RCOR1

REST corepressor 1

PDB representeras av 2iw5 som ett exempel.

Tillgängliga strukturer

Ortologisk sökning: PDBe , RCSB

Lista över PDB-ID
2IW5 , 2UXN , 2UXX , 2V1D , 2X0L , 2XAF , 2XAG , 2XAH , 2XAJ , 2XAQ , 2XAS , 2Y48 , 3ZMS , 3ZMT , 3ZMZ 1 , 3ZM_4 , 3ZM 0 , 3ZM __ _ _

Identifierare

Symbol

RCOR1 ; COREST; RCOR

Externa ID:n

OMIM: 607675 MGI : 106340 HomoloGene : 32246 GeneCards : RCOR1 Gene

Genontologi
Fungera	• RNA-polymeras II kärnpromotor proximal region sekvensspecifik DNA-bindande transkriptionsfaktoraktivitet involverad i negativ reglering av transkription • kromatinbindning • proteinbindning • DNA-bindning för transkriptionsreglerande region
cellkomponent	• kärna • nukleoplasma • nukleolus • transkriptionsrepressorkomplex
biologisk process	• negativ reglering av transkription från RNA-polymeras II-promotor • transkription, DNA-mall • blodkoagulation • viral process • negativ reglering av transkription, DNA-mall • histon H4-deacetylering
Källor: Amigo / QuickGO

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 14:
103,06 – 103,2 Mb

Chr 12:
111,04 – 111,12 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

Corepressorn REST 1 , även känd som CoREST , är ett protein som kodas hos människor av RCOR1 -genen . [1] [2]

Funktion

Denna gen kodar för ett protein som är välbevarat, undertryckt vid födseln och med en specifik roll för att bestämma neuronal differentiering. Det kodade proteinet binder till den C-terminala domänen av REST ( repressor element-1 silencing transcription factor ). [ 2]

Interaktioner

RCOR1 har visat sig interagera med:

HDAC1 , [3] [4]
HDAC2 , [3] [4]
HMG20B , [3]
REST (biologi) [5] och
PHF21A . [3] [6]

Anteckningar

↑ Andrés ME, Burger C., Peral-Rubio MJ, Battaglioli E., Anderson ME, Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: en funktionell corepressor som krävs för reglering av neuralspecifikt genuttryck ( Engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1999. - September ( vol. 96 , nr 17 ). - P. 9873-9878 . - doi : 10.1073/pnas.96.17.9873 . — PMID 10449787 .
↑ 1 2 Entrez-gen: RCOR1 REST corepressor 1 . Arkiverad från originalet den 5 december 2010. (obestämd)
↑ 1 2 3 4 Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. Ett kärn-BRAF35-komplex som innehåller histondeacetylas förmedlar förtryck av neuronspecifika gener (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 2002. - Maj ( vol. 99 , nr 11 ). - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
↑ 1 2 You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST är en integrerad komponent av CoREST-human histondeacetylaskomplex // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2001. - Februari ( vol. 98 , nr 4 ). - P. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
↑ Andrés ME, Burger C., Peral-Rubio MJ, Battaglioli E., Anderson ME, Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: en funktionell corepressor som krävs för reglering av neuralspecifikt genuttryck ( Engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1999. - August ( vol. 96 , nr 17 ). - P. 9873-9878 . - doi : 10.1073/pnas.96.17.9873 . — PMID 10449787 .
↑ Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Karakterisering av BHC80 i BRAF-HDAC-komplex, involverad i neuronspecifik genrepression // Biokemisk och biofysisk forskning Kommunikationer : journal. - 2004. - September ( vol. 322 , nr 2 ). - s. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .

