HMG20B

High Mobility Group 20B

Det preliminära budgetförslaget är baserat på 2crj.

Tillgängliga strukturer

Ortologisk sökning: PDBe , RCSB

Lista över PDB-ID
2crj

Identifierare

Symbol

HMG20B ; BRAF25; BRAF35; HMGX2; HMGXB2; PP7706; SMARCE1r; SOXL; pp8857

Externa ID:n

OMIM: 605535 MGI : 1341190 HomoloGene : 74949 GeneCards : HMG20B Gene

Genontologi
Fungera	• DNA-bindning • proteinbindning • proteinheterodimeriseringsaktivitet
cellkomponent	• kärna • nukleoplasma • kromosom • nukleolus
biologisk process	• transkription, DNA-mallad • reglering av transkription, DNA-mallad • cellcykel • blodkoagulering • kromatinmodifiering • negativ reglering av proteinsumoylering • skelettmuskelcelldifferentiering • positiv reglering av neurondifferentiering
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 19:
3,57 – 3,58 Mb

Chr 10:
81,35 – 81,35 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

SWI/SNF-associerad, mallassocierad aktinberoende kromatinregulator, 1-beroende medlem av E-underfamiljen , är ett protein som kodas hos människor av HMG20B -genen [1] [2] .

Interaktioner

HMG20B har visats interagera med KIF4A [3] , HDAC1 [4] , histondeacetylas 2 [4] [5] , PHF21A [4] [6] , RCOR1 [4] och BRCA2 [4] [7] .

Anteckningar

↑ Sumoy L., Carim L., Escarceller M., Nadal M., Gratacos M., Pujana MA, Estivill X., Peral B. HMG20A och HMG20B kartlägger mänskliga kromosomer 15q24 och 19p13.3 och utgör en distinkt klass av HMG -boxgener med allestädes närvarande uttryck // Cytogenetics and Genome Research : journal. - 2000. - Juni ( vol. 88 , nr 1-2 ). - S. 62-7 . - doi : 10.1159/000015486 . — PMID 10773667 .
↑ Entrez-gen: HMG20B högrörlighetsgrupp 20B . Arkiverad från originalet den 5 december 2010. (obestämd)
↑ Lee, Young Mi; Kim Wankee. Association av human kinesin superfamilj protein medlem 4 med BRCA2-associerad faktor 35 // Biochemical Journal : journal. — England, 2003. — September ( vol. 374 , nr. Pt 2 ). - s. 497-503 . - doi : 10.1042/BJ20030452 . — PMID 12809554 .
↑ 1 2 3 4 5 Hakimi, Mohamed-Ali; Bochar Daniel A; Chenoweth Josh; Lane William S; Mandel Gail; Shiekhattar Ramin. Ett kärn-BRAF35-komplex innehållande histon-deacetylas förmedlar repression av neuronspecifika gener (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - USA, 2002. - Maj ( vol. 99 , nr 11 ). - P. 7420-7425 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. En kandidatgen för X-länkad mental retardation är en komponent i en ny familj av histon-deacetylas-innehållande komplex (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - USA, 2003. - Februari ( vol. 278 , nr 9 ). - P. 7234-7239 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
↑ Iwase, Shigeki; Januma Aya; Miyamoto Kiyoko; Shono Naomi Honda Arata; Yanagisawa Junn; Baba Tadashi. Karakterisering av BHC80 i BRAF-HDAC-komplex, involverad i neuronspecifik genrepression // Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation : journal. - USA, 2004. - September ( vol. 322 , nr 2 ). - s. 601-608 . — ISSN 0006-291X . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
↑ Marmorstein, LY; Kinev A.V.; Chan GK; Bochar D.A.; Beniya H; Epstein JA; Yen TJ; Shiekhattar R. Ett humant BRCA2-komplex som innehåller en strukturell DNA-bindande komponent påverkar cellcykelprogression // Cell : journal. - USA: Cell Press , 2001. - Januari ( vol. 104 , nr 2 ). - S. 247-257 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . — PMID 11207365 .

Litteratur

Wattler F., Wattler S., Kelly M., et al. Kloning, kromosomal lokalisering och expressionsanalys av murin Smarce1-relaterad, en ny medlem av högmobilitet 365 grupp genfamiljen // Genomics: journal. - 1999. - Vol. 60 , nej. 2 . - S. 172-178 . - doi : 10.1006/geno.1999.5913 . — PMID 10486208 .
Marmorstein LY, Kinev AV, Chan GK, et al. Ett humant BRCA2-komplex som innehåller en strukturell DNA-bindande komponent påverkar cellcykelprogression // Cell : journal. - Cell Press , 2001. - Vol. 104 , nr. 2 . - S. 247-257 . - doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . — PMID 11207365 .
Lee YM, Shin H., Choi W., et al. Karakterisering av humant SMARCE1r högmobilitetsgruppprotein (engelska) // Biochimica et Biophysica Acta : journal. - 2002. - Vol. 1574 , nr. 3 . - s. 269-276 . - doi : 10.1016/s0167-4781(01)00373-6 . — PMID 11997092 .
Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., et al. Ett kärn-BRAF35-komplex innehållande histon-deacetylas förmedlar repression av neuronspecifika gener (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2002. - Vol. 99 , nr. 11 . - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
Wang C., McCarty IM, Balazs L., et al. Kloning av ett cDNA som kodar för ett alternativt splitsat protein av BRCA2-associerad faktor 35 // Biokemiska och biofysiska forskningskommunikationer : journal. - 2002. - Vol. 295 , nr. 1 . - S. 129-135 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00624-1 . — PMID 12083779 .
Wang C., McCarty IM, Balazs L., et al. Immunohistologisk detektion av BRAF25 i humana prostatatumör- och cancerprover // Biokemiska och biofysiska forskningskommunikationer : journal. - 2002. - Vol. 295 , nr. 1 . - S. 136-141 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00625-3 . — PMID 12083780 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds cDNA-sekvenser för människor och mus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, et al. En kandidatgen för X-länkad mental retardation är en komponent i en ny familj av histon-deacetylas-innehållande komplex (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
Lee YM, Kim W. Association of human kinesin superfamily protein member 4 with BRCA2-associated factor 35 // Biochemical Journal : journal. - 2003. - Vol. 374 , nr. Pt 2 . - s. 497-503 . - doi : 10.1042/BJ20030452 . — PMID 12809554 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 fullängds humana cDNA // Nature Genetics : journal . - 2004. - Vol. 36 , nr. 1 . - S. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Grimwood J., Gordon LA, Olsen A., et al. DNA-sekvensen och biologin hos mänsklig kromosom 19 (engelska) // Nature : journal. - 2004. - Vol. 428 , nr. 6982 . - s. 529-535 . - doi : 10.1038/nature02399 . — PMID 15057824 .
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., et al. Karakterisering av BHC80 i BRAF-HDAC-komplex, involverad i neuronspecifik genrepression // Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation : journal. - 2004. - Vol. 322 , nr. 2 . - s. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genome Research : journal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K., Hao T., et al. Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket (engelska) // Nature : journal. - 2005. - Vol. 437 , nr. 7062 . - P. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .