POLR2E

RNA-polymeras II-polypeptid E (vägledd DNA), 25 kDa

Identifierare

POLR2E ; RPABC1; RPB5; XAP4; hRPB25; hsRPB5

Externa ID:n

OMIM: 180664 MGI : 1913670 HomoloGene : 2018 GeneCards : POLR2E Gene

2.7.7.6

Genontologi
Fungera	• RNA-polymeras I-aktivitet • RNA-polymeras II-aktivitet • RNA-polymeras III-aktivitet • DNA-bindning • DNA-riktad RNA-polymerasaktivitet • proteinbindning
cellkomponent	• kärna • nukleoplasma • DNA-riktat RNA-polymeras II, kärnkomplex • DNA-riktat RNA-polymeras III-komplex • DNA-riktat RNA-polymeras I-komplex • cytosol
biologisk process	• mRNA-splitsning, via spliceosom • DNA-reparation • transkriptionskopplad nukleotid-excisionsreparation • nukleotid-excisionsreparation • transkription från RNA-polymeras I-promotor • transkription från RNA-polymeras II-promotor • transkriptionsinitiering från RNA-polymeras II-promotor • transkriptionsförlängning från RNA-polymeras II-promotor • 7-metylguanosin mRNA-kapsling • transkription från RNA-polymeras III-promotor • transkriptionsförlängning från RNA-polymeras III-promotor • terminering av RNA-polymeras III-transkription • RNA-splitsning • genuttryck • viral process • positiv reglering av typ I-interferonproduktion • medfödd immunsvar • positiv reglering av viral transkription
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 19:
1,09 - 1,1 Mb

Chr 10:
80,04 – 80,04 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

RPABC1-underenheten av DNA-beroende RNA-polymeras I, II och III är ett protein som kodas hos människor av POLR2E -genen . [ett]

Denna gen kodar för den femte största subenheten av RNA-polymeras II , polymeraset som ansvarar för RNA- syntes i eukaryoter . Denna subenhet delas av de andra två DNA-beroende RNA-polymeraserna och dess koncentration är dubbelt så stor som de andra polymerassubenheterna. En interaktion har visats mellan denna subenhet och transaktiveringen av hepatitvirusproteinet . Det antas att interaktionen mellan transkriptionsaktivatorn och polymeraset kan ske genom denna subenhet. Pseudogenen av denna gna ligger på kromosom 11 [2] .

Interaktioner

POLR2E har visat sig interagera med:

TAF15 , [3] POLR2C , [4] POLR2G , [4] POLR2H , [4] POLR2A , [4] POLR2B , [4] POLR2L [4] och GTF2F2 [5] .

Anteckningar

↑ Acker J., Mattei MG, Wintzerith M., Roeckel N., Depetris D., Vigneron M., Kedinger C. Kromosomal lokalisering av humana RNA-polymeras II-subenhetsgener // Genomics : journal. - 1994. - Augusti ( vol. 20 , nr 3 ). - s. 496-499 . - doi : 10.1006/geno.1994.1208 . — PMID 8034326 .
↑ Entrez-gen: POLR2E-polymeras (RNA) II (DNA-riktad) polypeptid E, 25 kDa . Arkiverad från originalet den 5 december 2010. (obestämd)
↑ Bertolotti, A; Melot T; Acker J; Vigneron M; Delattre O; Tora L. EWS, men inte EWS-FLI-1, är associerad med både TFIID och RNA-polymeras II: interaktioner mellan två medlemmar av TET-familjen, EWS och hTAFII68, och subenheter av TFIID- och RNA-polymeras II - komplex / Molecular and Cellular Biology : journal. - USA, 1998. - Mars ( vol. 18 , nr 3 ). - P. 1489-1497 . — ISSN 0270-7306 . — PMID 9488465 .
↑ 1 2 3 4 5 6 Acker, J; de Graaff M; Cheynel I; Khazak V; Kedinger C; Vigneron M. Interaktioner mellan de humana RNA-polymeras II-subenheterna (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - USA, 1997. - Juli ( vol. 272 , nr 27 ). - P. 16815-16821 . — ISSN 0021-9258 . doi : 10.1074 / jbc.272.27.16815 . — PMID 9201987 .
↑ Wei, W; Dorjsuren D; LinY; Qin W; Nomura T; Hayashi N; Murakami S. Direkt interaktion mellan subenheten RAP30 av transkriptionsfaktor IIF (TFIIF) och RNA-polymerassubenhet 5, vilket bidrar till sambandet mellan TFIIF och RNA-polymeras II // Journal of Biological Chemistry : journal. - USA, 2001. - April ( vol. 276 , nr 15 ). - P. 12266-12273 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M009634200 . — PMID 11278533 .

