Human Proteome Project

Human Proteome Project ( HPP ) är ett internationellt projekt för att skapa en proteomkarta som inkluderar alla proteiner som kodas av det mänskliga genomet . Projektets primära uppgift är att sammanställa proteomiska kartor över huvudproteinerna i blodplasma , lever , hjärna [1] .

Historik

Det internationella projektet "Human Proteome" startade i september 2010 i Sydney och blev en fortsättning på projektet "Human Genome" [2] . Deltagarna i Human Proteome-projektet inkluderar sex initierande länder: Republiken Korea , USA , Ryska federationen , Sverige , Kanada och Iran ). När det gäller omfattningen av problemet och den uppskattade arbetsintensiteten i arbetet visade sig Human Proteome-projektet vara mycket större än Human Genome-projektet. Medan det mänskliga genomet består av cirka 20 tusen gener, överstiger antalet proteiner i människokroppen på grund av närvaron av olika proteinproteoformer 2 miljoner [3] . Dessutom, till skillnad från genomet, förändras proteomet ständigt beroende på påverkan av intracellulära och externa faktorer, och är faktiskt en uppsättning proteiner fixerade i tid i ett visst biologiskt objekt och i en viss situation.

Metoder

Bland metoderna för att studera proteomen som accepteras av det internationella samfundet, har en av de mest framgångsrikt utvecklade blivit en kromosom- eller gencentrerad metod, där resultaten av proteinanalys kartläggs till deras motsvarande proteinkodande gener . Formalisering av den vetenskapliga uppgiften på grund av det gencentrerade tillvägagångssättet gör implementeringen mycket mer realistisk jämfört med alternativa tillvägagångssätt (total proteintypning), vilket gör att du kan fokusera på proteiner som kodas av generna för en viss kromosom och därigenom dela upp projektet i separata delprojekt - enligt antalet kromosompar i genomet människa [4] .

Se även

Anteckningar

  1. ↑ Dedov, I. I., Tyulpakov, A. N., Chekhonin, V. P., Baklaushev, V. P., Archakov, A. I., & Moshkovsky, S. A. Personlig medicin: nuvarande tillstånd och framtidsutsikter // Bulletin of the Russian Academy of Medical Sciences. - 2012. - T. 67 , nr 12 . - S. 4-12 . — ISSN 0869-6047 . - doi : 10.15690/vramn.v67i12.474 .
  2. ↑ Legrain P., Aebersold R., Archakov A., Bairoch A., Bala K., Beretta L., Bergeron J., Borchers CH, Corthals GL, Costello CE et al. Det mänskliga proteomprojektet: nuvarande tillstånd och framtida riktning // Molecular & cellular proteomics. - 2011. - T. 10 , nr 7 . - S. M111. 009993 . - doi : 10.1074/mcp.M111.009993 .
  3. ↑ Archakov A., Zgoda V., Kopylov A., Naryzhny S., Chernobrovkin A., Ponomarenko E., Lisitsa A. Kromosomcentrerad strategi för att övervinna flaskhalsar i Human Proteome Project // Expertgranskning av proteomik. - 2012. - T. 9 , nr 6 . - S. 667-676 . - doi : 10.1021/pr300821n .
  4. ↑ Ponomarenko, E. A., Zgoda, V. G., Kopylov, A. T., Attorney, E. V., Igisonis, E. V., Lisitsa, A. V., & Archakov, A. I. Ryssland i det internationella projektet "human proteome": första resultat och framtidsutsikter // Biomedicinsk kemi. - 2015. - T. 61 , nr 2 . - S. 169-175 . - doi : 10.18097/PBMC20156102169 .

Litteratur