POLR2D

Polypeptid D RNA-polymeras II (guidad DNA)

Det preliminära budgetförslaget representeras av exemplet 2c35.

Tillgängliga strukturer

Ortologisk sökning: PDBe , RCSB

Lista över PDB-ID
2C35

Identifierare

Symbol

POLR2D ; HSRBP4; HSRPB4; RBP4; RPB16

Externa ID:n

OMIM: 606017 MGI : 1916491 HomoloGene : 37968 GeneCards : POLR2D Gen

EG-nummer

2.7.7.6

Genontologi
Fungera	• nukleotidbindning • enkelsträngad DNA-bindning • enkelsträngad RNA-bindning • DNA-riktad RNA-polymerasaktivitet • translationsinitieringsfaktorbindning
cellkomponent	• cytoplasmatisk mRNA-bearbetningskropp • kärna • nukleoplasma • DNA-riktat RNA-polymeras II, kärnkomplex
biologisk process	• nukleärt transkriberad mRNA-katabolisk process, deadenyleringsberoende sönderfall • mRNA-skarvning, via spliceosom • DNA-reparation • transkriptionskopplad nukleotid-excisionsreparation • nukleotid-excisionsreparation • transkription från RNA-polymeras II-promotor • transkriptionsinitiering från RNA-polymeras II-promotor • transkriptionsförlängning från RNA-polymeras II-promotor • 7-metylguanosin kapning • RNA-splitsning • genuttryck • viral process • mRNA-export från kärnan som svar på värmestress • rekrytering av 3'-ände bearbetningsfaktorer till RNA-polymeras II holoenzymkomplex • positiv reglering av translationsinitiering • positiv reglering av viral transkription
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 2:
128,6 – 128,62 Mb

Chr 18:
31,79 – 31,8 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

RPB4-subenheten av DNA-beroende RNA-polymeras II är ett enzym som kodas hos människor av POLR2D-genen [1] .

Denna gen kodar för den fjärde största subenheten av RNA-polymeras II , ansvarig för RNA- syntes i eukaryoter . I jäst binder denna polymerassubenhet till polymeras under suboptimala tillväxtförhållanden och kan spela en roll för stressskydd. Den 3'-otranslaterade regionen av detta gentranskript innehåller sekvensen för en ribosomal pseudogen [2] .

Anteckningar

↑ Khazak V., Estojak J., Cho H., Majors J., Sonoda G., Testa JR, Golemis EA Analys av interaktionen mellan den nya RNA-polymeras II (pol II) subenheten hsRPB4 med sin partner hsRPB7 och med pol II (eng.) // Mol Cell Biol : journal. - 1998. - Maj ( vol. 18 , nr 4 ). - P. 1935-1945 . — PMID 9528765 .
↑ Entrez-gen: POLR2D-polymeras (RNA) II (DNA-riktad) polypeptid D. (obestämd)

