Interkalering är den reversibla inkluderingen av en molekyl eller grupp mellan andra molekyler eller grupper.
Det finns flera sätt som molekyler (som kallas ligander i detta sammanhang ) kan interagera med DNA . Ligander kan binda kovalent eller elektrostatiskt, eller interkalera. Interkalering är möjlig om liganden är av lämplig storlek och kemisk natur och kan passa mellan DNA-baserna. Sådana ligander har vanligtvis en polycyklisk, aromatisk struktur och är plana. [ett]
DNA-interkalatorer används i kemoterapi för att hämma DNA-replikation i snabbväxande cancerceller , såsom doxorubicin ( adriamycin ) och daunorubicin (båda används för att behandla Hodgkins sjukdom ), och daktinomycin (används för att behandla nefroblastom , Ewings sarkomadom, och sarkom ).
Interaktionen av RNA-polymeras med DNA-mallen blockeras av antitumörantibiotikumet actinomycin D, som binder i gapen mellan intilliggande par av kvävehaltiga baser, ofta mellan GC-par (interkalationsprocess), vilket motverkar interaktionen mellan enzymet och polydeoxiribonukleotidkedjan.
Inom molekylärbiologin används interkalerande medel såsom etidiumbromid för att fluorescensmärka DNA, såsom DNA - agarosgelelektrofores . [ett]
| kemisk bindning | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Intramolekylär interaktion |
| ||||||||||||
| Intermolekylär interaktion | |||||||||||||