Histon deacetylas 8
Histon deacetylas 8 |
---|
Det preliminära budgetförslaget är baserat på 1t64. |
PDB |
Ortologisk sökning: PDBe , RCSB
|
1T64 , 1T67 , 1T69 , 1VKG , 1W22 , 2V5W , 2V5X , 3EW8 , 3EWF , 3EZP , 3EZT , 3F06 , 3F07 , 3F0R 3 , 3M_ZRS , 3M_ZRS , 3M_HD _ _ _ _ _ _ _ |
|
|
|
Symbol | HDAC8 ; CDLS5; HD8; HDACL1; MRXS6; RPD3; WTS |
---|
Externa ID:n | OMIM: 300269 MGI : 1917565 HomoloGene : 41274 IUPHAR : ChEMBL : 3192 GeneCards : HDAC8-gen |
---|
EG-nummer | 3.5.1.98 |
---|
|
|
Se | Mänsklig | Mus | |
---|
Entrez | 55869 | 70315 | |
---|
Ensemble | ENSG00000147099 | ENSMUSG00000067567 | |
---|
UniProt | Q9BY41 | Q8VH37 | |
---|
RefSeq (mRNA) | NM_001166418 | NM_027382 | |
---|
RefSeq (protein) | NP_001159890 | NP_081658 | |
---|
Locus (UCSC) | Chr HG1438_PATCH: 71,55 – 71,79 Mb | Chr X: 102,28 – 102,51 Mb | |
---|
Sök i PubMed | [ett] | [2] | |
Histoneacetylas 8 ( Histoneacetylas 8 ) är ett enzym som kodas hos människor av HDAC8 -genen [1] [2] [3] .
Funktion
Histoner spelar en avgörande roll i regleringen av transkription , cellcykelprogression och utvecklingsprocesser. Acetylering/deacetylering av histoner förändrar den kromosomala strukturen och påverkar transkriptionsfaktorernas tillgång till DNA . Proteinet som kodas av denna gen tillhör klass I i histon-deacetylas/acuc/Apha-familjen. Det har histon-deacetylasaktivitet och undertrycker transkription när det binds till en promotor [3] .
Histondeacetylas 8 är involverad i skallmorfogenes [ 4] och metabol kontroll av ERR-alfa / PGC1-alpha [5] transkriptionskomplexet [5] .
Klinisk betydelse
HDAC8 har associerats med ett antal sjukdomstillstånd, särskilt akut myeloid leukemi , och är också associerat med aktincytoskelettet i glatta muskelceller. siRNA som riktar sig mot HDAC8 har visat anti-cancereffekter [6] . Hämning av inducerad apoptos av HDAC8 har observerats i T-cellslymfom [7] . Dessutom är HDAC8- enzymet involverat i patogenesen av neuroblastom [8] . Det finns alltså intresse för utvecklingen av selektiva hämmare baserade på HDAC8 [9] [10] .
Interaktioner
Se även
Anteckningar
- ↑ McDonell N., Ramser J., Francis F., Vinet MC, Rider S., Sudbrak R., Riesselman L., Yaspo ML, Reinhardt R., Monaco AP, Ross F., Kahn A., Kearney L., Buckle V., Chelly J. Karakterisering av en mycket komplex region i Xq13 och kartläggning av tre isodicentriska brytpunkter associerade med preleukemi // Genomics : journal. - Academic Press , 2000. - Maj ( vol. 64 , nr 3 ). - S. 221-229 . - doi : 10.1006/geno.2000.6128 . — PMID 10756090 .
- ↑ Van den Wyngaert I., de Vries W., Kremer A., Neefs J., Verhasselt P., Luyten WH, Kass SU Kloning och karakterisering av humant histondeacetylas 8 // FEBS Lett : journal. - 2000. - Augusti ( vol. 478 , nr 1-2 ). - S. 77-83 . - doi : 10.1016/S0014-5793(00)01813-5 . — PMID 10922473 .
- ↑ 1 2 Entrez-gen: HDAC8-histondeacetylas 8 . (obestämd)
- ↑ Haberland M., Mokalled MH, Montgomery RL, Olson EN Epigenetisk kontroll av skallmorfogenes genom histondeacetylas 8 // Genes Dev . : journal. - 2009. - Juli ( vol. 23 , nr 14 ). - P. 1625-1630 . - doi : 10.1101/gad.1809209 . — PMID 19605684 .
- ↑ 1 2 Wilson BJ, Tremblay AM, Deblois G., Sylvain-Drolet G., Giguère V. En acetyleringsswitch modulerar transkriptionsaktiviteten hos östrogenrelaterad receptor alfa // Mol . Endokrinol. : journal. - 2010. - Juli ( vol. 24 , nr 7 ). - P. 1349-1358 . — doi : 10.1210/me.2009-0441 . — PMID 20484414 .
