Epigenetisk klocka

Den epigenetiska klockan är en uppsättning epigenetiska DNA-märken som bestämmer den biologiska åldern för en vävnad, cell eller organ. Det mest kända exemplet på en epigenetisk klocka är Steve Horvaths klocka, som tar hänsyn till 353 epigenetiska markörer av det mänskliga genomet [1] [2] [3] . Andra versioner av den epigenetiska klockan har också utvecklats: K. Weidners klocka, baserad på metylering av tre CpG-dinukleotider [4] , I. Florats klocka [5] , G. Hannums komplexa klocka [6] och K. Giulianis klocka, vars indikator beräknas från metylering av tre gener i DNA-prover från dentin [7] .

Upptäcktshistorik

Ålderns betydande inverkan på nivån av DNA-metylering har varit känt sedan 1960 -talet [8] . Ett stort antal verk beskriver uppsättningar av CpG-dinukleotider vars metylering korrelerar med ålder [9] [10] [11] . Flera arbeten ägnas åt bedömning av biologisk ålder genom DNA-metylering i saliv [12] eller blod [6] .

Bakgrund till skapandet av den epigenetiska klockan

Ålder är en av kroppens grundläggande egenskaper, och därför finner biomarkörer för åldrande många tillämpningar inom biologisk forskning. Den biologiska klockan för åldrande kan användas inom följande områden:

I allmänhet kan den biologiska klockan vara användbar för att undersöka orsakerna till åldrande och bekämpa det.

Samband med orsakerna till biologiskt åldrande

Det är inte helt klart vad som exakt mäts av den epigenetiska klockan. Professor Horvaths hypotes var att åldern som erhölls från beräkningsresultaten återspeglar den totala effekten av systemen för att införa epigenetiska modifieringar av kroppen. De flesta åldersrelaterade förändringar i DNA-metylering är vävnadsspecifika, med undantag för metylering av ELOVL2-genpromotorn, som fungerar som den huvudsakliga regulatorn av syntesen (förlängningen) av fleromättade fettsyror (PUFAs) som är nödvändiga för en effektiv funktion av endoplasmatiskt retikulum och mitokondrier [13] [14] . Därför utvecklades förenklade versioner av den epigenetiska klockan universell för alla vävnader, baserade på åldersbestämning genom graden av metylering av endast en CpG i ELOVL2-genen [15] [16] .

Ålder beräknad från DNA-metylering förutsäger dödlighet av alla orsaker i hög ålder [17] [18] vilket tyder på ett samband mellan metylering och orsaken till mänskligt åldrande [17] . Det är dock osannolikt att de CpG-par som används i 353-metoden direkt spelar en roll i åldringsprocessen [1] . Det är mer troligt att den epigenetiska klockan upptäcker den systemiska effekten av epigenomet. Avgörande är att den epigenetiska klockan har visat att " åldrande verkligen är evolutionärt bevarat och relaterat till utvecklingsprocesser hos alla däggdjursarter." [19] [20]

För att förstå essensen av den epigenetiska klockan skulle det vara rimligt att jämföra och hitta de underliggande processerna som medierar förhållandet mellan avläsningarna av den epigenetiska klockan och den åldrande klockan på basis av transkriptomet [21] [22] [23] [ 24] [25] , såväl som på basis av proteomdata. [26] [27] [28] [29] Enligt författarna till den proteomiska klockan, förutspådde deras proteomiska åldersmodell dödlighet mer exakt än kronologisk ålder och svaghetsindex . [30] [29] Den proteomiska klockmetoden är baserad på SomaScan-teknologin som mäter fluorescensen hos aptamerer bundna till målproteiner. Med dessa aptamerer, skapade med hjälp av en mångsidig kemisk teknologi som förser nukleotider med proteinliknande funktionella grupper för att upptäcka biomarkörproteiner, kan tusentals proteiner mätas samtidigt (och mycket billigt) i små provvolymer (15 µl serum eller plasma). [31] Det viktigaste är att genom att analysera data om de proteiner som har förändrats kraftigast med åldrandet, är det möjligt att hitta och utvärdera effektiviteten hos riktade anti-aging läkemedel. [29]

