John Mistakon ( grekiska: Ἰωάννης ὀ Μυστάκων ) var en bysantinsk befälhavare under andra hälften av 600-talet.
Mystakon var av trakiskt ursprung. Smeknamnet Mistakon ("mustasch") fick John för sin långa mustasch. Han hade titeln patricier , ledde de bysantinska trupperna i Armenien 579. Efterträdde Mauritius som militärmästare i öst 582 när Mauritius kallades till Konstantinopel av kejsar Tiberius II , där han sedan övertog den kejserliga makten den 14 augusti samma år. Han förde utan framgång krig med perserna vid den östra gränsen, och därför avlägsnades han 584 från sin post och ersattes av kejsaren Philippicus svärson .
År 585 kämpade John Mistakon mot avarerna , som nådde huvudstadens väggar i ett rovdjursanfall och lyckades driva bort dem. År 590 befäste John belägringen av staden Dvin i den persiska delen av Armenien, men den förändrade politiska situationen tvingade honom att häva belägringen och dra tillbaka sina trupper från Iran. Efter det, på order av kejsaren Mauritius, deltog Johannes i bysantinernas krig på den legitima iranska Shah Khosrow II :s sida mot den rebelliske persiske befälhavaren Bahram . I slaget vid Balaratfloden, en biflod till Tigris, år 591, besegrade John Mistakons och befälhavaren Narses kombinerade bysantinska arméer, i allians med de persiska trupperna från Khosrow II, Bahrams armé i en envis strid.