POLR2C

Polypeptid C RNA-polymeras II (guidad DNA)

Identifierare

POLR2C ; RPB3; RPB31; hRPB33; hsRPB3

Externa ID:n

OMIM: 180663 MGI : 109299 HomoloGene : 2017 GeneCards : POLR2C Gene

2.7.7.6

Genontologi
Fungera	• RNA-polymeras II-aktivitet • DNA-bindning • proteindimeriseringsaktivitet
cellkomponent	• kärna • nukleoplasma • DNA-riktat RNA-polymeras II, kärnkomplex • nukleolus • cytoplasma • mikrotubuli cytoskelett
biologisk process	• mRNA-splitsning, via spliceosom • DNA-reparation • transkriptionskopplad nukleotid-excisionsreparation • nukleotid-excisionsreparation • transkription från RNA-polymeras II-promotor • transkriptionsinitiering från RNA-polymeras II-promotor • transkriptionsförlängning från RNA-polymeras II-promotor • 7-metylguanosin-mRNA-kapsling • RNA - splitsningsgen uttryck • viral process • positiv reglering av viral transkription
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 16:
57,5 – 57,51 Mb

Chr 8:
94,86 – 94,86 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

RPB3-subenheten av DNA-styrt RNA-polymeras II är ett enzym som kodas hos människor av POLR2C -genen . [ett]

Funktion

Denna gen kodar för den tredje största subenheten av RNA-polymeras II , polymeraset som ansvarar för syntesen av budbärar -RNA i eukaryoter . Produkten av denna gen innehåller en cysteinrik region och existerar som en heterodimer med en annan polymerassubenhet, POLR2J . Dessa två subenheter bildar polymerasets huvudblock. En pseudogen har identifierats på kromosom 21. [2]

Interaktioner

POLR2C har visat sig interagera med:

ATF4 , [3]
CCHCR1 , [4]
Myogenin , [5]
POLR2A , [6]
POLR2B , [6]
POLR2E [6]
POLR2F , [6]
POLR2G , [6]
POLR2H , [6]
POLR2J , [6] [5]
POLR2K , [6]
POLR2L , [6]
TAF15 . [7]

Anteckningar

↑ Acker J., Mattei MG, Wintzerith M., Roeckel N., Depetris D., Vigneron M., Kedinger C. Kromosomal lokalisering av humana RNA-polymeras II-subenhetsgener // Genomics : journal. - Academic Press , 1994. - Augusti ( vol. 20 , nr 3 ). - s. 496-499 . - doi : 10.1006/geno.1994.1208 . — PMID 8034326 .
↑ Entrez-gen: POLR2C-polymeras (RNA) II (DNA-riktad) polypeptid C, 33 kDa . (obestämd)
↑ De Angelis R., Iezzi S., Bruno T., Corbi N., Di Padova M., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. Funktionell interaktion av subenhet 3 av RNA-polymeras II (RPB3) med transkriptionsfaktor -4 (ATF4) (engelska) // FEBS Lett. : journal. - 2003. - Juli ( vol. 547 , nr 1-3 ). - S. 15-9 . - doi : 10.1016/s0014-5793(03)00659-8 . — PMID 12860379 .
↑ Corbi N., Bruno T., De Angelis R., Di Padova M., Libri V., Di Certo MG, Spinardi L., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. RNA-polymeras II-subenhet 3 finns kvar i cytoplasman genom dess interaktion med HCR, psoriasis vulgaris-kandidatgenprodukten // Journal of Cell Science : journal. — Biologbolaget, 2005. - September ( vol. 118 , nr. Pt 18 ). - P. 4253-4260 . - doi : 10.1242/jcs.02545 . — PMID 16141233 .
↑ 1 2 Corbi N., Di Padova M., De Angelis R., Bruno T., Libri V., Iezzi S., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. Den alfaliknande RNA-polymeras II kärnsubenhet 3 (RPB3) är involverad i vävnadsspecifik transkription och muskeldifferentiering via interaktion med den myogena faktorn myogenin // The FASEB Journal : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology, 2002. - Oktober ( vol. 16 , nr 12 ). - P. 1639-1641 . - doi : 10.1096/fj.02-0123fje . — PMID 12207009 .
↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Acker J. J.//Interaktioner mellan de humana RNA-polymeras II-subenheterna , de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Chem. : journal. - 1997. - Juli ( vol. 272 , nr 27 ). - P. 16815-16821 . doi : 10.1074 / jbc.272.27.16815 . — PMID 9201987 .
↑ Bertolotti A., Melot T., Acker J., Vigneron M., Delattre O., Tora L. EWS, men inte EWS-FLI-1, är associerad med både TFIID och RNA-polymeras II: interaktioner mellan två medlemmar av TET-familjen, EWS och hTAFII68, och subenheter av TFIID- och RNA-polymeras II-komplex (engelska) // Mol. cell. Biol. : journal. - 1998. - Mars ( vol. 18 , nr 3 ). - P. 1489-1497 . — PMID 9488465 .