Det har visat sig att de flesta åldersrelaterade CpGs samexisterar med utvecklingsgener, och åldrande kan åtföljas av ökat uttryck av utvecklingsgener. [32] [29] Följaktligen finns dessa CpGs i bivalenta kromatindomäner och mål av undertryckta polycombs , som är element som kontrollerar uttrycket av utvecklingsgener . Medan ökad metylering av CpGs vid förstärkare sannolikt undertrycker genuttryck, kan metylering av CpG vid bivalenta kromatindomäner å andra sidan stimulera uttrycket av motsvarande nedströms loci , som ofta är utvecklingsgener. [32] [19]

Horvaths epigenetiska klocka

Horvath Epigenetic Clock utvecklades av Steve Horvath, professor i human genetik och biostatistik vid UCLA. En artikel om detta ämne publicerades först den 21 oktober 2013 i tidskriften Genome Biology [1] . Horvath har samlat in öppna data om human DNA-metylering i över 4 år och har identifierat lämpliga statistiska metoder. Historien om denna upptäckt behandlades i tidskriften Nature [33] . Klockan utvecklades med hjälp av 8 000 prover från 82 DNA-metyleringsdataset genererade av Illumina- plattformen . Den främsta innovativa egenskapen hos Horvaths epigenetiska klocka är dess breda tillämpningsområde. De tillåter att förutsäga ålder oavsett vävnad, utan att införa några ytterligare justeringar [1] . Denna funktion gör det möjligt att jämföra den biologiska åldern för olika vävnader inom samma organism med hjälp av samma åldrande klocka.

Termen "klocka" i detta fall definieras som en metod för att uppskatta ålder baserat på 353 epigenetiska DNA-markörer. Uppsättningsindexet har följande egenskaper: för det första är det nära noll i embryonala och inducerade stamceller , för det andra korrelerar det med cellpassagenummer, och för det tredje är metoden tillämpbar på schimpansvävnader (som används som analoger till mänskliga vävnader i vissa studier).

Tillväxten av organismen (och åtföljande celldelning) leder till en hög hastighet av "körning" av den epigenetiska klockan, som minskar till ett konstant värde (linjärt beroende) efter att en person når 20 års ålder [1] . Många fysiologiska och mentala indikatorer på åldrande korrelerar med den epigenetiska klockan [34] .

Det genomsnittliga felet i åldersbestämning är 3,6 år över ett brett spektrum av vävnader och celltyper [1] . Metoden fungerar bra både i heterogena vävnader och i enskilda cellinjer. Ålder förutspådd av Horvath-metoden har Pearsons korrelationskoefficient lika med r=0,96 med kronologisk ålder [1] , vilket är mycket nära maxvärdet - ett.

Det finns en online-kalkylator där du kan ladda ner genommetyleringsdata och få en uppskattning av epigenetisk ålder med hjälp av Howarth-metoden.

Hannums epigenetiska klocka

Samma år som artikeln om Horvaths epigenetiska klocka publicerades en annan liknande studie [6] . Författarna, inklusive Gregory Hannum, byggde en modell för att kvantifiera åldrande med hjälp av mätningar av mer än 450 000 CpG-dinukleotider från blodkroppar från personer i åldern 19 till 101 år. Av de många CpGs identifierades 71 positioner med statistiska metoder, enligt vilka den slutliga modellen för beräkning av ålder byggdes upp. Enligt författarna påverkas graden av epigenetisk åldrande av mänskligt kön och genom variation.

Det ursprungliga verket säger att modellen fungerar inte bara för blodkroppar, utan även i andra vävnader. Vissa senare arbeten betonar dock att Hannums klocka är specifik för blod, medan Horvaths klocka kan appliceras på en mängd olika prover [35] . Det finns också verk som refererar till de epigenetiska klockorna i Horvath och Hannum som likvärdiga [36] [37] . I en studie på en liten grupp hundraåringar gav Hannums klocka mer exakta uppskattningar av ålder från leukocyt-DNA-metyleringsdata än Horvats klocka [35] .

