Nukleotidsekvens
Nukleotidsekvens , genetisk sekvens - ordningen av nukleotidrester i nukleinsyror . Bestäms genom sekvensering .
För att registrera nukleotidsekvenserna av DNA , enligt IUPAC - rekommendationen , används tecken i det latinska alfabetet. [ett]
- A = adenin [2]
- C = cytosin
- G = guanin
- T = tymin
- R = GA guanin eller adenin - purin (pu rin ) baser
- Y = TC pyrimidin ( pyrimidin ) baser
- K = GT som innehåller en ketogrupp
- M = AC som innehåller en aminogrupp
- S = GC "stark" ( stark) bildar 3 vätebindningar
- W = AT "svag" ( svag ) bildar 2 vätebindningar
- B = GTC (alla andra än A)
- D = GAT (alla utom C)
- H = ACT (alla andra än G)
- V = GCA (alla andra än T)
- N = AGCT (valfri)
Symboler som betecknar obestämd sekvens behövs när den exakta sekvensen är okänd, irrelevant eller olika varianter av den är kända.
Symbolerna A, C, G, U ( uridin )
är vanligtvis tillräckliga för att skriva RNA- sekvenser.
Alla sekvenser skrivs utan mellanslag, från vänster till höger, från 5'-änden till 3'-änden .
Anteckningar
- ↑ Nomenklatur för ofullständigt specificerade baser i nukleinsyrasekvenser Arkiverad 21 augusti 2017 på Wayback Machine , NC-IUB, 1984.
- ↑ basnamn används för bekvämlighets skull, inte nukleosider
Se även