Integrin beta-6 | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||
Identifierare | |||||||||||||
Symbol | ITGB6 | ||||||||||||
Externa ID:n | OMIM: 147558 MGI : 96615 HomoloGene : 685 ChEMBL : 4876 GeneCards : ITGB6 Gene | ||||||||||||
| |||||||||||||
RNA-uttrycksprofil | |||||||||||||
Mer information | |||||||||||||
ortologer | |||||||||||||
Se | Mänsklig | Mus | |||||||||||
Entrez | 3694 | 16420 | |||||||||||
Ensemble | ENSG00000115221 | ENSMUSG00000026971 | |||||||||||
UniProt | P18564 | Q9Z0T9 | |||||||||||
RefSeq (mRNA) | NM_000888 | NM_001159564 | |||||||||||
RefSeq (protein) | NP_000879 | NP_001153036 | |||||||||||
Locus (UCSC) | Chr 2: 160,96 – 161,13 Mb | Chr 2: 60,6 – 60,72 Mb | |||||||||||
Sök i PubMed | [ett] | [2] |
Integrin beta-6 (β6) är ett membranprotein , ett glykoprotein från integrinsuperfamiljen , en produkt av ITGB6 -genen , beta-subenheten av αVβ6-integrinet, en receptor för fibronektin och cytotactin . Genen klonades första gången 1990 . [ett]
Integrin alfa-V/beta-6 (αVβ6) är receptorn för fibronektin och cytotactin . Känner igen den specifika aminosyrasekvensen glycin - prolin - arginin (RGD) i dessa ligander. Clathrin - medierad endocytos av αVβ6-integrinet bidrar till invasiviteten hos karcinomceller. [2]
Integrin β6 interagerar med FLNB och HAX1 . αVβ6 är en ligand för tillväxtfaktorn TGFB1 . [3] Dessutom binder det till FMDV VP1-proteinet , höljesproteinerna från Coxsackievirus A9 och B1, och fungerar som en receptor för dessa virus.
Integrin beta-6 består av 767 aminosyror, proteindelens molekylvikt är 85,9 kDa . Den N-terminala regionen (688 aminosyror) är extracellulär, följt av ett enda transmembranfragment och ett intracellulärt fragment (58 aminosyror). Det extracellulära fragmentet inkluderar 4 upprepningar, VWFA-domän, upp till 9 N-glykosyleringsställen . Den cytosoliska regionen innehåller HAX1- bindningssekvensen .
Integrin beta-6 bildar ett heterodimert komplex genom att binda till alfa-subenheten av alfa-V .
Proteiner : Integriner | |
---|---|
Alfa integriner | |
Beta-integriner | |
Dimeriska integriner | kollagenreceptorer VLA-1 ( A1 + B1 ) VLA-2 ( A2 + B1 ) VLA-10 ( A10 + B1 ) VLA-11 ( A11 + B1 ) Leukocytadhesionsreceptorer LFA-1 ( AL + B2 ) Mac-1 ( AM + B2 ) Integrin alfa-X-beta-2 ( AX + B2 ) Integrin alfa-D-beta-2 ( AD + B2 ) VLA-4 ( A4 + B1 ) VLA-9 ( A9 + B1 ) Integrin alfa-4-beta-7 Integrin alfa-E-beta-7 Lamininreceptorer VLA-3 ( A3 + B1 ) VLA-6 ( A6 + B1 ) VLA-7 ( A7 + B1 ) Integrin alfa-6-beta-4 RGD-receptorer VLA-5 ( A5 + B1 ) VLA-8 ( A8 + B1 ) Glykoprotein IIb/IIIa ( IIb + B3 ) Integrin alfa-V-beta-3 Integrin alfa-V-beta-5 Integrin alfa-V-beta-6 Integrin alfa-V-beta-8 |