Epigenetisk klocka baserad på ett litet antal CpG-platser

Även om klockor som använder hundratals CpG-platser mer exakt kan återspegla biologisk ålder, kompliceras deras praktiska användning av deras kostnad. Därför har flera versioner av den epigenetiska klockan baserad på ett litet antal CpG-ställen utvecklats med samma eller till och med ökad noggrannhet [38] [39] . Att minska antalet CpG-platser gör det också möjligt att standardisera och göra jämförbara resultat som erhållits av olika laboratorier [40] [41] , samt att använda maskininlärningsmetoder för att skapa nya mer exakta klockor [42] [43] . De gener som oftast används i sådana klockor är: ELOVL2 (site cg16867657) [44] [45] [46] , samt EDARADD [47] [41] , C1orf132 , TRIM59, FHL2 och KLF14 [49] [38]

Andra versioner av den biologiska klockan

Det finns en biologisk klocka baserad på a) telomerlängd b) p16INK4a uttrycksnivå [50] c) mutationer i mikrosatelliter [51] . Korrelationen i fall (a) är r=-0,51 för kvinnor och r=-0,55 för män [52] . Korrelation mellan p16INK4a-uttryck i T-celler r=0,56 [53] . En lovande biologisk klocka är "eyeAge" retinal åldrande klocka från ögonbotten fotografier, utvecklad med en djupinlärning datormodell som kan förutsäga mänsklig åldrande på mindre än ett års tidsskala med 71% noggrannhet [54] [55] .

Det har gjorts ett antal studier (Wang et al [56] , Petkovic et al [57] ) som undersöker om möss har förändringar i metyleringsmönster som liknar människor med åldern. Forskarna fann att den epigenetiska åldern hos möss artificiellt ökad i livslängd (genom kalorikontroll eller rapamycinintag) var betydligt lägre än för en kontrollgrupp i samma ålder.

En epigenetisk klocka designad för att förutsäga ålder hos möss är baserad på 329 unika CpG-dinukleotider och har ett genomsnittligt absolut fel på 4 veckor (5 % av livslängden). Försök att använda mänskliga klockor i möss har visat att mänskliga klockor inte är helt konservativa hos möss. Skillnader i mus- och mänskliga klockor tyder på att epigenetiska klockor bör kalibreras separat för olika arter.

En lovande riktning verkar vara utvecklingen av en epigenetisk klocka för att bestämma åldern på vilda och tama djur [58] .

