Stjärnaktivitet

Stjärnaktivitet är ett fenomen av en minskning eller förändring av specificiteten hos restriktionsendonukleaser , vilket leder till urskillningslös skärning (restriktion)  av DNA under reaktionen in vitro . Stjärnaktivitet uppstår under förhållanden som skiljer sig från det optimala för ett givet enzym. Som ett resultat av stjärnaktivitet uppstår begränsningar på icke-kanoniska platser, ibland finns det en fullständig förlust av specificitet.

Orsakerna till stjärnaktivitet kan vara:

En hög koncentration av glycerol är särskilt viktig i laboratoriepraxis eftersom kommersiellt tillgängliga restriktionsendonukleaser vanligtvis tillhandahålls i en buffert som innehåller en betydande mängd glycerol (50 % v/v). Därför kan otillräcklig utspädning av enzymlösningen leda till stjärnaktivitet. 

Externa länkar

Länkar

  1. Robinson, CR; Sliger, SG Molecular Recognition Mediated by Bound Water: A Mechanism for Star Activity of the Restriction Endonuclease EcoRI  //  Journal of Molecular Biology : journal. - 1993. - Vol. 234 , nr. 2 . - s. 302-306 . - doi : 10.1006/jmbi.1993.1586 . — PMID 8230215 .