Okkludin

Okkludin

PDB
Tillgängliga strukturer
PDB Ortologisk sökning: PDBe , RCSB
Identifierare
SymbolOCLN  ; BLCPMG; PPP1R115
Externa ID:nOMIM:  602876 MGI :  106183 HomoloGene :  1905 GeneCards : OCLN Gene
EG-nummer2.1.1.67
ortologer
SeMänskligMus
Entrez10050665818260
EnsembleENSG00000197822ENSMUSG00000021638
UniProtQ16625Q61146
RefSeq (mRNA)NM_001205254NM_008756
RefSeq (protein)NP_001192183NP_032782
Locus (UCSC)Chr 5:
69,49 – 69,56 Mb
Chr 13:
100,5 – 100,55 Mb
Sök i PubMed[ett][2]

Occludin  är ett integrerat protein med en molekylvikt på 65 kDa, som är beläget i tight junctions och är deras huvudkomponent tillsammans med claudiner [1] . Hos människor kodas ocludin av OCLN-genen och är en polypeptid med 522 aminosyror [2] [3] .

Detta protein beskrevs första gången 1993 av Shoichiro Tsukita [1] .

Lokalisering av OCLN-genen

OCLN-genen är lokaliserad på den långa (q) armen av kromosom 5 vid position q13.1. Den börjar på 69492292 baspar och sträcker sig till 69558104 baspar och är 65813 baspar lång. Som ett resultat av alternativ splitsning uttrycks två isoformer [4] .

Proteinstruktur

Det finns 9 domäner i den mänskliga strukturen, uppdelade i två grupper. Den första gruppen kombinerar 5 domäner lokaliserade intracellulärt och extracellulärt, och den andra gruppen kombinerar 4 transmembrandomäner. Dessa 9 domäner är följande:

C-terminaldomänen krävs för att skapa tight junctions på rätt sätt. Det interagerar också med flera cytoplasmatiska proteiner i kopplingsskivan och signalmolekyler som är ansvariga för cellöverlevnad, och dess N-terminala domän är involverad i kompakterade täta förbindelser. Den extracellulära slingan av ocludin är involverad i regleringen av paracellulär permeabilitet, och den extracellulära domänen 2 är involverad i tight junction-lokalisering.

Funktioner

Occludin är viktigt för att tight junctions ska fungera. Den bestämmer tätheten av täta korsningar och spelar en viktig roll för att tillhandahålla barriärfunktionen.

Anteckningar

  1. 1 2 Furuse M., Hirase T., Itoh M., Nagafuchi A., Yonemura S., Tsukita S., Tsukita S. Occlusin: a novel integral membrane protein localizing at tight junctions  (neopr.)  // Journal of Cell Biologi. - 1993. - T. 123 , nr 6 Pt 2 . - S. 1777-1788 . - doi : 10.1083/jcb.123.6.1777 . — PMID 8276896 .
  2. Ando-Akatsuka Y., Saitou M., Hirase T., Kishi M., Sakakibara A., Itoh M., Yonemura S., Furuse M., Tsukita S. Interspecies mångfald av occludinsekvensen: cDNA-kloning av människa, mus, hund och råtta-känguru homologer  //  Journal of Cell Biology : journal. - 1996. - Maj ( vol. 133 , nr 1 ). - S. 43-47 . doi : 10.1083 / jcb.133.1.43 . — PMID 8601611 .
  3. Entrez-gen: OCLN occludin .
  4. [https://web.archive.org/web/20160512030946/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/100506658 Arkiverad 12 maj 2016 på Wayback Machine OCLN occludin [Homo sapiens (människa) ]-Gene-NCBI]