Se även

Länkar

  1. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Steve Horvath. DNA-metyleringsålder för mänskliga vävnader och celltyper  (engelska)  // BioMed Central. — 2013-12-10. — Vol. 14 . — S. 3156 . — ISSN 1474-760X . - doi : 10.1186/gb-2013-14-10-r115 .
  2. ↑ Steve Horvath. Erratum till: DNA-metyleringsålder för mänskliga vävnader och celltyper  (engelska)  // BioMed Central. — 2015-05-13. — Vol. 16 . — S. 96 . — ISSN 1465-6906 . - doi : 10.1186/s13059-015-0649-6 .
  3. ↑ Forskare avslöjar inre klocka som kan mäta åldern på de flesta mänskliga vävnader; Kvinnors bröstvävnad åldras snabbare än resten av  kroppen , ScienceDaily . Hämtad 30 november 2017.
  4. ↑ Carola Ingrid Weidner, Qiong Lin, Carmen Maike Koch, Lewin Eisele, Fabian Beier. Åldrande av blod kan spåras av DNA-metyleringsförändringar på bara tre CpG-ställen  //  BioMed Central. — 2014-02-03. — Vol. 15 . — P.R24 . — ISSN 1474-760X . - doi : 10.1186/gb-2014-15-2-r24 .
  5. ↑ Ines Florath, Katja Butterbach, Heiko Müller, Melanie Bewerunge-Hudler, Hermann Brenner. Tvärsnitts- och longitudinella förändringar i DNA-metylering med ålder: en epigenomomfattande analys som avslöjar över 60 nya åldersassocierade CpG-ställen  // Human Molecular Genetics. — Oxford University Press , 2014-03-01. - T. 23 , nej. 5 . - S. 1186-1201 . — ISSN 0964-6906 . doi : 10.1093 / hmg/ddt531 .
  6. ↑ 1 2 3 Gregory Hannum, Justin Guinney, Ling Zhao, Li Zhang, Guy Hughes. Genomomfattande metyleringsprofiler avslöjar kvantitativa synpunkter på mänsklig åldrandehastighet  // Molecular Cell. - T. 49 , nej. 2 . - S. 359-367 . - doi : 10.1016/j.molcel.2012.10.016 .
  7. ↑ Cristina Giuliani, Elisabetta Cilli, Maria Giulia Bacalini, Chiara Pirazzini, Marco Sazzini. Härleda kronologisk ålder från DNA-metyleringsmönster för mänskliga tänder  (engelska)  // American Journal of Physical Anthropology. — 2016-04-01. — Vol. 159 , iss. 4 . - S. 585-595 . — ISSN 1096-8644 . - doi : 10.1002/ajpa.22921 .
  8. ↑ GD Berdyshev, GK Korotaev, GV Boiarskikh, BF Vaniushin. [Nukleotidsammansättning av DNA och RNA från somatiska vävnader av puckelrygg och dess förändringar under leken ] // Biokhimiia (Moskva, Ryssland). - September 1967. - T. 32 , nr. 5 . - S. 988-993 . — ISSN 0320-9725 .
  9. ↑ Steve Horvath, Yafeng Zhang, Peter Langfelder, René S. Kahn, Marco PM Boks. Åldrande effekter på DNA-metyleringsmoduler i mänsklig hjärna och blodvävnad  //  BioMed Central. — 2012-10-03. — Vol. 13 . — P.R97 . — ISSN 1474-760X . - doi : 10.1186/gb-2012-13-10-r97 .
  10. ↑ Vardhman K. Rakyan, Thomas A. Down, Siarhei Maslau, Toby Andrew, Tsun-Po Yang. Humant åldrande-associerad DNA-hypermetylering förekommer företrädesvis vid bivalenta kromatindomäner  //  Genome Research. — 2010-04-01. — Vol. 20 , iss. 4 . - s. 434-439 . — ISSN 1549-5469 1088-9051, 1549-5469 . - doi : 10.1101/gr.103101.109 .
  11. ↑ Andrew E. Teschendorff, Usha Menon, Aleksandra Gentry-Maharaj, Susan J. Ramus, Daniel J. Weisenberger. Åldersberoende DNA-metylering av gener som är undertryckta i stamceller är ett kännetecken för cancer  //  Genomforskning. — 2010-04-01. — Vol. 20 , iss. 4 . - S. 440-446 . — ISSN 1549-5469 1088-9051, 1549-5469 . - doi : 10.1101/gr.103606.109 .
  12. ↑ Sven Bocklandt, Wen Lin, Mary E. Sehl, Francisco J. Sánchez, Janet S. Sinsheimer. Epigenetic Predictor of Age  (engelska)  // PLOS One . - Public Library of Science , 2011-06-22. — Vol. 6 , iss. 6 . — P. e14821 . — ISSN 1932-6203 . - doi : 10.1371/journal.pone.0014821 .
