Affinitet (biokemi)

Inom biokemi är affinitet (även bindningsaffinitet ) ett mått på molekylers tendens att binda till andra molekyler, till exempel mellan bindningspartners i en protein- ligandinteraktion : ju högre affinitet, desto större är associationskonstanten Ka ( även kallad bindningskonstanten).

Egenskaper

Men för närvarande, istället för associationskonstanten, används vanligtvis det omvända måttet, dissociationskonstanten Kd : ju högre affinitet proteinet har för dess ligand, desto lägre är dissociationskonstanten för komplexet. Om exemplet med bildning/klyvning av enzym-substratkomplexet [ES].

definitioner enligt lagen om massverkan eller kinetiska konstanter (hastighetskonstanter k) listas här:

associationskonstant (bindningskonstant)	$K_{a}={[ES] \över [E]\cdot [S]}$	$K_{a}={k_{1} \over k'_{1}}$
dissociationskonstant	$K_{d}={[E]\cdot [S] \över [ES]}$	$K_{d}={k'_{1} \over k_{1))$ .

I enzymkinetik används ibland Km , Michaelis-konstanten , som ett mått på ett enzyms affinitet för dess substrat. I praktiken har detta en viss rätt, men teoretiskt sett måste dissociationskonstanten för ES-komplexet K d och Michaelis-konstanten strängt särskiljas. Enligt Briggs och Haldane beror Michaelis-konstanten också på antalet förändringar k 2 och beräknas enligt följande:

K_{m}={k'_{1}+k_{2} \över k_{1))

Härledning från K m till Kd är endast möjlig om . Detta antagande är inte lämpligt i alla fall, men gjordes ursprungligen av Leonor Michaelis och Maud Menten för att härleda Michaelis-Menten-ekvationen . ${\displaystyle k_{2}\ll k'_{1))$

Affinitet kan bestämmas med hjälp av en ligandbindningsanalys .

Se även

Litteratur

Jeremy M. Berg, John L. Timochko, Lubert Strayer: Biokemi. 6:e upplagan, Spectrum Academic Publishing, Heidelberg, 2007. ISBN 978-3-8274-1800-5 .
Donald Voet, Judith G. Voet: Biokemi. 3. Edition, John Wiley & Sons, New York, 2004. ISBN 0-471-19350-X .
Bruce Alberts , Alexander Johnson, Peter Walter, Julian Lewis, Martin Ruff, Keith Roberts: The Molecular Biology of the Cell , 5. Edition, Taylor och Francis, 2007, ISBN 978-0-8153-4106-2 .