Litteratur

Zhang KT Tat, Tat-associerat kinas och transkription. (engelska) // Journal of Biomedical Science : journal. - 1998. - Vol. 5 , nej. 1 . - S. 24-7 . - doi : 10.1007/BF02253352 . — PMID 9570510 .
Yankulov K., Bentley D. Transkriptionskontroll: Tat-kofaktorer och transkriptionsförlängning. (engelska) // Current Biology : journal. - Cell Press , 1998. - Vol. 8 , nr. 13 . - P.R447-9 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . — PMID 9651670 .
Romano G., Kasten M., De Falco G., et al. Regulatoriska funktioner för Cdk9 och av cyklin T1 i genuttryck för HIV tat-transaktiveringsvägar. (engelska) // Journal of Cellular Biochemistry : journal. - 2000. - Vol. 75 , nr. 3 . - s. 357-368 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . — PMID 10536359 .
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Flera sätt för transkriptionell reglering av HIV-1 Tat-transaktivatorn. (engelska) // IUBMB Life: journal. - 2002. - Vol. 51 , nr. 3 . - S. 175-181 . - doi : 10.1080/152165401753544241 . — PMID 11547919 .
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. Regleringen av HIV-1-transkription: molekylära mål för kemoterapeutisk intervention. (engelska) // Med Res Rev : journal. - 2007. - Vol. 26 , nr. 5 . - s. 595-625 . - doi : 10.1002/med.20081 . — PMID 16838299 .
Harrich D., McMillan N., Munoz L., et al. Kommer olika Tat-interaktioner att leda till nya antiretrovirala läkemedelsmål? (eng.) // Aktuella läkemedelsmål : journal. - 2007. - Vol. 7 , nr. 12 . - P. 1595-1606 . - doi : 10.2174/138945006779025338 . — PMID 17168834 .
Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., et al. HIV-1 Tat fungerar som en processivitetsfaktor in vitro i samband med cellulära förlängningsfaktorer. (engelska) // Genes & Development : journal. - 1992. - Vol. 6 , nr. 4 . - s. 655-666 . - doi : 10.1101/gad.6.4.655 . — PMID 1559613 .
Pati UK, Weissman SM Isolering och molekylär karakterisering av ett cDNA som kodar för 23-kDa-subenheten av humant RNA-polymeras II. (engelska) // Journal of Biological Chemistry : tidskrift. - 1991. - Vol. 266 , nr. 20 . — S. 13468 . — PMID 2071613 .
Southgate C., Zapp ML, Green MR Aktivering av transkription av HIV-1 Tat-protein kopplat till begynnande RNA genom ett annat protein. (engelska) // Natur: journal. - 1990. - Vol. 345 , nr. 6276 . - s. 640-642 . - doi : 10.1038/345640a0 . — PMID 2190099 .
Pati UK, Weissman SM Isolering och molekylär karakterisering av ett cDNA som kodar för 23-kDa-subenheten av humant RNA-polymeras II. (engelska) // Journal of Biological Chemistry : tidskrift. - 1989. - Vol. 264 , nr. 22 . - P. 13114-13121 . — PMID 2753903 .
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor RB Specifik bindning av RNA-polymeras II till det transaktiverande området för humant immunbristvirus RNA regleras av cellulära kofaktorer och Tat. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 1995. - Vol. 92 , nr. 16 . - P. 7153-7157 . - doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . — PMID 7638159 .
Cheong JH, Yi M., Lin Y., Murakami S. Human RPB5, en subenhet som delas av eukaryota nukleära RNA-polymeraser, binder humant hepatit B-virus X-protein och kan spela en roll i X-transaktivering. (engelska) // The EMBO Journal : journal. - 1995. - Vol. 14 , nr. 1 . - S. 143-150 . — PMID 7828586 .
Herrmann CH, Rice AP Lentivirus Tat-proteiner associeras specifikt med ett cellulärt proteinkinas, TAK, som hyperfosforylerar den karboxylterminala domänen av den stora subenheten av RNA-polymeras II: kandidat för en Tat-kofaktor. (engelska) // Journal of Virology : journal. - 1995. - Vol. 69 , nr. 3 . - P. 1612-1620 . — PMID 7853496 .
Keen NJ, Gait MJ, Karn J. Humant immunbristvirus typ-1 Tat är en integrerad komponent i det aktiverade transkriptionsförlängningskomplexet. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 1996. - Vol. 93 , nr. 6 . - P. 2505-2510 . - doi : 10.1073/pnas.93.6.2505 . — PMID 8637904 .
Yang X., Herrmann CH, Rice AP Det humana immunbristviruset Tat-proteiner associeras specifikt med TAK in vivo och kräver den karboxylterminala domänen av RNA-polymeras II för funktion. (engelska) // Journal of Virology : journal. - 1996. - Vol. 70 , nej. 7 . - P. 4576-4584 . — PMID 8676484 .
Agostini I., Navarro JM, Rey F., et al. Humant immunbristvirus typ 1 Vpr-transaktivator: samarbete med promotorbundna aktivatordomäner och bindning till TFIIB. (engelska) // Journal of Molecular Biology : journal. - 1996. - Vol. 261 , nr. 5 . - s. 599-606 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0485 . — PMID 8800208 .
Zhou Q., Sharp PA Tat-SF1: kofaktor för stimulering av transkriptionell förlängning av HIV-1 Tat. (engelska) // Vetenskap: tidskrift. - 1996. - Vol. 274 , nr. 5287 . - s. 605-610 . - doi : 10.1126/science.274.5287.605 . — PMID 8849451 .
Okamoto H., Sheline CT, Corden JL, et al. Transaktivering av humant immunbristvirus Tat-protein kräver den C-terminala domänen av RNA-polymeras II. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 1996. - Vol. 93 , nr. 21 . - P. 11575-11579 . - doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . — PMID 8876177 .
Chun RF, Zhang KT Krav för RNA-polymeras II karboxylterminal domän för aktiverad transkription av humana retrovirus humant T-cells lymfotropiskt virus I och HIV-1. (engelska) // Journal of Biological Chemistry : tidskrift. - 1996. - Vol. 271 , nr. 44 . - P. 27888-27894 . doi : 10.1074 / jbc.271.44.27888 . — PMID 8910388 .