ARL6

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 1 juli 2019; kontroller kräver 2 redigeringar .

ADP-ribosylerande faktoriell 6

PDB -rendering baserad på 2h57.

Tillgängliga strukturer

PDB

Ortologisk sökning: PDBe , RCSB

Lista över PDB-ID
2H57

Identifierare

Symbol

ARL6 ; BBS3; RP55

Externa ID:n

OMIM: 608845 MGI : 1927136 HomoloGene : 12960 GeneCards : ARL6 Gene

Genontologi
Fungera	• proteinbindning • GTP-bindning • fosfolipidbindning • metalljonbindning
cellkomponent	• cytoplasma • axonemal mikrotubuli • axoneme • membran • membrankappa • BBSome • ciliärmembran • extracellulär vesikulär exosom
biologisk process	• proteininriktning mot membran • liten GTPas-medierad signaltransduktion • bestämning av vänster/höger symmetri • visuell perception • Wnt-signalväg • melanosomtransport • ciliumsammansättning • fettcellsdifferentiering • proteinpolymerisation
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 3:
97,48 – 97,52 Mb

Chr 16:
59,61 – 59,64 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

ADP-ribosylerande faktorprotein 6 är ett protein som kodas hos människor av ARL6 -genen [1] [2] [3] .

Proteinet som kodas av denna gen tillhör ARF-familjen av GTP- bindande proteiner. ARF-proteiner är viktiga regulatorer av cellulär transport och exemplariska medlemmar av en ständigt växande familj av homologa proteiner och genomiska sekvenser. De skiljer sig från andra små GTP-bindande proteiner i närvaro av en unik strukturell enhet som implementerar ömsesidig kommunikation mellan N- terminalen och nukleotidbindningsstället . Studier av den murina ortologen av detta protein tyder på involvering i proteintransport, intracellulär vesikeltransport eller cellsignalering under hematopoetisk mognad. Det finns alternativ splitsning vid detta ställe och två varianter av transkript som kodar för detta protein har beskrivits [3] .

Anteckningar

↑ Chiang AP, Nishimura D., Searby C., Elbedour K., Carmi R., Ferguson AL, Secrist J., Braun T., Casavant T., Stone EM, Sheffield VC Jämförande genomisk analys identifierar en ADP-ribosyleringsfaktor- liknande gen som orsak till Bardet-Biedls syndrom (BBS3 ) // Am J Hum Genet : journal. - 2004. - Juli ( vol. 75 , nr 3 ). - s. 475-484 . - doi : 10.1086/423903 . — PMID 15258860 .
↑ Fan Y., Esmail MA, Ansley SJ, Blacque OE, Boroevich K., Ross AJ, Moore SJ, Badano JL, May-Simera H., Compton DS, Green JS, Lewis RA, van Haelst MM, Parfrey PS, Baillie DL, Beales PL, Katsanis N., Davidson WS, Leroux MR Mutationer i en medlem av Ras-superfamiljen av små GTP-bindande proteiner orsakar Bardet-Biedls syndrom (engelska) // Nat Genet : journal. - 2004. - September ( vol. 36 , nr 9 ). - P. 989-993 . - doi : 10.1038/ng1414 . — PMID 15314642 .
↑ 1 2 Entrez-gen: ARL6 ADP-ribosylation factor-like 6 . Arkiverad från originalet den 5 december 2010. (obestämd)

Litteratur

Sheffield VC, Carmi R., Kwitek-Black A., et al. Identifiering av ett Bardet-Biedls syndromlokus på kromosom 3 och utvärdering av en effektiv metod för kartläggning av homozygositet // Human Molecular Genetics : journal. - Oxford University Press , 1995. - Vol. 3 , nr. 8 . - P. 1331-1335 . - doi : 10.1093/hmg/3.8.1331 . — PMID 7987310 .
Bonaldo MF, Lennon G., Soares MB Normalisering och subtraktion: två tillvägagångssätt för att underlätta genupptäckt // Genome Res . : journal. - 1997. - Vol. 6 , nr. 9 . - s. 791-806 . - doi : 10.1101/gr.6.9.791 . — PMID 8889548 .
Jacobs S., Schilf C., Fliegert F., et al. ADP-ribosyleringsfaktor (ARF)-liknande 4, 6 och 7 representerar en undergrupp av ARF-familjens karaktärisering genom snabbt nukleotidutbyte och en nukleär lokaliseringssignal // FEBS Lett . : journal. - 1999. - Vol. 456 , nr. 3 . - s. 384-388 . - doi : 10.1016/S0014-5793(99)00759-0 . — PMID 10462049 .
Ingley E., Williams JH, Walker CE, et al. En ny ADP-ribosyleringsliknande faktor (ARL-6), interagerar med den proteinledande kanalen SEC61beta-subenheten // FEBS Lett . : journal. - 1999. - Vol. 459 , nr. 1 . - S. 69-74 . - doi : 10.1016/S0014-5793(99)01188-6 . — PMID 10508919 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA DNA-kloning med användning av in vitro platsspecifik rekombination // Genome Res . : journal. - 2001. - Vol. 10 , nej. 11 . - P. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Wiemann S., Weil B., Wellenreuther R., et al. Mot en katalog över mänskliga gener och proteiner: sekvensering och analys av 500 nya kompletta proteinkodande humana cDNAs // Genome Res . : journal. - 2001. - Vol. 11 , nr. 3 . - s. 422-435 . - doi : 10.1101/gr.GR1547R . — PMID 11230166 .
Pasqualato S., Renault L., Cherfils J. Arf-, Arl-, Arp- och Sar-proteiner: en familj av GTP-bindande proteiner med en strukturell anordning för 'front-back'-kommunikation // EMBO Rep . : journal. - 2003. - Vol. 3 , nr. 11 . - P. 1035-1041 . - doi : 10.1093/embo-reports/kvf221 . — PMID 12429613 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds cDNA-sekvenser för människor och mus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genome Res. : journal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Wiemann S., Arlt D., Huber W., et al. Från ORFeome till biologi: en funktionell genomikpipeline // Genome Res . : journal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2136-2144 . - doi : 10.1101/gr.2576704 . — PMID 15489336 .
Rual JF, Venkatesan K., Hao T., et al. Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket (engelska) // Nature : journal. - 2005. - Vol. 437 , nr. 7062 . - P. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .
Mehrle A., Rosenfelder H., Schupp I., et al. LIFEdb-databasen 2006 // Nucleic Acids Res . : journal. - 2006. - Vol. 34 , nr. Databasproblem . - P.D415-8 . doi : 10.1093 / nar/gkj139 . — PMID 16381901 .