NevGen
Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från
versionen som granskades den 21 januari 2020; kontroller kräver
4 redigeringar .
NevGen eller NevGen är ett av världens haplogroup prediktionsprojekt , utvecklat under ledning av det serbiska DNA-projektet och Poreklo Society of Serbian Genealogists . Författarna är Aco Nevsky (pseudonym) och Milos Cetkovich-Gentula. Programmet skapades i maj 2014 som en skrivbordsapplikation för serbiska släktforskares behov, sedan slutet av 2015 finns det även en onlineversion av programmet. NevGen använder en träningsdator samt en Bayesian - Allel-Frequency Approach för att förutsäga vilken haplogrupp som motsvarar Y-STR- haplotypen . Dessutom använder den det ömsesidiga beroendet mellan värdena för de olika STR-markörerna vid beräkning av förgreningssannolikheterna. De ständiga framstegen och de många vetenskapliga artiklarna där han har tillämpats gör honom till en av de mest kända Y-DNA-haplogruppsprediktorerna i världen.
Tillämpningar inom vetenskap
Används i följande vetenskapliga artiklar (listan kan utökas):
- Dogan S., Babic N., Gurkan C., Goksu A., Marjanovic D., Hadziavdic V. Y-kromosomal haplogruppsfördelning i Tuzla-kantonen Bosnien och Hercegovina: En konkordansstudie med fyra olika in silico-tilldelningsalgoritmer baserade på Y -STR data (engelska) // Homo : journal. - 2016. - Vol. 67 , nr. 6 . - s. 471-483 . - doi : 10.1016/j.jchb.2016.10.003 .
- Szargut M., Ossowski A., Kuś M., Zielińska G., Rębacz-Maron E. Haplogroup-prediktion av olika Y-STR-baserade verktyg i prover från Förenade republiken Tanzania (engelska) : journal. - 2016. - doi : 10.13140/RG.2.2.25831.04003 .
- Mustafin KK, Alborova IE, Semenov AS, Vishnevsky VP Haplogroup Analysis for a Medieval Russian Burial оf 16th–17th Centures in Radonezh (Moskva-området) (engelska) // Studia Slavica et Balcanica Petropolitana : tidskrift. - 2018. - Vol. 24 , nr. 2 . - S. 169-180 . - doi : 10.21638/spbu19.2018.209 .
- Diepenbroek M., Cytacka S., Szargut M., Arciszewska J., Zielińska G., Ossowski A. Analys av manlig specifik region av den mänskliga Y-kromosomen kastar ljus över historiska händelser i det nazistiskt ockuperade östra Polen (engelska) // Internationell tidskrift av juridisk medicin: tidskrift. - 2018. - S. 395-409 . - doi : 10.1007/s00414-018-1943-0 .
- Poriswanish N., Neumann R., Wetton JH, Wagstaff J., Larmuseau MH, Jobling MA, May, CA Rekombinationshotspots i en utökad mänsklig pseudoautosomal domän förutspådd från dubbelsträngsbrottskartor och karakteriserad av spermiebaserad överkorsningsanalys (eng. ) // PLoS genetik : journal. - 2018. - Vol. 14 , nr. 10 . - doi : 10.1371/journal.pgen.1007680 .
- Kačar T., Stamenković G., Blagojević J., Krtinić J., Mijović D., Marjanović D. Y kromosomgenetiska data definierade av 23 korta tandemupprepningar i en serbisk befolkning på Balkanhalvön (engelska) // Annals of human biology : journal. - 2019. - Vol. 46 , nr. 1 . - S. 77-83 . - doi : 10.1080/03014460.2019.1584242 .
- Al-Snan NR, Messaoudi SA, Khubrani YM, Wetton JH, Jobling MA, Bakhiet M. Genetisk variation vid 27 y-strs i fyra regioner i Bahrain // bioRxiv : journal. - 2019. - doi : 10.1101/787341 .
- Kiesler KM, Andreaggi KS, Ring JD, Taylor CR, Marshall CK, Vallone PM Sekvensering av hela mitokondriella genom för NIST-populationsprover (odefinierat) // Forensic Science International: Genetics Supplement Series. - 2019. - S. 452-453 .
- López-Ramírez YL, Aguilar-Velázquez JA, López-Armenta M., Ruiz-Hernández M., Rangel-Villalobos H. Faderliga linjer och rättsmedicinska parametrar baserade på 23 Y-STR (Powerplex® Y23) i Mestizo-hanar från Mexico City ( Engelska) // International journal of legal medicine: journal. - 2019. - S. 199-202 . - doi : 10.1007/s00414-019-02183-1 .
- Szargut M., Diepenbroek M., Zielińska G., Cytacka S., Arciszewska J., Jałowińska K., Ossowski A. Är MPS alltid svaret? Användning av två PCR-baserade metoder för Y-kromosomal haplotypning i starkt och måttligt nedbrutet benmaterial // Forensic Science International: Genetics : journal. - 2019. - S. 181-189 . - doi : 10.1016/j.fsigen.2019.07.016 .
- Daniels-Higginbotham J., Gorden EM, Farmer SK, Spatola B., Damann F., Bellantoni N., Parson W. DNA-testning avslöjar den förmodade identiteten hos JB55, en vampyr från 1800-talet begravd i Griswold, Connecticut / - 2019. - S. 1-11 . - doi : 10.3390/gener10090636 .
- Jannuzzi J., Ribeiro J., Alho C., Arão G., Cicarelli R., Corrêa H., Mota MF Manliga linjer i brasilianska populationer och prestanda för haplogruppsprediktionsverktyg // Forensic Science International: Genetics : journal. - 2020. - Vol. 44 . - doi : 10.1016/j.fsigen.2019.102163 .
- Fóthi E., Gonzalez A., Fehér T., et al. Genetisk analys av manliga ungerska erövrare: Europeiska och asiatiska faderslinjer för de erövrande ungerska stammarna (engelska) // Archaeol Anthropol Sci : journal. - 2020. - Vol. 12 , nr. 31 . - S. 77-83 . - doi : 10.1007/s12520-019-00996-0 .
Se även
Länkar