F-box proteiner

F box domän

Struktur av Skp1-Skp2-proteinkomplexet (Skp2 innehåller F-box) [1] .
Identifierare
Symbol F-box domän
Pfam PF00646
Pfam klan CL0271
Interpro IPR001810
SMART SM00256
PROSITE PS50181
SCOP 1fs2
SUPERFAMILJ 1fs2
Tillgängliga proteinstrukturer
Pfam strukturer
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma 3D-modell
 Mediafiler på Wikimedia Commons

F-box- proteiner  är proteiner som har minst en F-box-domän. Det första F-box-proteinet som upptäcktes var en av tre komponenter i SCF-komplexet , som ubiquitinerar proteiner, som sedan bryts ned i proteasomen . F-boxar är också involverade i processer som signaltransduktion och cellcykelreglering [ 2] . I växter är många F-box-proteiner involverade i regleringen av genuttryck och gentystnad genom RNA-interferens med miRNA [3] . I mänskliga celler, under förhållanden med hög järnhalt, stabiliserar två järnatomer F-Box-proteinet FBXL5 . Det resulterande komplexet förmedlar ubiquitination av IRP2- proteinet , vilket leder till en minskning av nivån av järn i cellen.

F-box-domänen  är ett strukturellt motiv av cirka 50 aminosyror som tjänar till att interagera med andra proteiner. Det upptäcktes först i cyclin F , från vilket detta motiv fick sitt namn. F-box-motivet interagerar direkt med Skp1- proteinet i SCF-komplexet [4] , och F-box-domäner är vanligtvis belägna i proteiner i närheten av andra protein-proteininteraktionsmotiv, såsom leucinrika upprepningar och WD-repetitioner , som tros utföra bindningen av målproteinet, som ubiquitineras av SCF-komplexet [5] .

Anteckningar

  1. Schulman BA, Carrano AC, Jeffrey PD et al. Insikter i SCF ubiquitinligaser från strukturen av Skp1-Skp2-komplexet  //  Nature : journal. - 2000. - November ( vol. 408 , nr 6810 ). - s. 381-386 . - doi : 10.1038/35042620 . — PMID 11099048 .
  2. Craig KL, Tyers M. F-boxen: ett nytt motiv för ubiquitinberoende proteolys i cellcykelreglering och signaltransduktion   // Prog . Biophys. Mol. Biol. : journal. - 1999. - Vol. 72 , nr. 3 . - s. 299-328 . - doi : 10.1016/S0079-6107(99)00010-3 . — PMID 10581972 .
  3. Jones-Rhoades MW, Bartel DP, Bartel B. MicroRNAS och deras reglerande roller i växter  // Annu Rev Plant Biol  : journal  . - 2006. - Vol. 57 . - S. 19-53 . - doi : 10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218 . — PMID 16669754 .
  4. Bai C., Sen P., Hofmann K., Ma L., Goebl M., Harper JW, Elledge SJ SKP1 kopplar cellcykelregulatorer till ubiquitinproteolysmaskineriet genom ett nytt motiv, F   -box / Cell  :journal . - Cell Press , 1996. - Juli ( vol. 86 , nr 2 ). - S. 263-274 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80098-7 . — PMID 8706131 .
  5. Kipreos ET, Pagano M. F-box-proteinfamiljen  //  Genome Biol. : journal. - 2000. - Vol. 1 , nej. 5 . — P. RECENSIONER3002 . - doi : 10.1186/gb-2000-1-5-reviews3002 . — PMID 11178263 .

Ytterligare läsning

Länkar