Ett slutet ekosystem är ett ekosystem som inte innebär något utbyte av materia med den yttre miljön.
Termen används oftast för att beskriva konstgjorda ekosystem i relativt liten skala. Sådana system är av vetenskapligt intresse och kan potentiellt fungera som livsuppehållande system under rymdflyg, på rymdstationer och i rymdbosättningar .
I slutna ekosystem måste allt avfall från en art bortskaffas av minst en annan art. Därför, om målet att upprätthålla mänskligt liv ska eftersträvas, måste allt mänskligt avfall så småningom omvandlas till syre , mat och vatten.
Ett slutet ekosystem måste innehålla minst en autotrof organism . Även om användningen av kemotrofer också har potential, är för närvarande nästan alla slutna ekosystem baserade på fototrofer, såsom grönalger .