  13. ↑ Slieker, RC, Relton, CL, Gaunt, TR, Slagboom, PE, & Heijmans, BT (2018). Åldersrelaterade DNA-metyleringsförändringar är vävnadsspecifika med ELOVL2-promotormetylering som ett undantag. Epigenetik & kromatin, 11(1), 1-11. PMID 29848354 PMC 5975493 doi : 10.1186/s13072-018-0191-3
  14. ↑ Li, X., Wang, J., Wang, L., Gao, Y., Feng, G., Li, G., ... & Zhang, K. (2022). Dysfunktion i lipidmetabolismen inducerad av åldersberoende DNA-metylering påskyndar åldrandet. Signaltransduktion och målinriktad terapi, 7(1), 1-12. PMID 35610223 PMC 9130224 doi : 10.1038/s41392-022-00964-6
  15. ↑ Garagnani, P., Bacalini, MG, Pirazzini, C., Gori, D., Giuliani, C., Mari, D., ... & Franceschi, C. (2012). Metylering av ELOVL2-genen som en ny epigenetisk åldersmarkör. Åldrande cell, 11(6), 1132-1134. PMID 23061750 doi : 10.1111/acel.12005
  16. ↑ Manco, L., & Dias, H.C. (2022). DNA-metyleringsanalys av ELOVL2-genen med användning av droplet digital PCR för åldersuppskattningsändamål. Forensic Science International, 333, 111206. PMID 35131731 doi : 10.1016/j.forsciint.2022.111206
  17. ↑ 1 2 Brian H. Chen, Riccardo E. Marioni, Elena Colicino, Marjolein J. Peters, Cavin K. Ward-Caviness. DNA-metyleringsbaserade mått på biologisk ålder: metaanalys som förutsäger tid till döden  // Åldrande. - T. 8 , nej. 9 . - S. 1844-1865 . - doi : 10.18632/aging.101020 .
  18. ↑ Riccardo E. Marioni, Sonia Shah, Allan F. McRae, Brian H. Chen, Elena Colicino. DNA-metyleringsålder för blod förutsäger dödlighet av alla orsaker senare i livet  //  BioMed Central. — 2015-01-30. — Vol. 16 . — S. 25 . — ISSN 1465-6906 . - doi : 10.1186/s13059-015-0584-6 .
  19. ↑ 1 2 Ake T. Lu, Zhe Fei, Amin Haghani, Todd R. Robeck et al., & Steve Horvath (2021). Universell DNA-metyleringsålder över däggdjursvävnader . biorxiv.org doi : 10.1101/2021.01.18.426733
  20. ↑ Arneson, A., Haghani, A., Thompson, MJ, Pellegrini, M., Kwon, SB, Vu, HT, ... & Horvath, S. (2021). En däggdjursmetyleringsmatris för profilering av metyleringsnivåer vid konserverade sekvenser . bioRxiv, 2021-01. doi : 10.1101/2021.01.07.425637
  21. ↑ Meyer, D., & Schumacher, B. (2020). En transkriptombaserad åldringsklocka nära den teoretiska gränsen för noggrannhet . bioRxiv. doi : 10.1101/2020.05.29.123430
  22. ↑ Fleischer, JG, Schulte, R., Tsai, HH, Tyagi, S., Ibarra, A., Shokhirev, MN, ... & Navlakha, S. (2018). Förutsäga ålder från transkriptomet av humana dermala fibroblaster. Genome biology, 19(1), 221. doi : 10.1186/s13059-018-1599-6 PMC 6300908 PMID 30567591
  23. ↑ Shokhirev, MN, & Johnson, AA (2021). Modellering av mänskligt åldrande transkriptom över vävnader, hälsostatus och kön. Åldrande cell , 20(1), e13280. PMC 7811842 doi : 10.1111/acel.13280
  24. ↑ Wang, F., Yang, J., Lin, H., Li, Q., Ye, Z., Lu, Q., ... & Tian, ​​​​G. (2020). Förbättrad mänsklig åldersförutsägelse genom att använda genuttrycksprofiler från flera vävnader. Frontiers in Genetics, 11. PMC 7546819 doi : 10.3389/fgene.2020.01025
  25. ↑ LaRocca, T.J., Cavalier, A.N., & Wahl, D. (2020). Repetitiva element som en transkriptomisk markör för åldrande: bevis i flera datamängder och modeller. Aging Cell, 19(7), e13167. PMID 32500641 PMC 7412685 doi : 10.1111/acel.13167
  26. ↑ Lehallier, B., Shokhirev, MN, Wyss-Coray, T., & Johnson, AA (2020). Datautvinning av mänskliga plasmaproteiner genererar en mängd mycket prediktiva klockor för åldrande som återspeglar olika aspekter av åldrande. Åldrande cell, 19(11), e13256. PMID 33031577 PMC 7681068 doi : 10.1111/acel.13256
  27. ↑ Johnson, A.A., Shokhirev, MN, Wyss-Coray, T., & Lehallier, B. (2020). Systematisk granskning och analys av studier av mänsklig proteomik åldrande avslöjar en ny proteomisk åldrandeklocka och identifierar nyckelprocesser som förändras med åldern. Åldrandeforskningsöversikter, 101070. PMID 32311500 doi : 10.1016/j.arr.2020.101070
