Hammerhead ribozym

Hammerhead-ribozymer  är små självskärande RNA som har en konserverad sekvens och som finns i vissa viroider och är associerade med satellit-RNA från vissa växtvirus . [2]

Hammarhead- ribozymer upptäcktes först i växtviroider ; sådana ribozymer katalyserade den sekvensspecifika skärningen av fosfodiesterbindningar i RNA-molekyler på grund av deras specifika tertiära struktur . [3] [4] Den sekundära strukturen liknar huvudet på en hammare .  hammarhuvud .

Självreplikering

Detta ribozym är kapabelt till självreplikation. Replikering sker som ett rullande hjul [5] . RNA:t är hackat vid startpunkten för den rullande ringen. Fria deoxinukleotider börjar fästa till den frigjorda 3'-änden av denna kedja. När dotter-RNA-strängen förlängs, förskjuts 5'-änden från moderringen. När 3'- och 5'-ändarna möts vid samma punkt, stoppas RNA-syntesen och dotterringen separeras från förälderringen.

Länkar

• Sekundär struktur av Hammerhead ribozym . Virtual Laboratory Wiki . - (Bilder). Hämtad: 2009-15-10. Arkiverad från originalet den 19 mars 2012. (ryska)

• Om obetydligheten av energiuppskattning i RNA-modellering - en studie vid Wikiversity om modellering av tertiär struktur med ett hammarhuvud-ribozym som exempel

• Tertiär struktur av viroid ribozym av Chrysanthemum chlorotic mottle viroid organism, förutspådd med RNAInSpace-programvaran på YouTube Borisov, S.S. Jakovlev. Tillämpning av spelteori på problemet med ribonukleinsyravikning . (ryska)

• Modellbana för veckningen av viroid ribozym av organismen Chrysanthemum chlorotic mottle viroid, förutspådd med RNAInSpace-programvaran på YouTube Borisov, S.S. Jakovlev. Tillämpning av spelteori på problemet med ribonukleinsyravikning . (ryska)

Se även

• Ribozyme som innehåller en hårnål
• Startpunkt för replikering
• Skarvning

Anteckningar

1. ↑ Martick M., Scott WG Tertiära kontakter på avstånd från den aktiva platsen primer ett ribozym för katalys  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2006. - Vol. 126 , nr. 2 . - S. 309-320 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.06.036 . — PMID 16859740 .
2. ↑ Forster AC, Symons RH Självklyvning av plus- och minus-RNA från en virusoid och en strukturell modell för de aktiva platserna  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1987. - Vol. 49 , nr. 2 . - S. 211-220 .
3. ↑ Prody GA, Bakos JT, Buzayan JM, Schneider IR, Bruening G. Autolytic Processing of Dimeric Plant Virus Satellite RNA  //  Science: journal. - 1986. - Vol. 231 , nr. 4745 . - P. 1577-1580 . - doi : 10.1126/science.231.4745.1577 .
4. ↑ Hutchins CJ, Rathjen PD, Forster AC, Symons RH Självklyvning av plus- och minus-RNA-transkript av avocado sunblotch viroid  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 1986. - Vol. 14 , nr. 9 . - P. 3627-3640 .
5. ↑ Flores R, Navarro JA, de la Peña M, Navarro B, Ambrós S, Vera A. Viroider med hammarhuvudsribozymer: några unika strukturella och funktionella aspekter med avseende på andra medlemmar i gruppen  // Biol. Chem.. - 1999. - T. 380 , nr 7-8 . - S. 849-854 .