Cytoglobin

cytoglobin

PDB är ritad baserat på 1umo.

Tillgängliga strukturer

Ortologisk sökning: PDBe , RCSB

Lista över PDB-ID
1UMO , 1URV , 1URY , 1UT0 , 1UX9 , 1V5H , 2DC3 , 3AG0 , 4B3W

Identifierare

Symbol

CYGB ; HGB; STAP

Externa ID:n

OMIM: 608759 MGI : 2149481 HomoloGene : 12706 GeneCards : CYGB Gene

Genontologi
Fungera	• peroxidasaktivitet • syretransportöraktivitet • järnjonbindning • syrebindning • hembindning
cellkomponent	• cytoplasma • neuronprojektion • neuronal cellkropp
biologisk process	• svar på oxidativ stress • syretransport • oxidations-reduktionsprocess
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 17:
74,52 – 74,55 Mb

Chr 11:
116,65 – 116,65 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

Cytoglobin är en produkt av CYGB -genen , som finns hos människor och andra däggdjur [1] .

Cytoglobin är ett globinprotein som uttrycks i alla vävnader och ackumuleras särskilt kraftigt i marina däggdjur . Det tros skydda dem från hypoxi . En av de troliga funktionerna hos cytoglobin är att transportera syre från artärblodet till hjärnan [2] .

Applikation

Uttryck av CYGB-genen kan användas som en specifik markör för separation av hepatiska stellatceller från portalmyofibroblaster av skadad mänsklig lever [3] .

Anteckningar

↑ Entrez-gen: CYGB-cytoglobin . (obestämd)
↑ Varför dykande marina däggdjur motstår hjärnskador från låg syrehalt . (obestämd)
↑ Motoyama H., Komiya T., Thuy le TT, Tamori A., Enomoto M., Morikawa H., Iwai S., Uchida-Kobayashi S., Fujii H., Hagihara A., Kawamura E., Murakami Y. , Yoshizato K., Kawada N. Cytoglobin uttrycks i hepatiska stellatceller, men inte i myofibroblaster, i normal och fibrotisk mänsklig lever (engelska) // Lab. Investera. : journal. - 2014. - Vol. 94 , nr. 2 . - S. 192-207 . - doi : 10.1038/labinvest.2013.135 . — PMID 24296877 .