  28. ↑ Moaddel, R., Ubaida-Mohien, C., Tanaka, T., Lyashkov, A., Basisty, N., Schilling, B., ... & Ferrucci, L. (2021). Proteomics i åldrande forskning: En färdplan till klinisk, translationell forskning. Åldrande cell, e13325. PMID 33730416 doi : 10.1111/acel.13325
  29. ↑ 1 2 3 4 Johnson, A.A., Shokhirev, MN, & Lehallier, B. (2021). Proteininmatningarna från en ultraförutsägande åldrandeklocka representerar livskraftiga anti-aging läkemedelsmål. Aging Research Reviews, 70, 101404. PMID 34242807 doi : 10.1016/j.arr.2021.101404
  30. ↑ Sathyan, S., Ayers, E., Gao, T., Weiss, E.F., Milman, S., Verghese, J., & Barzilai, N. (2020). Plasmaproteomisk profil av ålder, hälsospann och dödlighet av alla orsaker hos äldre vuxna. Åldrande cell, 19(11), e13250. PMID 33089916 PMC 7681045 doi : 10.1111/acel.13250
  31. ↑ Gold, L., Ayers, D., Bertino, J., Bock, C., Bock, A., Brody, E., ,,, & Zichi, D. (2010). Aptamer-baserad multiplexerad proteomisk teknologi för upptäckt av biomarkörer. PLOS One. 2010; 5(12): e15004 PMID 21165148 PMC 3000457 doi : 10.1371/journal.pone.0015004
  32. ↑ 1 2 Horvath, S., Haghani, A., Peng, S., Hales, EN, Zoller, JA, Raj, K., ... & Finno, CJ (2021). DNA-metylering åldrande och transkriptomiska studier på hästar . bioRxiv. doi : 10.1101/2021.03.11.435032
  33. ↑ W. Wayt Gibbs. Biomarkörer och åldrande: The clock-watcher   // Nature . — 2014-04-10. — Vol. 508 , utg. 7495 . - S. 168-170 . - doi : 10.1038/508168a .
  34. ↑ Riccardo E. Marioni, Sonia Shah, Allan F. McRae, Stuart J. Ritchie, Graciela Muniz-Terrera. Den epigenetiska klockan är korrelerad med fysisk och kognitiv kondition i Lothian Birth Cohort 1936  // International Journal of Epidemiology. — 2015-08-01. - T. 44 , nej. 4 . - S. 1388-1396 . — ISSN 0300-5771 . - doi : 10.1093/ije/dyu277 .
  35. ↑ 1 2 Nicola J Armstrong, Karen A Mather, Anbupalam Thalamuthu, Margaret J Wright, Julian N Trollor. Åldrande, exceptionell livslängd och jämförelser av de epigenetiska klockorna Hannum och Horvath  // Epigenomics. — 2017-05-01. - T. 9 , nej. 5 . - S. 689-700 . — ISSN 1750-1911 . - doi : 10.2217/epi-2016-0179 .
  36. ↑ Meaghan J. Jones, Sarah J. Goodman, Michael S. Kobor. DNA-metylering och mänskligt hälsosamt åldrande  // Aging Cell  . — 2015-12-01. — Vol. 14 , iss. 6 . - P. 924-932 . — ISSN 1474-9726 . - doi : 10.1111/acel.12349 .
  37. ↑ Michele Zampieri, Fabio Ciccarone, Roberta Calabrese, Claudio Franceschi, Alexander Bürkle. Omkonfigurering av DNA-metylering vid åldrande  //  Mechanisms of Aging and Development. — Vol. 151 . - S. 60-70 . - doi : 10.1016/j.mad.2015.02.002 .
  38. ↑ 1 2 Li, A., Mueller, A., English, B., Arena, A., Vera, D., Kane, A.E., & Sinclair, D.A. (2022). Nya funktionsvalsmetoder för konstruktion av exakta epigenetiska klockor. PLoS beräkningsbiologi, 18(8), e1009938. PMID 35984867 PMC 9432708 doi : 10.1371/journal.pcbi.1009938
  39. ↑ Johnson, AA, Torosin, NS, Shokhirev, MN, & Cuellar, TL (2022). En uppsättning vanliga buckala CpGs som förutsäger epigenetisk ålder och associerar med livslängdsreglerande gener . iScience, 105304. doi : 10.1016/j.isci.2022.105304.
  40. ↑ Weidner, CI, Lin, Q., Koch, CM, Eisele, L., Beier, F., Ziegler, P., ... & Wagner, W. (2014). Åldrande av blod kan spåras av DNA-metyleringsförändringar på bara tre CpG-ställen. Genombiologi, 15(2), 1-12. PMID 24490752 PMC 4053864 doi : 10.1186/gb-2014-15-2-r24
  41. ↑ 1 2 Daunay, A., Hardy, LM, Bouyacoub, Y., Sahbatou, M., Touvier, M., Blanché, H., ... & How-Kit, A. (2022). Hundraåringar presenterar konsekvent en yngre epigenetisk ålder än deras kronologiska ålder med fyra epigenetiska klockor baserade på ett litet antal CpG-platser. Aging, 14(19), 7718-7733. PMID 36202132 doi : 10.18632/aging.204316
