Endonukleaser är proteiner från gruppen nukleaser som klyver fosfodiesterbindningar i mitten av polynukleotidkedjan . Restriktionsendonukleaser , eller restriktionsendonukleaser , klyver DNA på specifika platser (kallade restriktionsställen), de klassificeras i tre typer (I, II och III) baserat på deras verkningsmekanism. Dessa proteiner används ofta i genteknik för att skapa rekombinant DNA, som sedan introduceras i bakterie-, växt- eller djurceller.
Som ett resultat av den enzymatiska nedbrytningen av endonukleaser sker fullständig upplösning av kromatin i de karyolytiska kärnorna.
Nicase ( notching endonuclease ) är ett enzym som skär endast en sträng av dubbelsträngat DNA vid vissa nukleotidsekvenser (igenkänningsställen) som kallas restriktionsstället . Resultatet är hackat snarare än klippt DNA. Nicases, tillsammans med DNA-polymeras 1 , används för att ersätta några av nukleotiderna i DNA-sekvensen med deras analoger märkta med en fluorescerande eller radioaktiv märkning , vilket sedan gör att detta DNA kan användas som en sond för fluorescerande in situ hybridisering , blotting , och ett antal andra molekylärbiologiska metoder.