Platsspecifik rekombination

Platsspecifik rekombination  är en typ av genetisk rekombination där, under utbytet av DNA-strängar , en reaktion sker mellan specifika platser [1] [2] [3] . Byte av DNA-segment sker genom att man känner igen och länkar korta DNA-sekvenser (ställen), där speciella enzymer klyver, omarrangerar och återansluter DNA-strängar. För vissa rekombinationssystem är endast rekombinasenzymet tillräckligt, medan andra kräver närvaron av ytterligare faktorer. I naturen sker platsspecifik rekombination när ett virus integreras i genomet (bildning av ett provirus ).

Platsspecifika rekombinationssystem är mycket specifika, snabba och effektiva även när man arbetar med komplexa eukaryota genom [4] och av denna anledning används de i stor utsträckning inom genteknik [5] De är involverade i många cellulära processer, inklusive bakteriell genomreplikation, patogenes, rörelse av mobila genetiska element och bildning av antikroppar i lymfoidceller från däggdjur .

Rekombinationsställen är vanligtvis 30 till 200 nukleotider långa och består av två inverterade upprepningar till vilka rekombinaset binder, mellan vilka den sekvens vid vilken rekombination sker är lokaliserad. Båda platserna där rekombination sker är vanligtvis identiska, men det finns undantag (till exempel integrationsställen för fagen λ attP och attB , se lambda fag ) [6] .

Se även

Anteckningar

  1. Bode, J; Schlake, T; asadasasada Iber, M; Schuebeler, D; Seibler, J; Snezhkov, E; Nikolaev, L. Transgenetikerns verktygslåda: nya metoder för riktad modifiering av eukaryota genom   // Biol . Chem. : journal. - 2000. - Vol. 381 , nr. 9-10 . - P. 801-813 . - doi : 10.1515/BC.2000.103 . — PMID 11076013 .
  2. Kolb, A. F. Genome Engineering Using Site-Specific Recombinases  //  Cloning & Stem Cells: journal. - 2002. - Vol. 4 , nr. 1 . - S. 65-80 . - doi : 10.1089/153623002753632066 . — PMID 12006158 .
  3. Coates, CJ; Kaminski, JM; Summers, JB; Segal, DJ; Miller, AD; Kolb, AF Platsstyrd genommodifiering: derivat av DNA-modifierande enzymer som målverktyg  //  Trends in Biotechnology : journal. - Cell Press , 2005. - Vol. 23 , nr. 8 . - s. 407-419 . - doi : 10.1016/j.tibtech.2005.06.009 . — PMID 15993503 . Arkiverad från originalet den 29 augusti 2006.
  4. Sauer, B. Inducerbar geninriktning i möss som använder Cre/loxSystem  //  Metoder: journal. - 1998. - Vol. 14 , nr. 4 . - s. 381-392 . - doi : 10.1006/meth.1998.0593 . — PMID 9608509 . Arkiverad från originalet den 11 juni 2011.
  5. Akopian, A.; Stark, WM Platsspecifika DNA-rekombinaser som instrument för genomisk kirurgi  (engelska)  // Advances in Genetics: journal. - 2005. - Vol. Framsteg inom genetik . - S. 1-23 . — ISBN 978-0-12-017655-7 . - doi : 10.1016/S0065-2660(05)55001-6 .
  6. Landy A. Dynamiska, strukturella och regulatoriska aspekter av lambda platsspecifik rekombination   // Årlig översyn av biokemi : journal. - 1989. - Vol. 58 , nr. 1 . - P. 913-941 . doi : 10.1146 / annurev.bi.58.070189.004405 . — PMID 2528323 .