Retrotransposoner

Retrotransposoner ( mobila genetiska element av den första typen, eller transposoner som rör sig genom RNA- intermediärer) är genetiska element som kan reproducera sig själva i genomet och är allestädes närvarande komponenter i DNA från många eukaryota organismer .

Retrotransposoner är en underklass av transposoner . Retrotransposoner är brett distribuerade i växter, där de ofta är en viktig komponent i kärn -DNA . I majs består 49–78 % av arvsmassan av retrotransposoner, [1] i vete representeras cirka 90 % av arvsmassan av repeterande sekvenser, varav 68 % är transposerbara beståndsdelar. [2] Hos däggdjur består nästan hälften av genomet (45-48%) av transposoner eller rester av transposoner. Ungefär 42% av det mänskliga genomet består av retrotransposoner och cirka 2-3% av DNA-transposoner . [3]

Klassificering

Retrotransposoner, eller mobila genetiska element av den första typen, består av två subtyper - retrotransposoner med långa terminala upprepningar ( eng.  LTR , long terminal repeats ), och retrotransposoner utan långa terminala upprepningar.

De senare är i sin tur uppdelade i långa spridda upprepningar ( engelska  LINEs , long interspersed elements ) och korta spridda upprepningar ( engelska  SINE , short interspersed elements ).

Anteckningar

1. ↑ SanMiguel P., Bennetzen JL Bevis för att en nyligen ökad majsgenomstorlek orsakades av den massiva amplifieringen av intergena retrotranposoner  //  Annals of Botany  : journal. - 1998. - Vol. 82 , nr. Smidig A. - S. 37-44 . - doi : 10.1006/anbo.1998.0746 .
2. ↑ Li W., Zhang P., Fellers JP, Friebe B., Gill BS [www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x the core Triticeae genome]  (engelska)  // Plant J. : journal. - 2004. - November ( vol. 40 , nr 4 ). - S. 500-511 . - doi : 10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x . — PMID 15500466 .  (inte tillgänglig länk)
3. ↑ Lander ES, Linton LM, Birren B., et al. Initial sekvensering och analys av det mänskliga genomet  //  Nature : journal. - 2001. - Februari ( vol. 409 , nr 6822 ). - P. 860-921 . - doi : 10.1038/35057062 . — PMID 11237011 .

Litteratur

• Zhimulev I. F. Allmän och molekylär genetik. - 1. - Novosibirsk: Novosibirsk University Publishing House, 2002. - 459 s. - 2000 exemplar.  — ISBN 5761505096 .
• Liu, J., Gao, M., He, J., Wu, K., Lin, S., Jin, L., ... & Chen, J. (2021). RNA m 6 A-läsaren YTHDC1 tystar retrotransposoner och skyddar ES-cellidentitet. Nature, 591(7849), 322-326. PMID 33658714 doi : 10.1038/s41586-021-03313-9
• Billon, V., & Cristofari, G. (2021). Nascent RNA m 6 En modifiering i hjärtat av gen-retrotransposonkonflikten. Cellforskning, 1-3. doi : 10.1038/s41422-021-00518-5
• Xu, Z., Ma, A. & Ma, YC (2021). RNA-metylering bevarar ES-cellidentitet genom kromatin-tystnad av retrotransposoner. Sig Transduct Target Ther 6, 258 . doi : 10.1038/s41392-021-00683-4

Se även

• transposoner
• DNA-transposoner

Ordböcker och uppslagsverk	Britannica (online)