1000 genom

1000 Genomes  är ett internationellt projekt som, tillkännagav i januari 2008, planerade att sekvensera genomen från cirka 2 500 individer i slutet av 2011 för att skapa en detaljerad katalog över mänsklig genetisk variation, inklusive enstaka nukleotidpolymorfismer , indelar och strukturella variationer som [1] . Detta skulle vara den överlägset mest omfattande studien av mänskliga genom hittills. För att genomföra detta projekt arbetade institutioner från många länder tillsammans, inklusive de i USA, England, Folkrepubliken Kina och Tyskland. Den fullständiga databasen tillhandahålls gratis till forskare över hela världen och är en berikning för alla områden inom naturvetenskapen [2] .

I juni 2008 anslöt sig tre företag som var involverade i utvecklingen av nya sekvenseringsteknologier i projektet [3] .

I december 2008 publicerades de första preliminära uppgifterna om fyra personer som en del av ett pilotprojekt [1] . I oktober 2010 följde publiceringen av data om sekvenserna av de fullständiga genomen av 185 individer som en del av slutförandet av pilotprojektet för 1000 Genomes-projektet [4] . Dessutom publicerades en bioinformatisk analys av genomstrukturella varianter (SV)—inklusive kopienummervariationer (engelska CNVs)—av analysgruppen 1000 Genomes Project SV i februari 2011 [5] .

I oktober 2012 tillkännagavs att målet hade uppnåtts och genetiska data från över 1 000 personer hade lästs och publicerats [6] .

Anteckningar

  1. 1 2 1000 genom | En djup katalog över mänsklig genetisk variation . Hämtad 18 april 2020. Arkiverad från originalet 19 oktober 2014.
  2. G. Spencer: Internationellt konsortium tillkännager 1000 genomprojektet. National Human Genome Research Institute (NHGRI), 22 januari 2008. (Webbplats) Arkiverad 13 juli 2016 på Wayback Machine
  3. Geoff Spencer: [1] Arkiverad 4 mars 2016 på Wayback Machine
  4. 1000 Genomes Project Consortium (2010). En karta över mänskligt genoms variation från sekvensering i populationsskala . I: Nature . bd. 467, S. 1061-1073. PMID 20981092
  5. Mills, RE et al. (2011). Kartläggning av kopienummervariation genom genomsekvensering i populationsskala. I: Nature . bd. 470, S. 59-65. PMID 21293372
  6. Erbgut veröffentlicht. 1.000-Genom-Projekt hat Ziel erreicht: Arkiverad {{{2}}}.

Länkar