Pseudouridin

pseudouridin
Allmän
Systematiskt
namn
5-[​( 2S ,3R ,4S , 5R ) ​- ​3,4- ​dihydroxi- ​5-​​(hydroximetyl)​-​oxolan-​2-​yl]-​1 H -pyrimidin-2,4-dion
Chem. formel C9H12N2O6 _ _ _ _ _ _ _
Fysikaliska egenskaper
stat Vitt granulärt pulver
Molar massa 244,20 g/ mol
Kemiska egenskaper
Löslighet
 • i vatten mycket lösligt i vatten
Klassificering
Reg. CAS-nummer 1445-07-4
PubChem
LEDER   O=C1N\C=C(/C(=O)N1)[C@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]2O
InChI   InChI=1S/C9H12N2O6/c12-2-4-5(13)6(14)7(17-4)3-1-10-9(16)11-8(3)15/h1,4-7, 12-14H,2H2,(H2,10,11,15,16)/t4-,5-,6-,7+/m1/s1PTJWIQPHWPFNBW-GBNDHIKLSA-N
CHEBI 17802
ChemSpider
Data baseras på standardförhållanden (25 °C, 100 kPa) om inget annat anges.
 Mediafiler på Wikimedia Commons

Pseudouridin (förkortad som den grekiska bokstaven Ψ ) är en C -glykosid, en isomer av uridinnukleosiden . Det är den vanligast förekommande modifierade basen av över hundra olika modifierade baser som förekommer i RNA [1] . Pseudouridin förekommer i alla arter och många klasser av RNA [2] [3] [4] [5] . Det syntetiseras av enzymet pseudouridinsyntas, som post-transkriptionellt isomeriserar vissa uridinrester i RNA. Denna process kallas pseudouridinylering [6] .

Det är brett distribuerat i tRNA , där det är komplexbundet med tymidin och cytosin i den så kallade TΨC-armen. Syftar på den konservativa, invarianta delen av tRNA. Funktionen av pseudouridin i RNA är fortfarande oklar, men det antas spela en roll i interaktion med aminoacyltransferaser och därför i translationsinitiering . Nyligen genomförda studier har visat att det kan ge skydd mot strålning [7] .

Se även

Anteckningar

  1. Hamma T., Ferré-D'Amaré AR Pseudouridinsyntaser  (neopr.)  // Chem. Biol.. - 2006. - T. 13 , nr 11 . - S. 1125-1135 . - doi : 10.1016/j.chembiol.2006.09.009 . — PMID 17113994 .
  2. Charette M., Grey MW Pseudouridine i RNA: vad, var, hur och varför  (neopr.)  // IUBMB Life. - 2000. - T. 49 , nr 5 . - S. 341-351 . - doi : 10.1080/152165400410182 . — PMID 10902565 .
  3. Liang XH, Xu YX, MIchaeli S. Det skarvade ledarassocierade RNA:t är ett trypanosomspecifikt sn(o)-RNA som har potential att styra pseudouridinbildningen på SL-RNA  //  RNA : journal. - 2002. - Vol. 8 , nr. 2 . - s. 237-246 . - doi : 10.1017/S1355838202018290 . — PMID 11911368 .
  4. Carlile Thomas. Pseudouridinprofilering avslöjar reglerad mRNA-pseudouridylering i jästceller och mänskliga celler  //  Nature : journal. - 2014. - 5 september. - doi : 10.1038/nature13802 .
  5. Schwartz Schraga. Transkriptomomfattande kartläggning avslöjar utbredd dynamisk reglerad pseudouridylering av ncRNA och mRNA  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2014. - 11 september. - doi : 10.1016/j.cell.2014.08.028 .
  6. Ferré-D'Amaré AR RNA-modifierande enzymer   // Curr . Opin. Struktur. Biol.. - 2003. - Vol. 13 , nr. 1 . - S. 49-55 . - doi : 10.1016/S0959-440X(02)00002-7 . — PMID 12581659 .
  7. Monob, Manami; Arimoto-Kobayashi, Sakae; Ando, ​​Koichi. β-Pseudouridin, en ölkomponent, minskar strålningsinducerade kromosomavvikelser i humana lymfocyter  //  Mutationsforskning. Genetisk toxikologi och miljömutagenes: tidskrift. - 2003. - Vol. 538 , nr. 1-2 . - S. 93-99 . - doi : 10.1016/S1383-5718(03)00094-9 . — PMID 12834758 .