- ↑ Gallinari P., Di Marco S., Jones P., Pallaoro M., Steinkühler C. HDACs, histon-deacetylering och gentranskription: från molekylärbiologi till cancerterapi // Cell Res . : journal. - 2007. - Mars ( vol. 17 , nr 3 ). - S. 195-211 . - doi : 10.1038/sj.cr.7310149 . — PMID 17325692 .
- ↑ Balasubramanian S., Ramos J., Luo W., Sirisawad M., Verner E., Buggy JJ En ny histondeacetylas 8 (HDAC8) -specifik //hämmare PCI-34051 inducerar apoptos i T-cellslymfom - 2008. - Maj ( vol. 22 , nr 5 ). - P. 1026-1034 . - doi : 10.1038/leu.2008.9 . — PMID 18256683 .
- ↑ Oehme I., Deubzer HE, Wegener D., Pickert D., Linke JP, Hero B., Kopp-Schneider A., Westermann F., Ulrich SM, von Deimling A., Fischer M., Witt O. Histondeacetylas 8 i neuroblastomtumörbildning (engelska) // Clin. Cancer Res. : journal. - 2009. - Januari ( vol. 15 , nr 1 ). - S. 91-9 . - doi : 10.1158/1078-0432.CCR-08-0684 . — PMID 19118036 .
- ↑ Patil V., Sodji QH, Kornacki JR, Mrksich M., Oyelere AK 3-Hydroxypyridin-2-thione as novel zink binding group for selektiv histon deacetylas inhibition // Journal of Medicinal Chemistry : journal. - 2013. - Maj ( vol. 56 , nr 9 ). - P. 3492-3506 . doi : 10.1021 / jm301769u . — PMID 23547652 .
- ↑ Suzuki T., Ota Y., Ri M., Bando M., Gotoh A., Itoh Y., Tsumoto H., Tatum PR, Mizukami T., Nakagawa H., Iida S., Ueda R., Shirahige K. ., Miyata N. Snabb upptäckt av mycket potenta och selektiva hämmare av histondeacetylas 8 med hjälp av klickkemi för att generera kandidatbibliotek // Journal of Medicinal Chemistry : journal. - 2012. - November ( vol. 55 , nr 22 ). - P. 9562-9575 . doi : 10.1021 / jm300837y . — PMID 23116147 .
Litteratur
- Waltregny D., De Leval L., Glénisson W., Ly Tran S., North BJ, Bellahcène A., Weidle U., Verdin E., Castronovo V. Expression av histondeacetylas 8, en klass I histondeacetylas, är begränsad till celler som uppvisar differentiering av glatt muskulatur i normala mänskliga vävnader. (engelska) // Am J Pathol. : journal. - 2004. - Vol. 165 , nr. 2 . - s. 553-564 . - doi : 10.1016/S0002-9440(10)63320-2 . — PMID 15277229 .
- Glénisson W., Waltregny D., Tran SL, North BJ, Verdin E., Colige A., Castronovo V. Histondeacetylas HDAC8 associeras med alfaaktin i glatt muskulatur och är väsentligt för sammandragning av glatta muskelceller. (engelska) // The FASEB Journal : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology, 2005. - Juni ( vol. 19 , nr 8 ). - s. 966-968 . - doi : 10.1096/fj.04-2303fje . — PMID 15772115 .
- Wedel T., Van Eys GJ, Waltregny D., Glénisson W., Castronovo V., Vanderwinden JM. Nya markörer för glatta muskler avslöjar abnormiteter i tarmmuskulaturen vid allvarliga kolorektala motilitetsstörningar. (engelska) // Neurogastroenterol Motil. : journal. - 2006. - Vol. 18 , nr. 7 . - s. 526-538 . - doi : 10.1111/j.1365-2982.2006.00781.x . — PMID 16771768 .
- Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Klass II histondeacetylaser: mångsidiga regulatorer. (engelska) // Trender Genet. : journal. - 2003. - Vol. 19 , nr. 5 . - s. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
- Hu E., Chen Z., Fredrickson T., et al. Kloning och karakterisering av ett nytt humant klass I-histondeacetylas som fungerar som en transkriptionsrepressor. (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 20 . - P. 15254-15264 . - doi : 10.1074/jbc.M908988199 . — PMID 10748112 .
- Buggy JJ, Sideris ML, Mak P., et al. Kloning och karakterisering av ett nytt humant histondeacetylas, HDAC8. (engelska) // Biochem. J. : journal. - 2001. - Vol. 350 , nr. 1 . - S. 199-205 . - doi : 10.1042/0264-6021:3500199 . — PMID 10926844 .
