IRF5

Interferon regulatorisk faktor 5

Tillgängliga strukturer

Ortologisk sökning: PDBe , RCSB

Lista över PDB-ID
3DSH

Identifierare

Symbol

IRF5 ; SLEB10

Externa ID:n

OMIM: 607218 MGI : 1350924 HomoloGene : 8088 GeneCards : IRF5 Gene

Genontologi
Fungera	• DNA-bindning för regulatorisk region • sekvensspecifik DNA-bindande transkriptionsfaktoraktivitet • proteinbindning
cellkomponent	• kärna • cytoplasma • cytosol
biologisk process	• transkription, DNA-mallad • cytokin-medierad signalväg • svar på peptidoglykan • svar på muramyldipeptid • positiv reglering av interferon-alfa-produktion • positiv reglering av interferon-beta-produktion • positiv reglering av interleukin-12-produktion • positiv reglering av apoptotisk process • positiv reglering av transkription från RNA-polymeras II-promotor • försvarssvar mot virus • interferon-gamma-medierad signalväg • typ I-interferonsignalväg
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 7:
128,58 – 128,59 Mb

Chr 6:
29,53 – 29,54 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

Interferon regulatorisk faktor 5 är ett protein som hos människor kodas av IRF5 -genen . [ett]

Funktion

IRF5 är en medlem av familjen interferon regulatory factor (IFF), en grupp av transkriptionsfaktorer med olika roller, inklusive virusmedierad interferonaktivering och modulering av celltillväxt, differentiering, apoptos och immunsystemets aktivitet. Medlemmar av IRF-familjen kännetecknas av en konserverad N-terminal DNA-bindande domän , innehållande en repeterande tryptofan (W). Det finns alternativa splitsningsvarianter som kodar för olika isoformer. [ett]

Klinisk betydelse

IRF5 fungerar som en molekylär switch som styr om makrofager kommer att främja eller hindra inflammation. Blockering av produktionen av IRF5 i makrofager kan hjälpa till att behandla ett brett spektrum av autoimmuna sjukdomar, och att höja IRF5-nivåerna kan hjälpa till att behandla människor vars immunsystem är svagt, ineffektivt eller skadat. IRF5 verkar fungera "antingen genom att interagera med DNA direkt, eller genom att interagera med andra proteiner som själva styr vilka gener som ska bytas." [2]

Se även

Interferon
IRF1 , IRF2 , IRF3 , IRF4 , IRF6 , IRF7 , IRF8 och IRF9

Anteckningar

↑ 1 2 Entrez-gen: IRF5 interferon regulatorisk faktor 5 . Arkiverad från originalet den 8 mars 2010. (obestämd)
↑ Krausgruber T., Blazek K., Smallie T., Alzabin S., Lockstone H., Sahgal N., Hussell T., Feldmann M., Udalova IA IRF5 främjar inflammatorisk makrofagpolarisering och T(H)1-T(H) )17 svar (eng.) // Nature Immunology : journal. - 2011. - Januari ( vol. 12 , nr 3 ). - S. 231-238 . - doi : 10.1038/ni.1990 . — PMID 21240265 .

