Transduktion (genetik)

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 18 augusti 2020; kontroller kräver 5 redigeringar .

Transduktion (från latin  transductio- rörelse) är processen att överföra DNA mellan celler med hjälp av virus [1] [2] . Ett exempel på transduktion är överföring av bakteriellt DNA från en cell till en annan av en bakteriofag . Generell transduktion används inom bakteriell genetik för genomkartläggning . Både tempererade och virulenta fager är kapabla till transduktion , de senare förstör dock bakteriepopulationen , så transduktion med deras hjälp är av liten betydelse vare sig i naturen eller i forskning.

Transduktion beskrevs av Norton Zinder och Joshua Lederberg 1952 i Salmonella [3] . De observerade återställandet av normala fenotyper i auxotrofa stammar , och bevisade att endast ett virus kunde utföra överföringen av genetiskt material [4] .

Mekanism

Transduktion är den fagförmedlade överföringen av DNA mellan bakterieceller. Nyckelsteget i denna process är packningen av det överförda DNA:t i huvudet på fagen under den lytiska fasen av dess livscykel , det vill säga när cellen dör, frigör viruspartiklar utåt . Under monteringen av virala partiklar kommer som regel dess eget DNA in i fagens huvud, men ibland uppstår fel när fragment av bakteriellt DNA kommer in i fagens huvud, som till exempel kan bildas under förstörelsen av bakteriell kromosom orsakad av fagen . Fagpartiklar som innehåller fragment av bakteriellt DNA kallas transducerande partiklar. De kan infektera celler som normala fager, eftersom de har alla gener som behövs för detta . När en fag, efter att ha fäst sig till en cell, injicerar sitt genomiska DNA i den, injicerar den också det bakteriella DNA som finns i dess huvud [5] . Märkligt nog är transduktion också möjlig under den lytiska cykeln [6] .

Alla fager är inte kapabla till transduktion. Endast de fager är kapabla till det som orsakar fragmentering av bakteriellt genomiskt DNA till fragment av rätt storlek för att passa in i kapsiden . Ibland är det inte bakteriens genomiska DNA som kommer in i virionet, utan plasmiden , som efter att ha kommit in i nästa infekterade cell kommer att fortsätta att fördubblas. Genomfragment som bärs av fager är å andra sidan oförmögna till replikering ; deras fördubbling är möjlig endast om de kan integreras i kromosomen hos mottagarbakterien [5] . Om ett fragment av bakteriegenomet förblir fritt, kommer det under flera generationer att falla in i en av dottercellerna under delning ; sådan transduktion kallas abortiv [7] [8] .

När fager går från den lysogena till den lytiska fasen av livscykeln och klipps ut från värdgenomet, tar de ibland med sig små portioner av bakteriellt DNA. Eftersom i dessa fall mängden bakteriellt DNA som har kommit in i viruspartikeln är mycket liten och begränsas av en eller flera gener, kallas sådan transduktion specialiserad [5] . Således kan λ-fagen av E. coli Escherichia coli transducera endast två gener: gal , som är ansvarig för assimileringen av galaktos , och bio , involverad i syntesen av biotin . Ibland kan så kallade heterogena celler uppstå, det vill säga celler där genen som bärs av någon fag finns både i fri form och som en del av genomet [7] .

Transduktionsmapping

Transduktion användes för att kartlägga generna hos bakteriella kromosomer. Metoden bygger på att bakteriella DNA-fragment som överförs under transduktion är ganska stora och kan innehålla ett antal gener, så nära belägna gener kan överföras samtidigt under transduktion (samtransduktion). Ju färre gener som är kopplade , desto mindre samtransduktion observeras. Baserat på denna information är det möjligt att återställa ordningen för generna på bakteriekromosomen [8] .

Anteckningar

  1. Stor sovjetisk uppslagsverk - Transduktion; Lit.: Stent G., Molecular biology of bacterial viruses, trans. från English, M., 1965; hans, Molecular Genetics, övers. från engelska, M., 1974, kap. fjorton.
  2. https://biomolecula.ru/articles/molekuliarnoe-klonirovanie-ili-kak-zasunut-v-kletku-chuzherodnyi-geneticheskii-material "transduktion är införandet av en viral vektor i alla celler."
  3. ZINDER ND , LEDERBERG J. Genetiskt utbyte i Salmonella.  (engelska)  // Journal Of Bacteriology. - 1952. - November ( vol. 64 , nr 5 ). - s. 679-699 . — PMID 12999698 .
  4. Klug et al., 2016 , sid. 276-277.
  5. 1 2 3 Dale & Park, 2004 , sid. 178-180.
  6. Klug et al., 2016 , sid. 278.
  7. 1 2 Inge-Vechtomov, 2010 , sid. 253.
  8. 1 2 Klug et al., 2016 , sid. 279.

Litteratur