Litteratur

Nomura N., Nagase T., Miyajima N., Sazuka T., Tanaka A., Sato S., Seki N., Kawarabayasi Y., Ishikawa K., Tabata S. Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. II. De kodande sekvenserna för 40 nya gener ( KIAA0041 -KIAA0080) härledda genom analys av cDNA-kloner från mänsklig cellinje KG-1 // DNA Research : journal. - 1994. - Vol. 1 , nej. 5 . - S. 223-229 . - doi : 10.1093/dnares/1.5.223 . — PMID 7584044 .
Andersson B., Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W., Gibbs RA En "dubbel adapter"-metod för förbättrad konstruktion av hagelgevärsbibliotek // Analytical Biochemistry : journal. - 1996. - Vol. 236 , nr. 1 . - S. 107-113 . - doi : 10.1006/abio.1996.0138 . — PMID 8619474 .
Yu W., Andersson B., Worley KC, Muzny DM, Ding Y., Liu W., Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G., Gibbs RA Storskalig konkatenering av cDNA-sekvensering // Genomforskning : journal. - 1997. - Vol. 7 , nr. 4 . - s. 353-358 . - doi : 10.1101/gr.7.4.353 . — PMID 9110174 .
Grimes JA, Nielsen SJ, Battaglioli E., Miska EA, Speh JC, Berry DL, Atouf F., Holdener BC, Mandel G., Kouzarides T. Medrepressorn mSin3A är en funktionell komponent i REST-CoREST-repressorkomplexet ( Engelska) // Journal of Biological Chemistry : tidskrift. - 2000. - Vol. 275 , nr. 13 . - P. 9461-9467 . doi : 10.1074 / jbc.275.13.9461 . — PMID 10734093 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA DNA-kloning med in vitro platsspecifik rekombination // Genome Research : journal. - 2000. - Vol. 10 , nej. 11 . - P. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Humphrey GW, Wang Y., Russanova VR, Hirai T., Qin J., Nakatani Y., Howard BH Stabila histondeacetylaskomplex kännetecknas av närvaron av SANT-domänproteinerna CoREST/kiaa0071 och Mta-L1 (engelska) // Journal of Biologisk kemi : tidskrift. - 2001. - Vol. 276 , nr. 9 . - P. 6817-6824 . - doi : 10.1074/jbc.M007372200 . — PMID 11102443 .
You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST är en integrerad komponent i CoREST-human histondeacetylaskomplex (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2001. - Vol. 98 , nr. 4 . - P. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
Ballas N., Battaglioli E., Atouf F., Andres ME, Chenoweth J., Anderson ME, Burger C., Moniwa M., Davie JR, Bowers WJ, Federoff HJ, Rose DW, Rosenfeld MG, Brehm P., Mandel G. Reglering av neuronala egenskaper genom ett nytt transkriptionskomplex // Neuron : journal. - Cell Press , 2001. - Vol. 31 , nr. 3 . - s. 353-365 . - doi : 10.1016/S0896-6273(01)00371-3 . — PMID 11516394 .
Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. Ett kärn-BRAF35-komplex som innehåller histondeacetylas förmedlar undertryckande av neuronalspecifika gener (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United Amerikas stater : tidskrift. - 2002. - Vol. 99 , nr. 11 . - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
Battaglioli E., Andrés ME, Rose DW, Chenoweth JG, Rosenfeld MG, Anderson ME, Mandel G. REST-repression av neuronala gener kräver komponenter i hSWI.SNF-komplexet // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 43 . - P. 41038-41045 . - doi : 10.1074/jbc.M205691200 . — PMID 12192000 .
Lunyak VV, Burgess R., Prefontaine GG, Nelson C., Sze SH, Chenoweth J., Schwartz P., Pevzner PA, Glass C., Mandel G., Rosenfeld MG Corepressorberoende tystnad av kromosomala regioner som kodar neuronala gener // Vetenskap: tidskrift. - 2002. - Vol. 298 , nr. 5599 . - P. 1747-1752 . - doi : 10.1126/science.1076469 . — PMID 12399542 .
Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. En kandidatgen för X-länkad mental retardation är en komponent i en ny familj av histon-deacetylas-innehållande komplex (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Karakterisering av BHC80 i BRAF-HDAC-komplex, involverad i neuronspecifik genrepression (engelska) // Biokemiska och Biofysisk forskningskommunikation : journal. - 2004. - Vol. 322 , nr. 2 . - s. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
Gu H., Liang Y., Mandel G., Roizman B. Komponenter i REST/CoREST/histondeacetylas-repressorkomplexet störs, modifieras och translokeras i HSV-1-infekterade celler (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 2005. - Vol. 102 , nr. 21 . - P. 7571-7576 . - doi : 10.1073/pnas.0502658102 . — PMID 15897453 .
Lee MG, Wynder C., Cooch N., Shiekhattar R. En viktig roll för CoREST i nukleosomal histon 3 lysin 4 demetylering // Nature: journal. - 2005. - Vol. 437 , nr. 7057 . - S. 432-435 . - doi : 10.1038/nature04021 . — PMID 16079794 .
Shi YJ, Matson C., Lan F., Iwase S., Baba T., Shi Y. Reglering av LSD1-histondemetylasaktivitet genom dess associerade faktorer // Molecular Cell : journal. - 2005. - Vol. 19 , nr. 6 . - s. 857-864 . - doi : 10.1016/j.molcel.2005.08.027 . — PMID 16140033 .
Nousiainen M., Silljé HH, Sauer G., Nigg EA, Körner R. Fosfoproteomanalys av den mänskliga mitotiska spindeln (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2006. - Vol. 103 , nr. 14 . - P. 5391-5396 . - doi : 10.1073/pnas.0507066103 . — PMID 16565220 .