Histon deacetylas 11

Identifierare

HDAC11 ; HD11

Externa ID:n

OMIM: 607226 MGI : 2385252 HomoloGene : 11743 IUPHAR : ChEMBL : 3310 GeneCards : HDAC11-gen

3.5.1.98

Genontologi
Fungera	• histondeacetylasaktivitet • transkriptionsfaktorbindning • NAD-beroende histondeacetylasaktivitet (H3-K14-specifik) • NAD-beroende histondeacetylasaktivitet (H3-K9-specifik) • NAD-beroende histondeacetylasaktivitet (H4-K16-specifik) • NAD-beroende histon-deacetylasaktivitet (H3-K18-specifik)
cellkomponent	• histondeacetylaskomplex • kärna • plasmamembran • extracellulär vesikulär exosom
biologisk process	• transkription, DNA-mallad • reglering av transkription, DNA-templaterad • oligodendrocytutveckling • kromatinmodifiering • histon deacetylering • histon H3 deacetylering • histon H4-deacetylering
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 3:
13,52 – 13,55 Mb

Chr 6:
91,16 – 91,17 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

Histone deacetylase 11 ( Histone deacetylase 11 ) är ett 39 kDa enzym som kodas av HDAC11-genen hos människor, lokaliserat på kromosom 3 hos människor och på kromosom 6 hos möss [1] [2] .

Det är en klass IV HDAC. (Klass IV har egenskaper för både klass I och klass II HDAC). Den beskrevs första gången 2002.

Histondeacetylaser såsom HDAC11 kontrollerar DNA- uttryck genom att modifiera histonoktamerkärnan , som packar DNA i täta kromatinstrukturer och undertrycker genuttryck [ 2] .

Funktioner

HDAC11 uttrycks normalt i hjärn- och testikelvävnader, men ökat uttryck av HDAC11 har också setts i olika cancerceller .

HDAC11 har visat sig vara en negativ regulator av IL-10- produktion i antigenpresenterande celler. Dessutom har HDAC11-hämning visat sig resultera i ökat OX40L- uttryck i Hodgkins lymfomceller .

Interaktioner

HDAC11 har visat sig interagera med HDAC6 [3] .

Se även

Histon deacetylaser

Anteckningar

↑ Gao L., Cueto MA, Asselbergs F., Atadja P. Kloning och funktionell karakterisering av HDAC11, en ny medlem av den mänskliga histondeacetylasfamiljen // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Juli ( vol. 277 , nr 28 ). - P. 25748-25755 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .
↑ 1 2 Entrez-gen: HDAC11-histondeacetylas 11 . (obestämd)
↑ Gao, Lin; Cueto Maria A; Asselbergs Fred; Atadja Peter. Kloning och funktionell karakterisering av HDAC11, en ny medlem av den mänskliga histondeacetylasfamiljen (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - USA, 2002. - Juli ( vol. 277 , nr 28 ). - P. 25748-25755 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .

Litteratur

Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Klass II histondeacetylaser : mångsidiga regulatorer // Trender : journal. - 2003. - Vol. 19 , nr. 5 . - s. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA DNA-kloning med in vitro platsspecifik rekombination // Genomforskning : journal. - 2001. - Vol. 10 , nej. 11 . - P. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Simpson JC; Wellenreuther R; Postka A; Pepperkok, R; Wiemann, S. Systematisk subcellulär lokalisering av nya proteiner identifierade genom storskalig cDNA-sekvensering // EMBO - rapporter : journal. - 2001. - Vol. 1 , nej. 3 . - s. 287-292 . - doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . — PMID 11256614 .
Strausberg R.L.; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, R.D.; Collins, F.S.; Wagner, L; Shenmen, C.M.; Schuler, GD Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds cDNA-sekvenser för människor och mus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; Otsuki, Tetsuji; Sugiyama, Tomoyasu; Irie, Ryotaro; Wakamatsu, AI; Hayashi, Koji; Sato, Hiroyuki. Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 fullängds humana cDNA // Nature Genetics : journal . - 2004. - Vol. 36 , nr. 1 . - S. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Gerhard D.S.; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, C.M.; Grouse, LH; Schuler, G; Klein, S.L.; Gammal, S; Rasooly, R. Status, kvalitet och expansion av NIH fullängds cDNA-projektet: The Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genome Research : journal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Wiemann S; Arlt D; Huber W; Wellenreuther, R; Schleeger, S; Mehrle, A; Bechtel, S; Sauermann, M; Korf, U. From ORFeome to Biology: A Functional Genomics Pipeline // Genome Research : journal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2136-2144 . - doi : 10.1101/gr.2576704 . — PMID 15489336 .
Voelter-Mahlknecht S., Ho AD, Mahlknecht U. Kromosomal organisation och lokalisering av den nya klass IV humana histon deacetylas 11 genen // International Journal of Molecular Medicine : journal. - 2005. - Vol. 16 , nr. 4 . - s. 589-598 . - doi : 10.3892/ijmm.16.4.589 . — PMID 16142391 .
Rual JF; Venkatesan K; Hao T; Hirozane-Kishikawa, Tomoko; Dricot, Amelie; Li, Ning; Berriz, Gabriel F.; Gibbons, Francis D.; Dreze, Matija. Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket (engelska) // Nature : journal. - 2005. - Vol. 437 , nr. 7062 . - P. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .
Mehrle A; Rosenfelder H; Schupp I; Del Val, C; Arlt, D; Hahne, F; Bechtel, S; Simpson, J; Hofmann, O. LIFEdb -databasen 2006 // Nucleic Acids Research : journal. - 2006. - Vol. 34 , nr. Databasproblem . - P.D415-8 . doi : 10.1093 / nar/gkj139 . — PMID 16381901 .
Lindberg D., Akerström G., Westin G. Mutationsanalyser av WNT7A och HDAC11 som kandidatgener för tumörsuppressor i sporadiska maligna pankreasendokrina tumörer (engelska) // Clin. Endokrinol. (Oxf) : tidskrift. - 2007. - Vol. 66 , nr. 1 . - S. 110-114 . - doi : 10.1111/j.1365-2265.2006.02694.x . — PMID 17201809 .

Länkar

MeSH HDAC11+protein,+människa