Litteratur

Zhang KT Tat, Tat-associerat kinas och transkription. (engelska) // J. Biomed. sci. : journal. - 1998. - Vol. 5 , nej. 1 . - S. 24-7 . - doi : 10.1007/BF02253352 . — PMID 9570510 .
Yankulov K., Bentley D. Transkriptionskontroll: Tat-kofaktorer och transkriptionsförlängning. (engelska) // Curr. Biol. : journal. - 1998. - Vol. 8 , nr. 13 . - P.R447-9 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . — PMID 9651670 .
Romano G., Kasten M., De Falco G., Micheli P., Khalili K., Giordano A. Regulatoriska funktioner för Cdk9 och cyklin T1 i genuttryck för HIV tat-transaktiveringsvägar. (engelska) // J. Cell. Biochem. : journal. - 2000. - Vol. 75 , nr. 3 . - s. 357-368 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . — PMID 10536359 .
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Flera sätt för transkriptionell reglering av HIV-1 Tat-transaktivatorn. (engelska) // IUBMB Life: journal. - 2002. - Vol. 51 , nr. 3 . - S. 175-181 . - doi : 10.1080/152165401753544241 . — PMID 11547919 .
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. Regleringen av HIV-1-transkription: molekylära mål för kemoterapeutisk intervention. (engelska) // Med Res Rev : journal. - 2007. - Vol. 26 , nr. 5 . - s. 595-625 . - doi : 10.1002/med.20081 . — PMID 16838299 .
Harrich D., McMillan N., Munoz L., Apolloni A., Meredith L. Kommer olika Tat-interaktioner att leda till nya antiretrovirala läkemedelsmål? (eng.) // Aktuella läkemedelsmål : journal. - 2007. - Vol. 7 , nr. 12 . - P. 1595-1606 . - doi : 10.2174/138945006779025338 . — PMID 17168834 .
Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., Chen CH, Rosen CA, Roeder RG HIV-1 Tat fungerar som en processivitetsfaktor in vitro i samband med cellulära förlängningsfaktorer. (engelska) // Genes Dev. : journal. - 1992. - Vol. 6 , nr. 4 . - s. 655-666 . - doi : 10.1101/gad.6.4.655 . — PMID 1559613 .
Pati UK, Weissman SM Aminosyrasekvensen för den humana RNA-polymeras II 33-kDa subenheten hRPB 33 är mycket konserverad bland eukaryoter. (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 1990. - Vol. 265 , nr. 15 . - P. 8400-8403 . — PMID 2187864 .
Southgate C., Zapp ML, Green MR Aktivering av transkription av HIV-1 Tat-protein kopplat till begynnande RNA genom ett annat protein. (engelska) // Natur: journal. - 1990. - Vol. 345 , nr. 6276 . - s. 640-642 . - doi : 10.1038/345640a0 . — PMID 2190099 .
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor RB Specifik bindning av RNA-polymeras II till det transaktiverande området för humant immunbristvirus RNA regleras av cellulära kofaktorer och Tat. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 1995. - Vol. 92 , nr. 16 . - P. 7153-7157 . - doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . — PMID 7638159 .
Herrmann CH, Rice AP Lentivirus Tat-proteiner associeras specifikt med ett cellulärt proteinkinas, TAK, som hyperfosforylerar den karboxylterminala domänen av den stora subenheten av RNA-polymeras II: kandidat för en Tat-kofaktor. (engelska) // J. Virol. : journal. - 1995. - Vol. 69 , nr. 3 . - P. 1612-1620 . — PMID 7853496 .
Keen NJ, Gait MJ, Karn J. Humant immunbristvirus typ-1 Tat är en integrerad komponent i det aktiverade transkriptionsförlängningskomplexet. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 1996. - Vol. 93 , nr. 6 . - P. 2505-2510 . - doi : 10.1073/pnas.93.6.2505 . — PMID 8637904 .
Yang X., Herrmann CH, Rice AP Det humana immunbristviruset Tat-proteiner associeras specifikt med TAK in vivo och kräver den karboxylterminala domänen av RNA-polymeras II för funktion. (engelska) // J. Virol. : journal. - 1996. - Vol. 70 , nej. 7 . - P. 4576-4584 . — PMID 8676484 .
Agostini I., Navarro JM, Rey F., Bouhamdan M., Spire B., Vigne R., Sire J. Humant immunbristvirus typ 1 Vpr-transaktivator: samarbete med promotorbundna aktivatordomäner och bindning till TFIIB. (engelska) // J. Mol. Biol. : journal. - 1996. - Vol. 261 , nr. 5 . - s. 599-606 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0485 . — PMID 8800208 .
Zhou Q., Sharp PA Tat-SF1: kofaktor för stimulering av transkriptionell förlängning av HIV-1 Tat. (engelska) // Vetenskap: tidskrift. - 1996. - Vol. 274 , nr. 5287 . - s. 605-610 . - doi : 10.1126/science.274.5287.605 . — PMID 8849451 .
Okamoto H., Sheline CT, Corden JL, Jones KA, Peterlin BM Transaktivering av humant immunbristvirus Tat-protein kräver den C-terminala domänen av RNA-polymeras II. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 1996. - Vol. 93 , nr. 21 . - P. 11575-11579 . - doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . — PMID 8876177 .
Chun RF, Zhang KT Krav för RNA-polymeras II karboxylterminal domän för aktiverad transkription av humana retrovirus humant T-cells lymfotropiskt virus I och HIV-1. (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 1996. - Vol. 271 , nr. 44 . - P. 27888-27894 . doi : 10.1074 / jbc.271.44.27888 . — PMID 8910388 .
Parada CA, Roeder RG Förbättrad processivitet av RNA-polymeras II utlöst av Tat-inducerad fosforylering av dess karboxiterminala domän. (engelska) // Natur: journal. - 1996. - Vol. 384 , nr. 6607 . - s. 375-378 . - doi : 10.1038/384375a0 . — PMID 8934526 .
García-Martínez LF, Ivanov D., Gaynor RB Association of Tat med renade HIV-1- och HIV-2-transkriptionspreinitieringskomplex. (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 1997. - Vol. 272 , nr. 11 . - P. 6951-6958 . doi : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . — PMID 9054383 .