Ytterligare läsning

Kawada N., Kristensen DB, Asahina K., et al. Karakterisering av ett aktiveringsassocierat protein av stellatceller (STAP) med peroxidasaktivitet som finns i leverstjärnceller från råtta. (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 2001. - Vol. 276 , nr. 27 . - P. 25318-25323 . - doi : 10.1074/jbc.M102630200 . — PMID 11320098 .
Trent JT, Hargrove MS Ett allmänt uttryckt humant hexakoordinat hemoglobin. (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 22 . - P. 19538-19545 . - doi : 10.1074/jbc.M201934200 . — PMID 11893755 .
Burmester T., Ebner B., Weich B., Hankeln T. Cytoglobin: en ny globintyp som uttrycks överallt i ryggradsdjursvävnader. (engelska) // Molecular Biology and Evolution : journal. - Oxford University Press , 2002. - Vol. 19 , nr. 4 . - s. 416-421 . - doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a004096 . — PMID 11919282 .
Asahina K., Kawada N., Kristensen DB, et al. Karakterisering av aktiveringsassocierat protein från mänskliga stellatceller och dess uttryck i mänsklig lever. (engelska) // Biochim. Biophys. Acta : journal. - 2002. - Vol. 1577 , nr. 3 . - s. 471-475 . - doi : 10.1016/s0167-4781(02)00477-3 . — PMID 12359339 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds cDNA-sekvenser för människor och mus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Sawai H., Kawada N., Yoshizato K., et al. Karakterisering av hemmiljöstrukturen hos cytoglobin, ett fjärde globin hos människor (engelska) // Biochemistry: journal. - 2003. - Vol. 42 , nr. 17 . - P. 5133-5142 . - doi : 10.1021/bi027067e . — PMID 12718557 .
Geuens E., Brouns I., Flamez D., et al. En globin i kärnan! (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 33 . - P. 30417-30420 . - doi : 10.1074/jbc.C300203200 . — PMID 12796507 .
Hamdane D., Kiger L., Dewilde S., et al. Redoxtillståndet i cellen reglerar ligandbindningsaffiniteten för humant neuroglobin och cytoglobin (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 2004. - Vol. 278 , nr. 51 . - P. 51713-51721 . - doi : 10.1074/jbc.M309396200 . — PMID 14530264 .
Schmidt M., Gerlach F., Avivi A., et al. Cytoglobin är ett respiratoriskt protein i bindväv och neuroner, som uppregleras av hypoxi // J. Biol. Chem. : journal. - 2004. - Vol. 279 , nr. 9 . - P. 8063-8069 . - doi : 10.1074/jbc.M310540200 . — PMID 14660570 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 fullängds humana cDNA // Nat . Genet. : journal. - 2004. - Vol. 36 , nr. 1 . - S. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Hünermund G., Schirmacher A., Ringelstein B., et al. Genomisk organisation och mutationsanalys av tre kandidatgener för ärftlig neuralgisk amyotrofi // Muscle Nerve : journal. - 2004. - Vol. 29 , nr. 4 . - s. 601-604 . - doi : 10.1002/mus.20009 . — PMID 15052627 .
de Sanctis D., Dewilde S., Pesce A., et al. Kristallstruktur av cytoglobin: den fjärde globintypen som upptäckts hos människan uppvisar hem hexa-koordination // J. Mol. Biol. : journal. - 2004. - Vol. 336 , nr. 4 . - P. 917-927 . - doi : 10.1016/j.jmb.2003.12.063 . — PMID 15095869 .
Sugimoto H., Makino M., Sawai H., et al. Strukturell grund för humant cytoglobin för ligandbindning (engelska) // J. Mol. Biol. : journal. - 2004. - Vol. 339 , nr. 4 . - s. 873-885 . - doi : 10.1016/j.jmb.2004.04.024 . — PMID 15165856 .
Fago A., Hundahl C., Dewilde S., et al. Allosterisk reglering och temperaturberoende av syrebindning i humant neuroglobin och cytoglobin. Molekylära mekanismer och fysiologisk betydelse (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 2004. - Vol. 279 , nr. 43 . - P. 44417-44426 . - doi : 10.1074/jbc.M407126200 . — PMID 15299006 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Statusen, kvaliteten och expansionen av NIHs fullängds cDNA-projekt: The Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genome Res. : journal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Hamdane D., Kiger L., Dewilde S., et al. Hypertermisk stabilitet av neuroglobin och cytoglobin (engelska) // FEBS J. : journal. - 2005. - Vol. 272 , nr. 8 . - P. 2076-2084 . - doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.04635.x . — PMID 15819897 .
Sawai H., Makino M., Mizutani Y., et al. Strukturell karakterisering av den proximala och distala histidinmiljön av cytoglobin och neuroglobin (engelska) // Biochemistry : journal. - 2006. - Vol. 44 , nr. 40 . - P. 13257-13265 . - doi : 10.1021/bi050997o . — PMID 16201751 .
Shaw RJ, Liloglou T., Rogers SN, et al. Promotormetylering av P16, RARβ, E-cadherin, cyklin A1 och cytoglobin vid oral cancer: kvantitativ utvärdering med användning av pyrosekvensering // Br . J. Cancer : journal. - 2006. - Vol. 94 , nr. 4 . - s. 561-568 . - doi : 10.1038/sj.bjc.6602972 . — PMID 16449996 .
McRonald FE, Liloglou T., Xinarianos G., et al. Nedreglering av cytoglobingenen, lokaliserad på 17q25, i tylos med esofaguscancer (TOC): bevis för trans-allelrepression // Human Molecular Genetics : journal. - Oxford University Press , 2006. - Vol. 15 , nr. 8 . - P. 1271-1277 . - doi : 10.1093/hmg/ddl042 . — PMID 16510494 .
Xinarianos G., McRonald FE, Risk JM, et al. Frekventa genetiska och epigenetiska avvikelser bidrar till avregleringen av cytoglobin vid icke-småcellig lungcancer // Human Molecular Genetics : journal. - Oxford University Press , 2006. - Vol. 15 , nr. 13 . - P. 2038-2044 . doi : 10.1093 / hmg/ddl128 . — PMID 16698880 .

Externa länkar

MeSH cytoglobin