Thermococcaceae

Thermococcaceae
Thermococcus gammatolerans
vetenskaplig klassificering
Domän:ArchaeaSorts:EuryarchaeotesKlass:Thermococci Zillig och Reysenbach 2002Ordning:Thermococcales Zillig 1988Familj:Thermococcaceae
Internationellt vetenskapligt namn
Thermococcaceae Zillig 1988
typ släkte
Thermococcus Zillig 1983
Systematik på Wikispecies Bilder på Wikimedia Commons DET ÄR   951477 NCBI   2259 EOL   7929

Thermococcaceae  (lat.) ( Termococci ) är en familj avarkéer av typen Euryarchaeota , den enda iordningen Thermococcales och klassen Thermococci [1] [2] (synonymt med Protoarchaea Cavalier-Smith 2002 [3] ). Familjen inkluderar 3 släkten, mer än 40 kända arter, vilket gör den till den mest talrika familjen i archaea-domänen. Förmodligen har endast en liten del av arterna av denna klass som finns i naturen studerats [4] .

Beskrivning

De kännetecknas av en mycket hög temperatur med optimal tillväxt (80 ° C ovan) vid ett pH nära neutralt (optimalt för de flesta ligger i intervallet 6-8) och salthalt nära det för havsvatten. De vanligaste livsmiljöerna är hydrotermiska ventiler under vattnet. Representanter för släktet Thermococcus har också hittats i terrestra hydrotermer i Nya Zeeland. Det finns för närvarande ingen information om termokockers boende i aeroba och lågtemperaturekosystem och i miljöer med högt eller lågt pH [4] .

Klassificering

Från och med juni 2017 inkluderar familjen följande taxa [1] [5] :

• Släktet Palaeococcus Takai et al. 2000 [6]
  • Palaeococcus ferrophilus Takai et al. 2000 ( typ art )
  • Palaeococcus helgesonii Amend et al. 2006
  • Palaeococcus pacificus Zeng et al. 2013
• Släktet Pyrococcus Fiala och Stetter 1986 [7]
  • Pyrococcus abyssi Erauso et al. 1993 - frånvarande från LPSN
  • Pyrococcus endeavori - frånvarande från LPSN
  • Pyrococcus furiosus Fiala och Stetter 1986 (typ art)
  • Pyrococcus glycovorans Barbier et al. 1999
  • Pyrococcus horikoshii González et al. 1999
  • Pyrococcus kukulkanii Callac et al. 2016
  • Pyrococcus woesei Zillig 1988
  • Pyrococcus yayanosii Birrien et al. 2011
• Släktet Thermococcus Zillig 1983 [8]
  • Thermococcus acidaminovorans Dirmeier et al. 2001
  • Thermococcus aegaeus corrig. Arab et al. 2000
  • Thermococcus aggregans Canganella et al. 1998
  • Thermococcus alcaliphilus Keller et al. 1997
  • Thermococcus atlanticus Cambon-Bonavita et al. 2004
  • Thermococcus barophilus Marteinsson et al. 1999
  • Thermococcus barossii Duffaud et al. 2005
  • Thermococcus celer Zillig 1983 (typ art)
  • Thermococcus celericrescens Kuwabara et al. 2007
  • Thermococcus chitonophagus Huber och Stetter 1996
  • Thermococcus cleftensis Hensley et al. 2014
  • Thermococcus coalescens Kuwabara et al. 2005
  • Thermococcus eurythermalis Zhao et al. 2015
  • Thermococcus fumicolans Godfroy och Meunier 1996
  • Thermococcus gammatolerans Jolivet et al. 2003
  • Thermococcus gorgonarius Miroshnichenko et al. 1998
  • Thermococcus guaymasensis Canganella et al. 1998
  • Thermococcus hydrothermalis Godfroy et al. 1997
  • Thermococcus kodakarensis corrig. Atomi et al. 2005
  • Thermococcus litoralis Neuner et al. 2001
  • Thermococcus marinus - frånvarande från LPSN
  • Thermococcus mexicalis - frånvarande från LPSN
  • Thermococcus nautili Gorlas et al. 2014
  • Thermococcus onnurineus Bae et al. 2006 - frånvarande från LPSN
  • Thermococcus pacificus Miroshnichenko et al. 1998
  • Thermococcus paralvinellae Hensley et al. 2014
  • Thermococcus peptonophilus González et al. 1996
  • Thermococcus piezophilus Dalmasso et al. 2016 - inte i LPSN
  • Thermococcus prieurii Gorlas et al. 2013
  • Thermococcus profundus Kobayashi och Horikoshi 1995
  • Thermococcus radiotolerans - frånvarande från LPSN
  • Thermococcus sibiricus Miroshnichenko et al. 2001
  • Thermococcus siculi Grote et al. 2000
  • Thermococcus stetteri Miroshnichenko 1990
  • Thermococcus thioreducens Pikuta et al. 2007
  • Thermococcus waimanguensis - frånvarande från LPSN
  • Thermococcus waiotapuensis González et al. 2001
  • Thermococcus zilligii Ronimus et al. 1999

