N-terminal

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 28 augusti 2017; kontroller kräver 2 redigeringar .

N -Terminus ( engelska  N-terminus ), även amino-terminus  , är aminogruppen i den första aminosyran som en proteinmolekyl ellerpeptid börjar med [1] .

Varje aminosyra har en aminogrupp och en karboxylgrupp . Aminosyror binder till varandra genom en dehydreringsreaktion genom att lägga till karboxylgruppen i en aminosyra till aminogruppen i en annan. Således slutar polypeptidkedjor med en fri karboxylgrupp, C-terminalen , och börjar med en aminogrupp, N-terminalen [1] .

Metoder för att bestämma den N-terminala aminosyran

För att bestämma naturen av den N-terminala aminosyran har ett antal metoder föreslagits, särskilt Sanger-metoden (F. Sanger), baserad på aryleringsreaktionen av polypeptiden 2,4-dinitrofluorobensen (DNFB), som leder till bildandet av en gulfärgad 2,4-dinitrofenylderivat N-terminal aminosyra. Polypeptidlösningen behandlas med DNFB, som interagerar med den fria NH2 - gruppen i peptidens N-terminala aminosyra.

Efter sur hydrolys av reaktionsprodukten, dinitrofenylpeptid, är endast en N-terminal aminosyra bunden till reagenset i form av 2,4-dinitrofenylaminosyra (stabil vid hydrolys). Till skillnad från andra fria aminosyror som bildas under hydrolysen av polypeptiden är den gul. Det identifieras genom kromatografi.

För att bestämma den N-terminala aminosyran används fenyltiohydantoin Edman-metoden mycket mer allmänt på grund av dess höga känslighet och möjligheten till flera användningar i samma prov. Fenylisotiocyanat reagerar med den fria a-NH2- gruppen i den N-terminala aminosyran i polypeptiden för att bilda fenyltiokarbamoylpeptid.

Anteckningar

  1. 1 2 Nelson, Cox, 2011 , sid. 128.

Litteratur