Zeno Karl Pinter, Vitalie Bodolica, Catalin Dobrinescu, Montserrat Hervella, Octavian Popescu, Martina Lari, David Kelemen, Beatrice . Moderns DNA-linjer vid porten till Europa på 1000-talet e.Kr. // PloS ONE. 2018. V. 13. Nr 3. e0193578
41. ↑ E. B. Yatsishina, E. S. Bulygina, S. V. Vasiliev, R. M. Galeev, N. V. Slobodova, S. V. Tsygankova, F. S. Sharko . Paleogenetisk studie av forntida mumier vid Kurchatov-institutet , 2020
42. ↑ EB Yatsishina, ES Bulygina, SV Vasilyev, RM Galeev, NV Slobodova, SV Tsygankova, FS Sharko . Paleogenetisk studie av antika mumier vid Kurchatov-institutet Arkiverad 3 augusti 2021 på Wayback Machine 22 mars 2021
43. ↑ Ashot Margaryan et al. Vikingavärldens befolkningsgenomik Arkiverad 12 februari 2020 på Wayback Machine 2019
44. ↑ Jiawei Li et al. Forntida genom avslöjar komplex genetisk historia för en internationell metropol i Kublai Khans övre huvudstad (Xanadu) , 14 juni 2022

Se även

Länkar

• N YFull MTree 1.02.00 (under konstruktion)
• Spridning av Haplogroup N , från National Geographic
• PhyloTree.org - mtDNA-träd Bygg 17 (18 februari 2016): underträd N