Litteratur

Pitha PM, Au WC, Lowther W., et al. Interferonreglerande faktorers (IRF) roll i virusmedierad signalering och reglering av celltillväxt (engelska) // Biochimie : journal. - 1999. - Vol. 80 , nej. 8-9 . - s. 651-658 . - doi : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . — PMID 9865487 .
Barnes B., Lubyova B., Pitha PM Om IRF:s roll i värdförsvar (neopr.) // J. Interferon Cytokine Res.. - 2002. - V. 22 , nr 1 . - S. 59-71 . - doi : 10.1089/107999002753452665 . — PMID 11846976 .
Barnes BJ, Moore PA, Pitha PM Virusspecifik aktivering av en ny interferonregulatorisk faktor, IRF-5, resulterar i induktion av distinkta interferon alfa-gener // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2001. - Vol. 276 , nr. 26 . - P. 23382-23390 . - doi : 10.1074/jbc.M101216200 . — PMID 11303025 .
Nehyba J., Hrdlicková R., Burnside J., Bose HR En ny interferon regulatorisk faktor (IRF), IRF-10, har en unik roll i immunförsvaret och induceras av v-Rel onkoproteinet // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 11 . - P. 3942-3957 . - doi : 10.1128/MCB.22.11.3942-3957.2002 . — PMID 11997525 .
Barnes BJ, Kellum MJ, Field AE, Pitha PM Flera regulatoriska domäner av IRF-5 kontrollerar aktivering, cellulär lokalisering och induktion av kemokiner som förmedlar rekrytering av T-lymfocyter // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 16 . - P. 5721-5740 . - doi : 10.1128/MCB.22.16.5721-5740.2002 . — PMID 12138184 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds cDNA-sekvenser för människor och mus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Barnes BJ, Field AE, Pitha-Rowe PM Virusinducerad heterodimerbildning mellan IRF-5 och IRF-7 modulerar sammansättningen av IFNA-enhancerosomen in vivo och transkriptionell aktivitet av IFNA-gener // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 19 . - P. 16630-16641 . - doi : 10.1074/jbc.M212609200 . — PMID 12600985 .
Scherer SW, Cheung J., MacDonald JR, et al. Human kromosom 7: DNA-sekvens och biologi (engelska) // Vetenskap. - 2003. - Vol. 300 , nej. 5620 . - s. 767-772 . - doi : 10.1126/science.1083423 . — PMID 12690205 .
Barnes BJ, Kellum MJ, Pinder KE, et al. Interferon regulatorisk faktor 5, en ny mediator av cellcykelstopp och celldöd (eng.) // Cancerforskning : journal. — American Association for Cancer Research, 2003. - Vol. 63 , nr. 19 . - P. 6424-6431 . — PMID 14559832 .
Barnes BJ, Richards J., Mancl M., et al. Globala och distinkta mål för IRF-5 och IRF-7 under medfödd respons på virusinfektion (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2004. - Vol. 279 , nr. 43 . - P. 45194-45207 . - doi : 10.1074/jbc.M400726200 . — PMID 15308637 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genome Research : journal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Lin R., Yang L., Arguello M., et al. En CRM1-beroende nukleär exportväg är involverad i regleringen av IRF-5 subcellulär lokalisering (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2005. - Vol. 280 , nr. 4 . - P. 3088-3095 . - doi : 10.1074/jbc.M408452200 . — PMID 15556946 .
Sigurdsson S., Nordmark G., Goring HH, et al. Polymorfismer i generna för tyrosinkinas 2 och interferon regulatorisk faktor 5 är associerade med systemisk lupus erythematosus // American Journal of Human Genetics : journal. - 2005. - Vol. 76 , nr. 3 . - s. 528-537 . - doi : 10.1086/428480 . — PMID 15657875 .
Takaoka A., Yanai H., Kondo S., et al. IRF-5s integrerade roll i geninduktionsprogrammet aktiverat av Toll-like receptors (engelska) // Nature : journal. - 2005. - Vol. 434 , nr. 7030 . - S. 243-249 . - doi : 10.1038/nature03308 . — PMID 15665823 .
Schoenemeyer A., Barnes BJ, Mancl ME, et al. Den interferonreglerande faktorn, IRF5, är en central mediator för signalering av toll-like receptor 7 (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2005. - Vol. 280 , nr. 17 . - P. 17005-17012 . - doi : 10.1074/jbc.M412584200 . — PMID 15695821 .
Mancl ME, Hu G., Sangster-Guity N., Olshalsky SL, Hoops K., Fitzgerald-Bocarsly P., Pitha PM, Pinder K., Barnes BJ Två diskreta promotorer reglerar den alternativt skarvade mänskliga interferonregulatoriska faktorn-5 isoformer. Flera isoformer med distinkt celltypsspecifikt uttryck, lokalisering, reglering och funktion (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2005. - Juni ( vol. 280 , nr 22 ). - P. 21078-21090 . - doi : 10.1074/jbc.M500543200 . — PMID 15805103 .
Rual JF, Venkatesan K., Hao T., et al. Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket (engelska) // Nature : journal. - 2005. - Vol. 437 , nr. 7062 . - P. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .
Graham RR, Kozyrev SV, Baechler EC, et al. En vanlig haplotyp av interferon regulatorisk faktor 5 (IRF5) reglerar splitsning och uttryck och är associerad med ökad risk för systemisk lupus erythematosus (engelska) // Nature Genetics : journal. - 2006. - Vol. 38 , nr. 5 . - S. 550-555 . - doi : 10.1038/ng1782 . — PMID 16642019 .