NS5B

Icke-strukturellt protein 5B ( NS5B ) är ett protein från hepatit C-virus (HCV) [1] . Det är ett RNA-polymeras , dess nyckelfunktion är replikeringen av viralt RNA från den virala RNA-positiva strängen som en mall för att katalysera rNTP-polymerisation under RNA-replikation [2] [3] [4] .

Flera kristallstrukturer av NS5B-polymeras i flera kristallformer har identifierats baserat på konsensussekvensen för CD (HCV-CD genotyp 1) [5] .

Strukturen liknar en högerhandsform med en handflata och fingrar, omgiven av en aktiv plats unik för NS5B, en palminnehållen proteinstruktur.

Läkemedel riktade mot NS5B

Flera läkemedel på marknaden eller i olika forskningsstadier riktar sig mot NS5B som ett sätt att förhindra ytterligare viral RNA-replikation och därför behandla eller bota HCV [6] :

• Beclabuvir , för närvarande i kliniska prövningar
• Dasabuvir (Viekira Pak), icke-nukleosidhämmare/nukleotidanaloger, FDA godkänd december 2014 (endast i kombination med ombitasvir , paritaprevir och ritonavir )
• Deleobuvir , utvecklingen stannar
• Filibuvir , utvecklingen stannar
• Radalbuvir , för närvarande i kliniska prövningar
• Setrobuvir , utvecklingen avstannar
• Sofosbuvirnukleotidanalog godkänd av FDA i december 2013 (Sovaldi; Harvoni (kombination med ledipasvir )).

Se även

• NS5A

Anteckningar

1. ↑ Gehring S., Gregory SH, Wintermeyer P., Aloman C., Wands JR Generering av immunsvar mot HCV med hjälp av dendritiska celler som innehåller NS5-proteinbelagda mikropartiklar   // Clin . Vaccin Immunol. : journal. - 2008. - December ( vol. 16 , nr 2 ). - S. 163-171 . - doi : 10.1128/CVI.00287-08 . — PMID 19091993 .
2. ↑ Z; jin; Leveque, V; Ma, H; Johnson, K.A.; Klumpp, K. Montering, rening och kinetisk analys av aktivt RNA-beroende RNA-polymerasförlängningskomplex före steady-state  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2012. - Vol. 287 , nr. 13 . - P. 10674-10683 . - doi : 10.1074/jbc.M111.325530 . — PMID 22303022 .
3. ↑ Moradpour, D; Penin, F; Rice, CM Replikation av hepatit C-virus  (neopr.)  // Naturrecensioner. mikrobiologi. - 2007. - V. 5 , nr 6 . - S. 453-463 . - doi : 10.1038/nrmicro1645 . — PMID 17487147 .
4. ↑ Rigat, K.; Wang, Y.; Hudyma, TW; Ding, M.; Zheng, X.; Gentles, R.G.; Beno, B.R.; Gao, M.; Roberts, SB Ligand-inducerade förändringar i hepatit C-virus NS5B-polymerasstruktur  //  Antiviral Research : journal. - 2010. - Vol. 88 , nr. 2 . - S. 197-206 . doi : 10.1016 / j.antiviral.2010.08.014 . — PMID 20813137 .
5. ↑ Biswal, BK; Cherney, M.M.; Wang, M.; Chan, L.; Yannopoulos, C.G.; Bilimoria, D.; Nicholas, O.; Bedard, J.; James, MN Kristallstrukturer av det RNA-beroende RNA-polymeraset genotyp 2a av hepatit C-virus avslöjar två konformationer och föreslår mekanismer för hämning av icke-nukleosidhämmare  // The  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2005. - Vol. 280 , nr. 18 . - P. 18202-18210 . - doi : 10.1074/jbc.M413410200 . — PMID 15746101 .
6. ↑ Biswal, BK Icke-nukleosidhämmare som binder till hepatit C-virus NS5B-polymeras avslöjar en ny hämningsmekanism  //  Journal of Molecular Biology : journal. - 2006. - Vol. 361 , nr. 1 . - S. 33-45 . - doi : 10.1016/j.jmb.2006.05.074 . — PMID 16828488 .