SPI1

Spi1 proto-onkogen

PDB i samband med 1pue.

Tillgängliga strukturer

Ortologisk sökning: PDBe , RCSB

Lista över PDB-ID
1 pue

Identifierare

Symbol

SPI1 ; AV; PU.1; SFPI1; SPI-1; SPI-A

Externa ID:n

OMIM: 165170 MGI : 98282 HomoloGene : 2346 GeneCards : SPI1 Gene

Genontologi
Fungera	• RNA-polymeras II distal förstärkarsekvensspecifik DNA-bindning • sekvensspecifik DNA-bindande RNA-polymeras II-transkriptionsfaktoraktivitet • kärnpromotorbindning • RNA-polymeras II-transkriptionsfaktorbindning • RNA-polymeras II distal förstärkare sekvensspecifik DNA-bindande transkriptionsfaktoraktivitet involverad i positiv reglering av transkription • sekvensspecifik DNA-bindande transkription faktoraktivitet • RNA-polymeras II distal förstärkarsekvensspecifik DNA-bindande transkriptionsfaktoraktivitet • RNA-bindning • proteinbindning • NFAT-proteinbindning
cellkomponent	• kärnkromatin
biologisk process	• negativ reglering av transkription från RNA-polymeras II-promotor • differentiering av lymfoida progenitorceller • reglering av transkription från RNA-polymeras II-promotor • transkription från RNA-polymeras II-promotor • lymfocytdifferentiering • erytrocytdifferentiering • makrofagdifferentiering • granulocytdifferentiering • underhåll av somatisk stamcell • differentiering av myeloid dendritisk cell • metylhyperetylering av histon • H3 CpG-ö • negativ reglering av MHC klass II biosyntetisk process • reglering av erytrocytdifferentiering • negativ reglering av genuttryck, epigenetisk • negativ reglering av transkription, DNA-templat • positiv reglering av transkription, DNA-templerad • positiv reglering av transkription från RNA-polymeras II-promotor • anatomisk strukturregression • negativ reglering av histon H4-acetylering • apoptotisk process involverad i mönsterbildning av blodkärl
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 11:
47,38 – 47,4 Mb

Chr 2:
91,08 – 91,12 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

Transkriptionsfaktorn PU.1 är ett protein som hos människor kodas av genen SPI1 [1] .

Funktion

Denna gen kodar för en ETS-domäntranskriptionsfaktor som aktiverar genuttryck under myeloid och B-lymfoid cellutveckling. Det nukleärt lokaliserade proteinet binder till purinrika sekvenser kända som PU-boxar, finns nära promotorer av målgener och reglerar deras uttryck i samverkan med andra transkriptionsfaktorer och kofaktorer . Proteinet kan också reglera alternativ splitsning av målgener. Det finns flera varianter av transkript som kodar för olika isoformer av denna gen [2] .

Det antas att en multipel ökning av Pu.1-syntesen i vissa subkutana fettceller under åldrandet bidrar till hämning av adipogenes och uttunning av subkutan fettvävnad hos äldre. [3]

Interaktioner

SPI1 har visat sig interagera med:

FUS , [4]
GATA2 , [5]
IRF4 , [6] [7]
NEJ . [åtta]

Anteckningar

↑ Ray D., Culine S., Tavitain A., Moreau-Gachelin F. Den mänskliga homologen av den förmodade proto-onkogenen Spi-1: karakterisering och uttryck i tumörer // Onkogen : journal. - 1990. - Juli ( vol. 5 , nr 5 ). - s. 663-668 . — PMID 1693183 .
↑ Entrez-gen: SPI1-mjältfokusbildande virus (SFFV) proviral integration onkogen spi1 . (obestämd)
↑ Hai P. Nguyen, Frances Lin, Danielle Yi, Ying Xie, Jennie Dinh, Pengya Xue, Hei Sook Sul, (2021). Åldringsberoende reglerande celler dyker upp i subkutant fett för att hämma adipogenes . Utvecklingscell doi : 10.1016/j.devcel.2021.03.026
↑ Hallier M., Lerga A., Barnache S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkriptionsfaktorn Spi-1/PU.1 interagerar med den potentiella splitsningsfaktorn TLS // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1998. - Februari ( vol. 273 , nr 9 ). - P. 4838-4842 . — PMID 9478924 .
↑ Zhang P., Behre G., Pan J., Iwama A., Wara-Aswapati N., Radomska HS, Auron PE, Tenen DG, Sun Z. Negativt överhörande mellan hematopoietiska regulatorer: GATA-proteiner undertrycker PU.1 ( Engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1999. - Juli ( vol. 96 , nr 15 ). - P. 8705-8710 . — PMID 10411939 .
↑ Brass AL, Zhu AQ, Singh H. Monteringskrav för PU.1-Pip (IRF-4) aktivatorkomplex: hämmande funktion in vivo med fusionerade dimerer // The EMBO Journal : journal. - 1999. - Februari ( vol. 18 , nr 4 ). - P. 977-991 . doi : 10.1093 / emboj/18.4.977 . — PMID 10022840 .
↑ Escalante CR, Shen L., Escalante MC, Brass AL, Edwards TA, Singh H., Aggarwal AK Kristallisering och karakterisering av PU.1/IRF-4/DNA ternärt komplex // Journal of Structural Biology : journal. - 2002. - Juli ( vol. 139 , nr 1 ). - S. 55-9 . — PMID 12372320 .
↑ Hallier M., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkriptionsfaktorn Spi-1/PU.1 binder RNA och stör det RNA-bindande proteinet p54nrb // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1996. - Maj ( vol. 271 , nr 19 ). - P. 11177-11181 . — PMID 8626664 .

