Kopplingsojämvikt mellan gener
Linkage disequilibrium ( LD ) är en icke-slumpmässig fördelning av allelfrekvenser av olika loci , som inte bara kan bero på nära genetisk koppling av gener, utan också på närvaron av en adaptiv fördel med en viss kombination av alleler, frekvensen av som ökar i enlighet med den förväntade frekvensen med en slumpmässig fördelning.
Program för att beräkna LD
- LiAn - Linkage Analysis 3.7 Arkiverad 11 oktober 2009 på Wayback Machine (Ias) (online)
- Arlequin 3.5 Arkiverad 29 december 2020 på Wayback Machine (p-värden, D, D', r², χ²) (Windows)
- LinkDos på webben Arkiverad 18 september 2009 på Wayback Machine (Δ, D, D') (online)
- MultiLocus 1.3b Arkiverad 27 maj 2009 på Wayback Machine (Ia, rd) (Windows, MacOS)
- MIDAS - Multiallelic Interallelic Disequilibrium Analysis Software 1.0 (Python, Windows, Linux)
Visualisering
Länkar