Orientering är orienteringen av en enkelsträngad struktur i en nukleinsyramolekyl [ 1] .
Namnet på kolatomer i nukleotider (baserat på numreringen av kolatomer i pentossockermolekylen) ger upphov till två ändar - 5' och 3' (uttalas som femtakts och tretakts , engelska femtaktsände, tretaktsändar slut ).
De relativa positionerna för strukturella analoger av nukleinsyrakedjor, gener , transkriptionsfaktorer , polymeraser , benämns vanligtvis enligt positionen mot eller bort från 5'- respektive 3'-ändarna. Syntes av nukleinsyror är möjlig in vivo endast i riktningen från 5' till 3', eftersom DNA- och RNA-polymeraser fäster nya nukleotidrester endast till 3'- hydroxylgruppen (-OH) med hjälp av en fosfodiesterbindning . Vanligtvis utförs registreringen av DNA- och RNA- nukleotidsekvenser i riktningen från 5' till 3' [2] .