Litteratur

Klemsz MJ, McKercher SR, Celada A., Van Beveren C., Maki RA Makrofagen och B-cellsspecifik transkriptionsfaktor PU.1 är relaterad till ets-onkogenen. (engelska) // Cell : journal. - Cell Press , 1990. - Vol. 61 , nr. 1 . - S. 113-124 . - doi : 10.1016/0092-8674(90)90219-5 . — PMID 2180582 .
Nguyen VC, Ray D., Gross MS, de Tand MF, Frézal J., Moreau-Gachelin F. Lokalisering av den humana onkogenen SPI1 på kromosom 11, region p11.22. (engelska) // Human Genetics : journal. - 1990. - Vol. 84 , nr. 6 . - s. 542-546 . - doi : 10.1007/bf00210807 . — PMID 2338340 .
Chen H., Ray-Gallet D., Zhang P., Hetherington CJ, Gonzalez DA, Zhang DE, Moreau-Gachelin F., Tenen DG PU.1 (Spi-1) autoreglerar dess uttryck i myeloidceller. (engelska) // Oncogene. - 1995. - Vol. 11 , nr. 8 . - P. 1549-1560 . — PMID 7478579 .
Nagulapalli S., Pongubala JM, Atchison ML Flera proteiner interagerar fysiskt med PU.1. Transkriptionell synergi med NF-IL6 beta (C/EBP delta, CRP3). (engelska) // Journal of Immunology : journal. - 1995. - Vol. 155 , nr. 9 . - P. 4330-4338 . — PMID 7594592 .
Pongubala JM, Atchison ML Aktiverande transkriptionsfaktor 1 och cyklisk AMP-responselementmodulator kan modulera aktiviteten hos immunoglobulin kappa 3'-förstärkaren. (engelska) // Journal of Biological Chemistry : tidskrift. - 1995. - Vol. 270 , nr. 17 . - P. 10304-10313 . doi : 10.1074/ jbc.270.17.10304 . — PMID 7730336 .
Hromas R., Orazi A., Neiman RS, Maki R., Van Beveran C., Moore J., Klemsz M. Hematopoetisk härstamnings- och stadiumbegränsat uttryck av ETS-onkogenfamiljemedlemmen PU.1. (engelska) // Blood : journal. — American Society of Hematology, 1993. - Vol. 82 , nr. 10 . - P. 2998-3004 . — PMID 8219191 .
Hagemeier C., Bannister AJ, Cook A., Kouzarides T. Aktiveringsdomänen för transkriptionsfaktorn PU.1 binder retinoblastomproteinet (RB) och transkriptionsfaktorn TFIID in vitro: RB visar sekvenslikhet med TFIID och TFIIB. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 1993. - Vol. 90 , nej. 4 . - S. 1580-1584 . - doi : 10.1073/pnas.90.4.1580 . — PMID 8434021 .
Hallier M., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkriptionsfaktorn Spi-1/PU.1 binder RNA och stör det RNA-bindande proteinet p54nrb. (engelska) // Journal of Biological Chemistry : tidskrift. - 1996. - Vol. 271 , nr. 19 . - P. 11177-11181 . doi : 10.1074 / jbc.271.19.11177 . — PMID 8626664 .
Bassuk AG, Anandappa RT, Leiden JM Fysiska interaktioner mellan Ets och NF-kappaB/NFAT-proteiner spelar en viktig roll i deras samverkande aktivering av den humana immunbristvirusförstärkaren i T-celler. (engelska) // Journal of Virology : journal. - 1997. - Vol. 71 , nr. 5 . - P. 3563-3573 . — PMID 9094628 .
Li SL, Valente AJ, Zhao SJ, Clark RA PU.1 är väsentlig för p47(phox)-promotoraktivitet i myeloidceller. (engelska) // Journal of Biological Chemistry : tidskrift. - 1997. - Vol. 272 , nr. 28 . - P. 17802-17809 . doi : 10.1074 / jbc.272.28.17802 . — PMID 9211934 .
