KORT (domän)

Caspase rekryteringsdomän

Strukturen för ett RAID-KORT. [ett]
Identifierare
Symbol KORT
Pfam PF00619
Interpro IPR001315
SMART SM00114
PROSITE PS50209
SCOP 3:a
SUPERFAMILJ 3:a
CDD cd01671
Tillgängliga proteinstrukturer
Pfam strukturer
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma 3D-modell

CARD (förkortat från engelska  Caspase recruitment domains , eller Caspase activation and recruitment domains ) - kaspasaktiverings- och rekryteringsdomäner , är interaktionsmotiv som finns i ett brett spektrum av proteiner, vanligtvis involverade i processer associerade med inflammation och apoptos . Dessa domäner förmedlar bildandet av större proteinkomplex genom direkta interaktioner mellan individuella CARD-innehållande proteiner. CARD-domäner finns i ett anmärkningsvärt brett spektrum av proteiner, inklusive helikaser , kinaser , mitokondriella proteiner, kaspaser och andra cytoplasmatiska faktorer.

Nyckelfunktioner

CARD-domäner är en underklass av ett proteinmotiv som kallas dödsvecket, som innehåller sex till sju antiparallella alfa-helixar med en hydrofob kärna (kärna) och en yttre yta som består av laddade aminosyrarester . Andra motiv i denna klass inkluderar pyrindomän (PYD), dödsdomän (DD) och dödseffektordomän (DED), som alla också är involverade primärt i regleringen av apoptos och inflammatoriska svar.

Engagemang i apoptos

CARD-domäner har tidigare karaktäriserats av kaspasaktivering och apoptos [2] . Den grundläggande sex-helixstrukturen i regionen verkar vara bevarad så långt tillbaka som ced-3- och ced-4- generna i C. elegans , organismen i vilken flera komponenter i den apoptotiska apparaten först beskrevs. KORT-motiv finns i ett antal proteiner som främjar apoptos, framför allt däggdjurskaspaser 1,2,4,5 , 9 och 15 .

Deltagande i inflammation

Lista över CARD-innehållande proteiner

Anteckningar

  1. Chou JJ, Matsuo H., Duan H., Wagner G. Lösningsstruktur för RAIDD-KORTET och modell för KORT/KORT-interaktion vid rekrytering av caspase-2 och caspase-9  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1998. - Juli ( vol. 94 , nr 2 ). - S. 171-180 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81417-8 . — PMID 9695946 .
  2. Hofmann K., Bucher P., Tschopp J.  CARD -domänen: ett nytt apoptotisk signaleringsmotiv  // Trends Biochem Sci : journal. - 1997. - Vol. 22 , nr. 5 . - S. 155-156 . - doi : 10.1016/S0968-0004(97)01043-8 . — PMID 9175472 .