F box domän | |
---|---|
| |
Identifierare | |
Symbol | F-box domän |
Pfam | PF00646 |
Pfam klan | CL0271 |
Interpro | IPR001810 |
SMART | SM00256 |
PROSITE | PS50181 |
SCOP | 1fs2 |
SUPERFAMILJ | 1fs2 |
Tillgängliga proteinstrukturer | |
Pfam | strukturer |
PDB | RCSB PDB ; PDBe ; PDBj |
PDBsumma | 3D-modell |
Mediafiler på Wikimedia Commons |
F-box- proteiner är proteiner som har minst en F-box-domän. Det första F-box-proteinet som upptäcktes var en av tre komponenter i SCF-komplexet , som ubiquitinerar proteiner, som sedan bryts ned i proteasomen . F-boxar är också involverade i processer som signaltransduktion och cellcykelreglering [ 2] . I växter är många F-box-proteiner involverade i regleringen av genuttryck och gentystnad genom RNA-interferens med miRNA [3] . I mänskliga celler, under förhållanden med hög järnhalt, stabiliserar två järnatomer F-Box-proteinet FBXL5 . Det resulterande komplexet förmedlar ubiquitination av IRP2- proteinet , vilket leder till en minskning av nivån av järn i cellen.
F-box-domänen är ett strukturellt motiv av cirka 50 aminosyror som tjänar till att interagera med andra proteiner. Det upptäcktes först i cyclin F , från vilket detta motiv fick sitt namn. F-box-motivet interagerar direkt med Skp1- proteinet i SCF-komplexet [4] , och F-box-domäner är vanligtvis belägna i proteiner i närheten av andra protein-proteininteraktionsmotiv, såsom leucinrika upprepningar och WD-repetitioner , som tros utföra bindningen av målproteinet, som ubiquitineras av SCF-komplexet [5] .