Tsukada J., Misago M., Serino Y., Ogawa R., Murakami S., Nakanishi M., Tonai S., Kominato Y., Morimoto I., Auron PE, Eto S. Humant T-cellsleukemivirus typ I Tax transaktiverar promotorn för human prointerleukin-1beta-gen genom association med två transkriptionsfaktorer, nukleär faktor-interleukin-6 och Spi-1. (engelska) // Blood : journal. — American Society of Hematology, 1997. - Vol. 90 , nej. 8 . - P. 3142-3153 . — PMID 9376596 .
Hallier M., Lerga A., Barnache S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkriptionsfaktorn Spi-1/PU.1 interagerar med den potentiella splitsningsfaktorn TLS. (engelska) // Journal of Biological Chemistry : tidskrift. - 1998. - Vol. 273 , nr. 9 . - P. 4838-4842 . doi : 10.1074/ jbc.273.9.4838 . — PMID 9478924 .
Suzuki S., Kumatori A., Haagen IA, Fujii Y., Sadat MA, Jun HL, Tsuji Y., Roos D., Nakamura M. PU.1 som en väsentlig aktivator för uttrycket av gp91(phox)-genen i människa perifera neutrofiler, monocyter och B-lymfocyter. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 1998. - Vol. 95 , nr. 11 . - P. 6085-6090 . - doi : 10.1073/pnas.95.11.6085 . — PMID 9600921 .
Carrère S., Verger A., Flourens A., Stehelin D., Duterque-Coquillaud M. Erg-proteiner, transkriptionsfaktorer från Ets-familjen, bildar homo-, heterodimerer och ternära komplex via två distinkta domäner. (engelska) // Oncogene : journal. - 1998. - Vol. 16 , nr. 25 . - P. 3261-3268 . - doi : 10.1038/sj.onc.1201868 . — PMID 9681824 .
Sato M., Morii E., Takebayashi-Suzuki K., Yasui N., Ochi T., Kitamura Y., Nomura S. Mikroftalmiassocierad transkriptionsfaktor interagerar med PU.1 och c-Fos: bestämning av deras subcellulära lokalisering. (engelska) // Biokemiska och biofysiska forskningskommunikationer : journal. - 1999. - Vol. 254 , nr. 2 . - s. 384-387 . - doi : 10.1006/bbrc.1998.9918 . — PMID 9918847 .
Brass AL, Zhu AQ, Singh H. Monteringskrav för PU.1-Pip (IRF-4) aktivatorkomplex: hämmande funktion in vivo med användning av fusionerade dimerer. (engelska) // The EMBO Journal : journal. - 1999. - Vol. 18 , nr. 4 . - P. 977-991 . doi : 10.1093 / emboj/18.4.977 . — PMID 10022840 .
Yamamoto H., Kihara-Negishi F., Yamada T., Hashimoto Y., Oikawa T. Fysiska och funktionella interaktioner mellan transkriptionsfaktorn PU.1 och koaktivatorn CBP. (engelska) // Oncogene : journal. - 1999. - Vol. 18 , nr. 7 . - P. 1495-1501 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202427 . — PMID 10050886 .
Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon MC SPI-B aktiverar transkription via en unik prolin-, serin- och treonindomän och uppvisar DNA-bindningsaffinitetsskillnader från PU.1. (engelska) // Journal of Biological Chemistry : tidskrift. - 1999. - Vol. 274 , nr. 16 . - P. 11115-11124 . doi : 10.1074 / jbc.274.16.11115 . — PMID 10196196 .
Mao S., Frank RC, Zhang J., Miyazaki Y., Nimer SD Funktionella och fysiska interaktioner mellan AML1-proteiner och ett ETS-protein, MEF: implikationer för patogenesen av t(8;21)-positiva leukemier. (engelska) // Molecular and Cellular Biology : journal. - 1999. - Vol. 19 , nr. 5 . - P. 3635-3644 . — PMID 10207087 .