Tvillingbaser
Parade baser - ett par av två kvävehaltiga baser av nukleotider på komplementära kedjor av nukleinsyror (motsatt DNA eller identiskt RNA ), kopplade med hjälp av vätebindningar .
I kanonisk Watson - Crick DNA-basparning , parar adenin (A) med tymin (T) och guanin (G) med cytosin (C). I RNA ersätts tymin med uracil (U). Andra icke-Watson-Crick-parningar förekommer också, särskilt i RNA, och är resultatet av ett förändrat vätebindningsmönster: Hoogsten (imidazol) parade baser är ett typiskt exempel . AT-paret (eller AU) är sammanlänkade med två vätebindningar och GC-paret med tre [1] .
Huvudrollen för bildandet av parade baser i biologiska system är förmågan att läsa och kopiera information kodad i nukleinsyror. Under översättningsprocessen , på grund av bildandet av parade baser, känns antikodoner av överförings-RNA igen av kodonen för budbärar-RNA- molekyler .
Vissa DNA- eller RNA-bindande enzymer kan känna igen vissa basparsekvenser: till exempel identifierar transkriptionsfaktorer specifika regulatoriska regioner av gener på detta sätt.
Användning som måttenhet
Storleken på individuella gener eller hela genom (C-värde) hos organismer uttrycks ofta i baspar eftersom dessa gener och genom är sammanfogade för att bilda dubbelsträngat DNA. Antalet baspar är lika med antalet nukleotider i en av strängarna (exklusive de icke-kodande regionerna i telomererna , som är enkelsträngade).
Vid användning av termen "parad bas" som måttenhet förkortas namnet vanligtvis till "bp" (från engelska baspar ). I ryskspråkig litteratur används ibland också förkortningen b.n. - ett par nukleotider. Dessutom används härledda enheter [2] :
- kilobas eller etc. o. (tbp eller kb; engelska kilobase , kb eller kbp) - tusen baspar;
- megabas eller miljoner p.o. (miljoner baspar eller Mb; engelska megabas , Mb eller Mbp) - en miljon baspar;
- gigabas eller miljarder p.o. (miljarder bp eller Gb; engelsk gigabas , Gb eller Gbp) - en miljard baspar.
Ett baspar motsvarar ett avstånd längs en dubbelsträngad DNA-molekyl lika med 3,4 Å (0,34 nm ), en tiondel av ett helt varv av helixen [3] . Molekylvikten för ett baspar i DNA är i genomsnitt 643 dalton .
Se även
Anteckningar
- ↑ Kantor Ch., Schimmel P. Biofysisk kemi / Per. från engelska. ed. A.A. Bogdanov, Yu.S. Lazurkina, M.D. Frank-Kamenetsky. - M. : Mir, 1984. - T. 1. - S. 295. - 336 sid.
- ↑ Tailed amphibian genomes var stora från början . Elements.ru . Tillträdesdatum: 1 januari 2016. Arkiverad från originalet 5 februari 2016.
- ↑ Alberts B., Johnson A., Lewis J., Morgan D., Raff M., Roberts K., Walter P. Molecular Biology of the Cell . — 6:e uppl. — New York/Abingdon: Garland Science, Taylor & Francis Group, 2014. — S. 177. — ISBN 978-0-8153-4432-2 .
Litteratur
- Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A., Levine M., Losick R. Molecular Biology of the Gene (neopr.) . — 5:a. — Pearson Benjamin Cummings: CSHL Press, 2004. (Se särskilt kap. 6 och 9)
- Olson, WK, Bansal, M., Burley, SK, Dickerson, RE, Gerstein, M., Harvey, SC, Heinemann, X.-JLU, Neidle, S., Shakked, Z., Sklenar, H., Suzuki, M., Tung, C.-S., Westhof, E., Wolberger, C. & Berman, HM En standardreferensram för beskrivning av nukleinsyrabaspargeometri // Journal of Molecular Biology . - 2001. - Vol. 313. - S. 229-237.
- Myron F. Goodman. Vätebindning återbesökt: Geometriskt urval som en huvudsaklig bestämningsfaktor för DNA-replikationstrohet // Proceedings of the National Academy of Sciences . - 1997. - Vol. 94. - P. 10493-10495.
Länkar
- Nukleinsyrabaspargeometrinomenklatur - Universitetet i Hamburg - Biologiska fakulteten, höjdpunkter inom biokemi
 Ordböcker och uppslagsverk |
|---|