Litteratur

Zhang KT Tat, Tat-associerat kinas och transkription. (engelska) // J. Biomed. sci. : journal. - 1998. - Vol. 5 , nej. 1 . - S. 24-7 . - doi : 10.1007/BF02253352 . — PMID 9570510 .
Yankulov K., Bentley D. Transkriptionskontroll: Tat-kofaktorer och transkriptionsförlängning. (engelska) // Curr. Biol. : journal. - 1998. - Vol. 8 , nr. 13 . - P.R447-9 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . — PMID 9651670 .
Romano G., Kasten M., De Falco G., et al. Regulatoriska funktioner för Cdk9 och av cyklin T1 i genuttryck för HIV tat-transaktiveringsvägar. (engelska) // J. Cell. Biochem. : journal. - 2000. - Vol. 75 , nr. 3 . - s. 357-368 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . — PMID 10536359 .
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Flera sätt för transkriptionell reglering av HIV-1 Tat-transaktivatorn. (engelska) // IUBMB Life: journal. - 2002. - Vol. 51 , nr. 3 . - S. 175-181 . - doi : 10.1080/152165401753544241 . — PMID 11547919 .
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. Regleringen av HIV-1-transkription: molekylära mål för kemoterapeutisk intervention. (engelska) // Med Res Rev : journal. - 2007. - Vol. 26 , nr. 5 . - s. 595-625 . - doi : 10.1002/med.20081 . — PMID 16838299 .
Harrich D., McMillan N., Munoz L., et al. Kommer olika Tat-interaktioner att leda till nya antiretrovirala läkemedelsmål? (eng.) // Aktuella läkemedelsmål : journal. - 2007. - Vol. 7 , nr. 12 . - P. 1595-1606 . - doi : 10.2174/138945006779025338 . — PMID 17168834 .
Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., et al. HIV-1 Tat fungerar som en processivitetsfaktor in vitro i samband med cellulära förlängningsfaktorer. (engelska) // Genes Dev. : journal. - 1992. - Vol. 6 , nr. 4 . - s. 655-666 . - doi : 10.1101/gad.6.4.655 . — PMID 1559613 .
Southgate C., Zapp ML, Green MR Aktivering av transkription av HIV-1 Tat-protein kopplat till begynnande RNA genom ett annat protein. (engelska) // Natur: journal. - 1990. - Vol. 345 , nr. 6276 . - s. 640-642 . - doi : 10.1038/345640a0 . — PMID 2190099 .
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor RB Specifik bindning av RNA-polymeras II till det transaktiverande området för humant immunbristvirus RNA regleras av cellulära kofaktorer och Tat. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 1995. - Vol. 92 , nr. 16 . - P. 7153-7157 . - doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . — PMID 7638159 .
Herrmann CH, Rice AP Lentivirus Tat-proteiner associeras specifikt med ett cellulärt proteinkinas, TAK, som hyperfosforylerar den karboxylterminala domänen av den stora subenheten av RNA-polymeras II: kandidat för en Tat-kofaktor. (engelska) // J. Virol. : journal. - 1995. - Vol. 69 , nr. 3 . - P. 1612-1620 . — PMID 7853496 .
Keen NJ, Gait MJ, Karn J. Humant immunbristvirus typ-1 Tat är en integrerad komponent i det aktiverade transkriptionsförlängningskomplexet. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 1996. - Vol. 93 , nr. 6 . - P. 2505-2510 . - doi : 10.1073/pnas.93.6.2505 . — PMID 8637904 .
Yang X., Herrmann CH, Rice AP Det humana immunbristviruset Tat-proteiner associeras specifikt med TAK in vivo och kräver den karboxylterminala domänen av RNA-polymeras II för funktion. (engelska) // J. Virol. : journal. - 1996. - Vol. 70 , nej. 7 . - P. 4576-4584 . — PMID 8676484 .
Agostini I., Navarro JM, Rey F., et al. Humant immunbristvirus typ 1 Vpr-transaktivator: samarbete med promotorbundna aktivatordomäner och bindning till TFIIB. (engelska) // J. Mol. Biol. : journal. - 1996. - Vol. 261 , nr. 5 . - s. 599-606 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0485 . — PMID 8800208 .
Zhou Q., Sharp PA Tat-SF1: kofaktor för stimulering av transkriptionell förlängning av HIV-1 Tat. (engelska) // Vetenskap: tidskrift. - 1996. - Vol. 274 , nr. 5287 . - s. 605-610 . - doi : 10.1126/science.274.5287.605 . — PMID 8849451 .
Okamoto H., Sheline CT, Corden JL, et al. Transaktivering av humant immunbristvirus Tat-protein kräver den C-terminala domänen av RNA-polymeras II. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 1996. - Vol. 93 , nr. 21 . - P. 11575-11579 . - doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . — PMID 8876177 .
Chun RF, Zhang KT Krav för RNA-polymeras II karboxylterminal domän för aktiverad transkription av humana retrovirus humant T-cells lymfotropiskt virus I och HIV-1. (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 1996. - Vol. 271 , nr. 44 . - P. 27888-27894 . doi : 10.1074 / jbc.271.44.27888 . — PMID 8910388 .
Parada CA, Roeder RG Förbättrad processivitet av RNA-polymeras II utlöst av Tat-inducerad fosforylering av dess karboxiterminala domän. (engelska) // Natur: journal. - 1996. - Vol. 384 , nr. 6607 . - s. 375-378 . - doi : 10.1038/384375a0 . — PMID 8934526 .
García-Martínez LF, Ivanov D., Gaynor RB Association of Tat med renade HIV-1- och HIV-2-transkriptionspreinitieringskomplex. (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 1997. - Vol. 272 , nr. 11 . - P. 6951-6958 . doi : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . — PMID 9054383 .
Cujec TP, Cho H., Maldonado E., et al. Den humana immunbristvirustransaktivatorn Tat interagerar med RNA-polymeras II-holoenzym. (engelska) // Mol. cell. Biol. : journal. - 1997. - Vol. 17 , nr. 4 . - P. 1817-1823 . — PMID 9121429 .
García-Martinez LF, Mavankal G., Neveu JM, et al. Rening av ett Tat-associerat kinas avslöjar ett TFIIH-komplex som modulerar HIV-1-transkription. (engelska) // EMBO J. : journal. - 1997. - Vol. 16 , nr. 10 . - P. 2836-2850 . - doi : 10.1093/emboj/16.10.2836 . — PMID 9184228 .