MDGrape-3 är en superdator designad för att lösa problem med molekylär dynamik , nämligen modellering av proteinveckning . Vid tidpunkten för driftsättningen hade den en rekord teoretisk prestanda på 1000 biljoner operationer per sekund.
MDGrape-3 utvecklades vid det japanska forskningsinstitutet RIKEN ( Yokohama ) med teknisk support från SGI Japan och den japanska divisionen av Intel .
MDGrape-3 presenterades först officiellt den 24 juni 2006 .
MDGrape-3 är baserad på MDGrape- 3 - processorer tillverkade av Hitachi , som ger en prestanda på 230 Gflops vardera. En datormodul innehåller 24 sådana processorer, och hela systemet består av 201 moduler.
Den huvudsakliga processorkärnan drivs av två grupper av servrar baserade på Intel-processorer: ett kluster med 64 parallella servrar med processorer med dubbla kärnor (totalt 256 processorkärnor) Intel Xeon ( Dempsey ), och ett annat kluster med 37 servrar (74 enkel- kärna Xeon-processorer 3,2 GHz). Sammansättningen av alla dessa datorer till ett enda massivt parallellt system utfördes av SGI Japan.
Vid idrifttagningen var MDGrape-3 nästan tre gånger så produktiv som den "snabbaste datorn på planeten", amerikanska IBM BlueGene / L , belägen vid Livermore Laboratory. Lawrence . Men på grund av det faktum att MDGrape-3 inte är en dator för allmänt bruk, är det svårt att mäta dess prestanda med hjälp av Linpack -testet (att lösa stora system av linjära ekvationer). Och eftersom system av världens superdatorklassificering Top500 fortsätter att rankas på basis av Linpack , deltar den inte i denna klassificering.