Translationstöjningsfaktorer

Translationsförlängningsfaktorer (EF, förlängningsfaktor) är proteiner som främjar peptidsyntes i ribosomen vid stadiet av translationsförlängning . Förlängningsfaktorer säkerställer kontinuerlig proteinpolymerisation , från det ögonblick då initiator -tRNA :t går in i ribosomens P-ställe. Eukaryotiska , eubakteriska och arkeala förlängningsfaktorer har den högsta graden av likhet jämfört med translationsinitiering och translationstermineringsfaktorer [1] [2] . Förlängningsfaktorer i prokaryoter inkluderar EF-Tu , EF-Ts , EF-G , EF-P [3] . Mitokondrier och plastider av eukaryoter har sin egen uppsättning förlängningsfaktorer som liknar bakteriernas [4] [5] .

Nomenklatur för homologa förlängningsfaktorer

Archaeal Bakteriell eukaryot Funktioner
Cytoplasmatisk Mitokondrie
aEF1A EF Tu eEF1A mtEFTu Det förmedlar inträdet av laddat aminoacyl-tRNA till det fria A-stället i ribosomen [6]
aEF1B EF-Ts eEF1B mtEFTs Fungerar som en guanylnukleotidbytesfaktor för EF-Tu, som katalyserar frisättningen av BNP från EF-Tu [2]
aEF2 EF-G eEF2 mtEFG1 Katalyserar translokationen av peptidyl-tRNA och mRNA i slutet av varje cykel av peptidförlängning, medan betydande konformationsförändringar i ribosomen inträffar [7]
aIF5A* EF-P eIF5A* - Stimulerar bildandet av en peptidbindning och återupptar translation efter ett påtvingat stopp av ribosomen i mRNA-regioner som kodar för två eller flera proliner i sekvens [8] [9] .
* — Det bör noteras att den eukaryota faktorn eIF5A och den arkeala faktorn aIF5A, som är homologer till bakteriefaktorn EF-P, gavs namn som initieringsfaktorer, men dessa proteiner är nu igenkända som förlängningsfaktorer [8]

Anteckningar

  1. ↑ Nukleinsyror: från A till Ö / B. Appel [et al.]. - M. : Binom: Kunskapslaboratoriet, 2013. - 413 sid. - 700 exemplar.  - ISBN 978-5-9963-0376-2 .
  2. ↑ 1 2 Sasikumar, Arjun N.; Perez, Winder B.; Kinzy, Terri Goss (juli 2012). "De många rollerna för det eukaryota förlängningsfaktor 1-komplexet" . Wiley tvärvetenskapliga recensioner. RNA . 3 (4): 543-555. DOI : 10.1002/wrna.1118 . ISSN  1757-7004 . PMC  3374885 . PMID22555874  . _
  3. ↑ Parker, J. (2001), Elongation Factors; Översättning , Encyclopedia of Genetics , s. 610–611, ISBN 9780122270802 , DOI 10.1006/rwgn.2001.0402 . 
  4. ↑ Manuell, Andrea L; Quispe, Joel; Mayfield, Stephen P; Petsko, Gregory A (7 augusti 2007). "Structure of the Chloroplast Ribosome: Novel Domains for Translation Regulation" . PLoS Biologi . 5 (8): e209. doi : 10.1371/journal.pbio.0050209 . PMC  1939882 . PMID  17683199 .
  5. ↑ G.C. Atkinson; S. L. Baldauf (2011). "Evolution av förlängningsfaktor G och ursprunget till mitokondriella och kloroplastformer" . Molekylärbiologi och evolution . 28 (3): 1281-92. doi : 10.1093/molbev/ msq316 . PMID 21097998 . 
  6. ↑ Weijland A, Harmark K, Cool RH, Anborgh PH, Parmeggiani A (mars 1992). "Töjningsfaktor Tu: en molekylär omkoppling i proteinbiosyntes" . Molekylär mikrobiologi . 6 (6): 683-8. DOI : 10.1111/j.1365-2958.1992.tb01516.x . PMID  1573997 .
  7. ↑ Jørgensen, R; Ortiz, P.A.; Carr-Schmid, A; Nissen, P; Kinzy, T.G.; Andersen, G.R. (maj 2003). "Två kristallstrukturer visar stora konformationsförändringar i det eukaryota ribosomala translokaset." Naturens strukturbiologi . 10 (5): 379-85. doi : 10.1038/ nsb923 . PMID 12692531 . 
  8. ↑ 12 Rossi , D; Kuroshu, R; Zanelli, C.F.; Valentini, S.R. (2013). "eIF5A och EF-P: två unika översättningsfaktorer går nu samma väg". Wiley tvärvetenskapliga recensioner. RNA . 5 (2): 209-22. DOI : 10.1002/wrna.1211 . PMID  24402910 .
  9. ↑ Doerfel LK et al. EF-P är avgörande för snabb syntes av proteiner som innehåller på varandra följande prolinrester   // Vetenskap . - 2013. - Vol. 339 , nr. 6115 . - S. 85-88 . - doi : 10.1126/science.1229017 .