- Amann JM, Nip J., Strom DK, et al. ETO, ett mål för t(8;21) vid akut leukemi, gör distinkta kontakter med flera histon-deacetylaser och binder mSin3A genom dess oligomeriseringsdomän. (engelska) // Mol. cell. Biol. : journal. - 2001. - Vol. 21 , nr. 19 . - P. 6470-6483 . - doi : 10.1128/MCB.21.19.6470-6483.2001 . — PMID 11533236 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
- Durst KL, Lutterbach B., Kummalue T., et al. Fusionsproteinet inv(16) associerar med corepressorer via en tung muskel-myosin-domän. (engelska) // Mol. cell. Biol. : journal. - 2003. - Vol. 23 , nr. 2 . - P. 607-619 . - doi : 10.1128/MCB.23.2.607-619.2003 . — PMID 12509458 .
- Rodriguez M., Yu X., Chen J., Songyang Z. Fosfopeptidbindningsspecificiteter för BRCA1 COOH-terminala (BRCT) domäner. (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 2004. - Vol. 278 , nr. 52 . - P. 52914-52918 . - doi : 10.1074/jbc.C300407200 . — PMID 14578343 .
- Johnson JM, Castle J., Garrett-Engele P., et al. Genomomfattande undersökning av human alternativ pre-mRNA splitsning med exon junction microarrays. (engelska) // Vetenskap: tidskrift. - 2004. - Vol. 302 , nr. 5653 . - P. 2141-2144 . - doi : 10.1126/science.1090100 . — PMID 14684825 .
- Lee H., Rezai-Zadeh N., Seto E. Negativ reglering av histon-deacetylas 8-aktivitet av cykliskt AMP-beroende proteinkinas A. // Mol . cell. Biol. : journal. - 2004. - Vol. 24 , nr. 2 . - s. 765-773 . - doi : 10.1128/MCB.24.2.765-773.2004 . — PMID 14701748 .
- Vannini A., Volpari C., Filocamo G., et al. Kristallstruktur av ett eukaryot zinkberoende histondeacetylas, humant HDAC8, komplexbundet med en hydroxamsyrahämmare. (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidskrift. - 2004. - Vol. 101 , nr. 42 . - P. 15064-15069 . - doi : 10.1073/pnas.0404603101 . — PMID 15477595 .
- Waltregny D., North B., Van Mellaert F., et al. Screening av histondeacetylaser (HDAC) uttryck i human prostatacancer avslöjar distinkta klass I HDAC-profiler mellan epitelceller och stromaceller. (engelska) // European Journal of Histochemistry : tidskrift. - 2005. - Vol. 48 , nr. 3 . - S. 273-290 . — PMID 15590418 .
- Waltregny D., Glénisson W., Tran SL, et al. Histondeacetylas HDAC8 associeras med alfa-aktin i glatt muskulatur och är väsentligt för sammandragning av glatta muskelceller. (engelska) // The FASEB Journal : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology, 2006. - Vol. 19 , nr. 8 . - s. 966-968 . - doi : 10.1096/fj.04-2303fje . — PMID 15772115 .
- Gantt SL, Gattis SG, Fierke CA Katalytisk aktivitet och hämning av humant histondeacetylas 8 är beroende av identiteten för metalljonen på det aktiva stället. (engelska) // Biokemi: tidskrift. - 2006. - Vol. 45 , nr. 19 . - P. 6170-6178 . doi : 10.1021/ bi060212u . — PMID 16681389 .
- Lee H., Sengupta N., Villagra A., et al. Histondeacetylas 8 skyddar det mänskliga allt kortare telomerproteinet 1B (hEST1B) från ubiquitin-medierad nedbrytning. (engelska) // Mol. cell. Biol. : journal. - 2006. - Vol. 26 , nr. 14 . - P. 5259-5269 . - doi : 10.1128/MCB.01971-05 . — PMID 16809764 .
- Vannini A., Volpari C., Gallinari P., et al. Substratbindning till histon-deacetylaser som visas av kristallstrukturen hos HDAC8-substratkomplexet. (eng.) // EMBO Reports : journal. - 2007. - Vol. 8 , nr. 9 . - s. 879-884 . - doi : 10.1038/sj.embor.7401047 . — PMID 17721440 .
- Nakagawa M., Oda Y., Eguchi T., et al. Expressionsprofil av klass I-histondeacetylaser i humana cancervävnader. (engelska) // Oncol. Rep. : journal. - 2007. - Vol. 18 , nr. 4 . - s. 769-774 . doi : 10.3892 / eller.18.4.769 . — PMID 17786334 .
Länkar
- MeSH HDAC8+protein,+människa