Integrin alfa-9

Integrin alfa-9
Identifierare
SymbolITGA9  ; ALPHA-RLC; ITGA4L; RLC
Externa ID:nOMIM:  603963 MGI :  104756 HomoloGene :  1664 ChEMBL : 3170 GeneCards : ITGA9 Gene
RNA-uttrycksprofil
Mer information
ortologer
SeMänskligMus
Entrez3680104099
EnsembleENSG00000144668ENSMUSG00000039115
UniProtQ13797B8JK39
RefSeq (mRNA)NM_002207NM_001113514
RefSeq (protein)NP_002198NP_001106986
Locus (UCSC)Chr 3:
37,49 – 37,87 Mb
Chr 9:
118,61 – 118,9 Mb
Sök i PubMed[ett][2]

Integrin alfa-9 (α9) är ett membranprotein , ett glykoprotein från integrinsuperfamiljen , en produkt av ITGA9 -genen , alfasubenheten av α9β1-integrinet. ITGA9 - genen är belägen på kromosom 3 vid 3p22.2-lokuset [1] .

Funktioner

Integrin alfa-9/ beta-1 (α9β1) är receptorn för VCAM1 , cytotactin och osteopontin . Känner igen aminosyrasekvensen AEIDGIEL i cytotactin. [2] Tillsammans med αvβ3-, αvβ6-, α8β1- och α2β1-integrinerna är det en neutrofil receptor som förmedlar VCAM-1 och tenascin-C-medierad migration av endotelceller under ett inflammatoriskt svar. [3]

Struktur

Integrin alfa-9 är ett stort protein, består av 1006 aminosyror , molekylvikten för proteindelen är 114,5 kDa . Den N-terminala regionen (952 aminosyror) är extracellulär, följt av ett enda transmembranfragment och ett intracellulärt fragment (33 aminosyror). Det extracellulära fragmentet inkluderar 7 FG-GAP-repetitioner och 1 till 11 N-glykosyleringsställen . Den cytosoliska regionen inkluderar GFFKR- motivet.

I processen med begränsad proteolys hydrolyseras den intramolekylära bindningen och tunga och lätta kedjor bildas, sammanlänkade med en disulfidbindning .

Vävnadsspecificitet

α9β1-integrinet uttrycks i luftvägsepitelet, i basalskiktet av skivepitelet, på glatta muskelceller, skelettmuskelceller och hepatocyter . Hög uttrycksnivå i embryonala lungor och i lungtumörceller.

Se även

Anteckningar

  1. Sulimova G., Kutsenko A., Rakhmanaliev E., Udina I., Kompaniytsev A., Protopopov A., Moisjak E., Klimov E., Muravenko O., Zelenin A., Braga E., Kashuba V., Zabarovsky E., Kisselev L. Human kromosom 3: integration av 60 Not I-kloner i en fysisk och genkarta  (engelska)  // Cytogenetic and Genome Research : journal. - 2002. - Vol. 98 . - S. 177-183 . - doi : 10.1159/000069814 .
  2. Uniprot-databaspost för ITGA9 (accessionsnummer Q13797) . Hämtad 6 mars 2012. Arkiverad från originalet 7 augusti 2017.
  3. Taooka Y., Chen J., Yednock T., Sheppard D. Integrinet alpha9beta1 förmedlar adhesion till aktiverade endotelceller och transendotelial neutrofilmigrering genom interaktion med vaskulär celladhesionsmolekyl-1  //  J. Cell Biol. : journal. - 1999. - April ( vol. 145 , nr 2 ). - s. 413-420 . — PMID 10209034 .

Bibliografi

Länkar