Tupanvirus

Tupanvirus
vetenskaplig klassificering
Grupp:Virus [1]Rike:VaridnaviriaRike:BamfordviraeSorts:NucleocytoviricotaKlass:MegaviricetesOrdning:ImiterviralesFamilj:MimiviridaeSläkte:Tupanvirus
Internationellt vetenskapligt namn
Tupanvirus
Typer
  • Tupanvirus Soda Lake
  • Tupanvirus Deep Ocean

Tupanvirus  (lat.)  är ett släkte av DNA-innehållande virus från familjen Mimiviridae . Representanter för släktet är bland de största kända virusen [2] . Släktet beskrevs i februari 2018 av en brasiliansk - fransk grupp mikrobiologer . Inkluderar två vyer [3] [4] . Från och med mars 2020 är släktet inte registrerat hos International Committee on Taxonomy of Viruses [5] .

Titel

Det generiska namnet ges för att hedra Tupan, åskguden bland guaraniindianerna [2] .

Virionets struktur

Virion når en längd av 1,2 mikron (på grund av variationer i längden på svansen hittas virioner upp till 2,3 mikron långa), och kapsiden är liknande i storlek (~450 nm ) och struktur som Mimivirus- kapsiden . Tupanvirus virion  är den största viruspartikel som har beskrivits hittills. Tupanvirus har en cylindrisk svans med en diameter på ~550 × 450 nm , som är fäst vid basen av kapsiden - detta virus är den mest "långsvansade" medlemmen av Mimiviridae- familjen . Det visas dock att det inte finns någon stel koppling mellan svansen och kapsiden. Under kapsiden finns ett lipidmembran , som smälter samman med fagosommembranet när cellen infekteras och släpper ut kapsidens innehåll i cytoplasman . Innehållet i svansen frigörs efter att fagosommembranet sticker ut i svansen [4] .

Genom

Genomet representeras av ett linjärt dubbelsträngat DNA innehållande 1,44-1,51 miljoner baspar som kodar för 1276-1425- proteiner . Detta är mer än vissa bakterier [2] . Tupanvirusgenomet kodar för den största översättningsapparaten bland virus . Det inkluderar 70 tRNA (inklusive en art har tRNA för den sällsynta aminosyran pyrrolysin ), 20 aminoacyl-tRNA-syntetaser , 11 translationsfaktorer och proteiner som är nödvändiga för tRNA- och mRNA -mognad , samt modifiering av ribosomala proteiner. Dessutom innehåller Tupanvirusgenomet och uttrycker aktivt två sekvenser som liknar introner i 18S rRNA- generna . Således, för den kompletta uppsättningen som krävs för translation, saknar Tupanvirus endast ribosomer [4] .

Livscykel

Till skillnad från de flesta jättevirus , reproducerar Tupanvirus framgångsrikt i två amöbaarter : Acanthamoeba castellanii och Vermamoeba vermiformis . Viruset kommer in i cellen, fäster vid dess membran och kommer in i cellen under fagocytos (1 timme efter infektion). Membranet under kapsiden smälter samman med fagosommembranet, och virusgenomet kommer in i cytoplasman (2-6 timmar efter infektion). Efter detta bildas en virusfabrik där nya viruspartiklar sätts ihop, med svansen fäst vid kapsiden efter att den är färdigbildad (7-12 timmar efter infektion). 16-24 timmar efter infektion är amöbans cytoplasma helt fylld med viruspartiklar, och efter cellys kommer de in i den yttre miljön. Cytotoxicitet av Tupanvirus uttrycks i undertryckande av rRNA-uttryck och progressiv förstörelse av värdcellskärnan [ 4] .

Evolution

Sekvensanalys har visat att Tupanvirus  är en systergrupp av mimivirus inom familjen Mimiviridae. Det är troligt att förfäderna till dessa virus inte var särskilt specialiserade och infekterade en mängd olika protister . Ur denna synvinkel var förfäderna till Tupanvirus (och möjligen mimivirus) jättevirus som genomgick reduktiv evolution , under vilken de dock förvärvade några gener. Reduktiv evolution är karakteristisk för många obligatoriska intracellulära parasiter . Som regel förlorar de gener förknippade med att få energi , eftersom alla deras energibehov tillgodoses av värdcellen. Ett alternativt scenario är också möjligt, enligt vilket Tupanvirusets förfader var ett relativt enkelt virus, som fick många nya gener under evolutionen [4] .

Art

Anteckningar

  1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
  2. ↑ 1 2 3 Forskare kan känna igen virus som levande varelser
  3. ↑ Garisto, Dan Dessa jättevirus har mer proteintillverkningsutrustning än något känt virus (27 februari 2018). Hämtad 11 maj 2018. Arkiverad från originalet 1 juli 2018.
  4. ↑ 1 2 3 4 5 6 Abrahão Jônatas , Silva Lorena , Silva Ludmila Santos , Khalil Jacques Yaacoub Bou , Rodrigues Rodrigo , Arantes Thalita , Assis Felipe , Boratto Paulo , Andrade Miguel , Kroon . , Colson Philippe , Levasseur Anthony , Kroemer Guido , Raoult Didier , La Scola Bernard. Tailed jätte Tupanvirus besitter den mest kompletta translationsapparaten av den kända virosfären  //  Nature Communications. - 2018. - 27 februari ( vol. 9 , nr 1 ). — ISSN 2041-1723 . - doi : 10.1038/s41467-018-03168-1 .
  5. ↑ Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Tillgänglig: 23 april 2020) .