Anteckningar

1. ↑ 1 2 Klassificering av domäner och phyla - Hierarkisk klassificering av prokaryoter (bakterier) : Version 2.0  : [ eng. ]  // LPSN. - 2016. - 2 oktober.
2. ↑ Taxonomy Browser : Thermococci  : [ eng. ]  // NCBI.  (Tillgänglig: 23 juli 2017) .
3. ↑ Klass Protoarchaea  : [ eng. ]  // LPSN.  (Tillgänglig: 23 juli 2017) .
4. ↑ 1 2 Slobodkina G. B. Molekylär detektion av representanter för hypertermofila arkéer och karakterisering av arkealt termostabilt DNA-polymeras Arkiverad 9 maj 2012.  : avhandling ... kandidat för biologiska vetenskaper: 03.00.07. - M. , 2005. - 118 sid. : sjuk. — RSL OD.
5. ↑ Taxonomy Browser: Thermococcaceae  : [ eng. ]  // NCBI.  (Tillgänglig: 23 juli 2017) .
6. ↑ Genus Palaeococcus  : [ eng. ]  // LPSN.  (Tillgänglig: 23 juli 2017) .
7. ↑ Genus Pyrococcus  : [ eng. ]  // LPSN.  (Tillgänglig: 23 juli 2017) .
8. ↑ Genus Thermococcus  : [ eng. ]  // LPSN.  (Tillgänglig: 23 juli 2017) .

Litteratur

• Cavalier-Smith T. Arkaebakteriernas neomuranska ursprung, den negibakteriella roten av det universella trädet och bakteriell megaklassificering  (engelska)  // Int. J. Syst. Evol. mikrobiol. : journal. - 2002. - Vol. 52 , nr. Pt 1 . - S. 7-76 . — PMID 11837318 .  (inte tillgänglig länk)
• Woese CR, Kandler O., Wheelis ML Mot ett naturligt system av organismer: förslag för domänerna Archaea, Bacteria och Eucarya  (engelska)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1990. - Vol. 87 , nr. 12 . - P. 4576-4579 . - doi : 10.1073/pnas.87.12.4576 . - . — PMID 2112744 .
• Zillig W., Reysenbach AL Klass IV (sic) [V]. Termokocker klass. nov. // Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria  (engelska) / DR Boone och RW Castenholz, red. — 2:a. - New York: Springer Verlag , 2001. - P. 169. - ISBN 978-0387987712 .
• Atomi H., Fukui T., Kanai T., Morikawa M. och Imanaka T. 2004. Beskrivning av Thermococcus kodakaraensis sp. nov., en väl studerad hypertermofil arkeon som tidigare återupptogs som Pyrococcus sp. KOD1 . Archaea 1 : 263-267.
• Fukuda W., Ismail YS, Fukui T., Atomi H. och Imanaka T. 2005. Karakterisering av ett arkealt äppelenzym från den hypertermofila arkeonen Thermococcus kodakaraensis KOD1 . Archaea 1 : 293-301.
• Fukui T., Atomi H., Kanai T., Matsumi R., Fujiwara S. och Imanaka T. 2005. Komplett genomsekvens av den hypertermofila arkeonen Thermococcus kodakaraensis KOD1 och jämförelse med Pyrococcus-genom . Genome Research 15 : 352-363.
• Jolivet E., L'Haridon S., Corre E., Forterre P., Prieur D. 2003. Thermococcus gammatolerans sp. nov., en hypertermofil arkeon från en hydrotermisk öppning i djuphavet som motstår joniserande strålning . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 53 : 847-851.
• Miroshnichenko ML, Gongadze GM, Rainey FA, ​​Kostyukova AS, Lysenko AM, Chernyh NA och Bonch-Osmolovskaya EA 1998. Thermococcus gorgonarius sp. nov. och Thermococcus pacificus sp. nov.: heterotrofa extremt termofila arkéer från Nya Zeelands undervattensöppningar . International Journal of Systematic Bacteriology 48 : 23-29.

Länkar

• Referenser om hypertermofil archaea .