Tarmmikrobiota - mikroorganismer som lever i mag-tarmkanalen i symbios med värden.
Den mänskliga tarmen innehåller i genomsnitt cirka 50 biljoner mikroorganismer, vilket är cirka 1,3 gånger fler än det totala antalet celler i kroppen [1] [2] . Bakterier utgör den stora majoriteten av mikrobiotan i ändtarmen [3] och upp till 60 % av torrvikten av avföring [4] . Någonstans mellan 300 [5] och 1000 [6] olika arter lever i tarmen, med de flesta uppskattningar runt 500 [7] [8] . Det är dock troligt att 99 % av bakterierna tillhör 30-40 arter [9] . Jäst är också en del av tarmens mikrobiota, men lite är känt om deras aktivitet.
Forskning visar att förhållandet mellan tarmen och mikrobiotan inte bara är en kommensalism (d.v.s. ofarlig samexistens), utan snarare en form av mutualism , d.v.s. ett ömsesidigt fördelaktigt förhållande [6] . Även om människor kan överleva utan tarmmikrobiotan [7] utför mikroorganismerna ett antal fördelaktiga funktioner för värden, såsom anaerob nedbrytning av oanvänt material för energi, träning av immunförsvaret och förhindrande av tillväxt av skadliga arter [4 ] . Tarmmikrobiotan är dock inte alltid exceptionellt fördelaktig: man tror att vissa mikroorganismer kan orsaka sjukdom i vissa fall. Det är också kapabelt att biotransformera läkemedel och påverka uttrycket av mänskliga gener som reglerar ämnesomsättningen , vilket orsakar oönskade biverkningar [10] .
Normalt förhindras överväxt av bakterier i tunntarmen av:
Bifido- och laktobaciller har en uttalad antagonistisk aktivitet mot patogena bakterier och reglerar den kvantitativa och kvalitativa sammansättningen av tarmmikrobiotan i normen, försenar tillväxten och reproduktionen av patogena och opportunistiska mikrober i den.
Intestinala saprofyter , jämfört med patogena bakterier, innehåller ett stort antal enzymer , förökar sig mer aktivt, så att de lättare utnyttjar näringsämnen och syre. De producerar en mängd olika bakteriedödande och bakteriostatiska ämnen, inklusive antibiotikaliknande.
| Bakterier som kan hittas i människans tarm [11] | |
| Bakterie | Förekomst (%) |
|---|---|
| Bacteroides fragilis | 100 |
| Bacteroides melaninogenicus | 100 |
| Bacteroides oralis | 100 |
| Enterococcus faecalis | 100 |
| Escherichia coli | 100 |
| Enterobacter sp. | 40-80 |
| Klebsiella sp. | 40-80 |
| Bifidobacterium bifidum | 30-70 |
| Staphylococcus aureus | 30-50 |
| Laktobacillus | 20-60 |
| Clostridium perfringens | 25-35 |
| Proteus mirabilis | 5-55 |
| Clostridium tetani | 1-35 |
| Clostridium septicum | 5-25 |
| Pseudomonas aeruginosa | 3-11 |
| Salmonella enterica | 3-7 |
| Faecalibacterium prausnitzii | ?ofta |
| Peptostreptococus sp. | ?ofta |
| Peptococcus sp. | ?ofta |
Typer av mikroorganismer i tarmen:
I magen, på grund av den sura miljön, är antalet mikrober obetydligt ( laktobaciller, streptokocker, sarciner ). Duodenum och proximala tunntarmen hos friska människor är sterila på grund av närvaron av aggressiva matsmältningsenzymer i dem. I den distala delen av tunntarmen i 1 ml av innehållet finns 10 7 −10 8 mikrober, i lika många aeroba som anaeroba. I 1 ml av innehållet i den distala tjocktarmen finns 10 9 −10 12 mikrober av cirka 400 arter. Den största tätheten av kontaminering observeras i ändtarmen. Den fekala mikrofaunan är faktiskt mikrofaunan i den distala tjocktarmen.
Normalt är mer än 95 % av den fekala mikrobiotan anaeroba: laktobaciller, bifidobakterier och bakterier. Den aeroba mikrobiotan representeras (genom frekvens av isolering och kvantitet) av Escherichia coli, Enterococcus. Mer sällan förekommer stafylokocker, streptokocker, Klebsiella, Proteus, clostridia och jästliknande svampar i små mängder.
Alla mikroorganismer som normalt lever i tjocktarmen delas in i tre grupper: