Listan över flygbolag i Malta är en lista över flygbolag som innehar ett giltigt flygoperatörscertifikat utfärdat av Malta Civil Aviation
| namn | Flygzon | Flygtyp | Start av flyg | Slut på flyg | Bild | IATA | ICAO | anropssignal |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Air Atlanta Europe | internationell | charter | 2002 | - | CT | AAE | EUROVIKING | |
| Air CM Global | internationell | privat | 2015 | - | - | - | RJR | MELITA |
| Air Horizont | internationell | charter | 2014 | - | HT | HATT | SKY RUNNER | |
| Air Malta | internationell | - | 1974 | - | KM | AMC | AIR MALTA | |
| AIR X Charter | internationell | charter | 2010 | - | - | - | AXY | LEGEND |
| Airhub Airlines | internationell | leasing | 2021 | - | - | AH | GJM | AIRHUB |
| Avion Express Malta | internationell | leasing | 2018 | - | - | X8 | MLH | SYD VIND |
| Blue Square Aviation Group Malta | internationell | privat | 2021 | - | - | - | BSG | - |
| Comlux Malta | internationell | privat | 2021 | - | - | MLM | LUXMALTA | |
| Corendon Airlines Europe | internationell | - | 2018 | - | XR | CXI | TURISTISKA | |
| DC Aviation Malta | internationell | privat | 2018 | - | - | - | DCW | MALTA STJÄRNAN |
| Elitavia Malta | internationell | frakt | 2021 | - | - | MA | EAU | ELIT |
| Freebird Airlines Europe | internationell | - | 2019 | - | - | - | FHM | EUROBIRD |
| Galistair Malta | internationell | charter | 2020 | - | - | GH | GTR | GALISTAIR |
| Hej Fly Malta | internationell | charter | 2013 | - | 3L | HFM | MOONRAKER | |
| Hyperion Aviation | internationell | privat | 2014 | - | - | HYP | HYPERION | |
| Jet Aviation Flight Sirvices (Malta) | internationell | privat | 2017 | - | - | - | JML | - |
| JetMagic | internationell | privat | 2013 | - | - | - | JMK | JETMAGI |
| Lauda Europa | internationell | - | 2020 | - | - | LW | LDA | BEAUFORT |
| Luxwing | internationell | leasing | 2021 | - | - | BN | .lwg | |
| Maleth Aero | internationell | charter | 2013 | - | - | - | MLT | MALETH |
| Malta Air | internationell | leasing | 2019 | - | AL | MAJ | BLÅ MED | |
| Malta MedAir | internationell | leasing | 2022 | - | - | MT | MMO | MALIT |
| Medavia | internationell | privat | 2008 | - | - | - | MDM | MEDAVIA |
| Mel Air | internationell | leasing | 2021 | - | - | - | MDO | KUDA |
| SmartLynx Malta | internationell | leasing | 2020 | - | - | 2N | LYX | MALTA KATTEN |
| Titan Airways Malta | internationell | frakt | 2021 | - | - | TM | TMT | KAPOW |
| Vistajet | internationell | privat | 2015 | - | - | - | VJT | VISTA JET |