  42. ↑ Zaguia, A., Pandey, D., Painuly, S., Pal, SK, Garg, VK, & Goel, N. (2022). DNA-metyleringsbiomarkörer-baserad förutsägelse av mänsklig ålder med hjälp av maskininlärning. Computational Intelligence and Neuroscience, 2022. PMID 35111213 PMC 8803417 doi : 10.1155/2022/8393498
  43. ↑ Fan, H., Xie, Q., Zhang, Z., Wang, J., Chen, X., & Qiu, P. (2021). Kronologisk åldersförutsägelse: utvecklingsutvärdering av DNA-metyleringsbaserade maskininlärningsmodeller. Frontiers in bioengineering and biotechnology, 9. PMID 35141217 PMC 8819006 doi : 10.3389/fbioe.2021.819991
  44. ↑ Slieker, RC, Relton, CL, Gaunt, TR, Slagboom, PE, & Heijmans, BT (2018). Åldersrelaterade DNA-metyleringsförändringar är vävnadsspecifika med ELOVL2-promotormetylering som ett undantag. Epigenetik & kromatin, 11(1), 1-11. PMID 29848354 PMC 5975493 doi : 10.1186/s13072-018-0191-3
  45. ↑ Garagnani, P., Bacalini, MG, Pirazzini, C., Gori, D., Giuliani, C., Mari, D., ... & Franceschi, C. (2012). Metylering av ELOVL 2-genen som en ny epigenetisk åldersmarkör. Åldrande cell, 11(6), 1132-1134. PMID 23061750 doi : 10.1111/acel.12005
  46. ↑ Manco, L., & Dias, H.C. (2022). DNA-metyleringsanalys av ELOVL2-genen med användning av droplet digital PCR för åldersuppskattningsändamål. Forensic Science International, 333, 111206. PMID 35131731 doi : 10.1016/j.forsciint.2022.111206
  47. ↑ Ni, XL, Yuan, HP, Jiao, J., Wang, ZP, Su, HB, Lyu, Y., ... & Yang, Z. (2022). En epigenetisk klockmodell för att bedöma människans biologiska ålder av hälsosamt åldrande. Zhonghua yi xue za zhi, 102(2), 119-124. PMID 35012300 doi : 10.3760/cma.j.cn112137-20210817-01862
  48. ↑ Spólnicka, M., Pośpiech, E., Pepłońska, B., Zbieć-Piekarska, R., Makowska, Ż., Pięta, A., ... & Branicki, W. (2018). DNA-metylering i ELOVL2 och C1orf132 förutspådde korrekt kronologisk ålder hos individer från tre sjukdomsgrupper. International journal of legal medicine, 132(1), 1-11. PMID 28725932 PMC 5748441 doi : 10.1007/s00414-017-1636-0
  49. ↑ Jung, SE, Lim, SM, Hong, SR, Lee, EH, Shin, KJ, & Lee, HY (2019). DNA-metylering av generna ELOVL2, FHL2, KLF14, C1orf132/MIR29B2C och TRIM59 för åldersförutsägelse från blod-, saliv- och buckala pinnprover. Forensic Science International: Genetics, 38, 1-8. PMID 30300865 doi : 10.1016/j.fsigen.2018.09.010
  50. ↑ Manuel Collado, Maria A. Blasco, Manuel Serrano. Cellulär åldrande i cancer och åldrande  (engelska)  // Cell . — Cell Tryck på . — Vol. 130 , iss. 2 . - S. 223-233 . - doi : 10.1016/j.cell.2007.07.003 .
  51. ↑ Peter Forster, Carsten Hohoff, Bettina Dunkelmann, Marianne Schürenkamp, ​​​​Heidi Pfeiffer. Förhöjd könscellsmutationshastighet hos tonårspappor   // Proc . R. Soc. B. - 2015-03-22. — Vol. 282 , utg. 1803 . — P. 20142898 . — ISSN 1471-2954 0962-8452, 1471-2954 . - doi : 10.1098/rspb.2014.2898 .
  52. ↑ Katarina Nordfjäll, Ulrika Svenson, Karl-Fredrik Norrback, Rolf Adolfsson, Göran Roos. Storskalig jämförelse mellan föräldrar och barn bekräftar ett starkt faderligt inflytande på telomerlängden  //  European Journal of Human Genetics. - 2010/03. - T. 18 , nej. 3 . - S. 385-389 . — ISSN 1476-5438 . - doi : 10.1038/ejhg.2009.178 .
  53. ↑ Wang, Ye, Zang, Xinjie, Wang, Yao, Chen, Peng. Högt uttryck av p16INK4a och lågt uttryck av Bmi1 är associerat med endotelcellulär senescens i den mänskliga hornhinnan . www.molvis.org (3 april 2012). Hämtad: 1 december 2017.
  54. ↑ Ahadi S, Wilson KA., Babenko B et al. (2022). Longitudinell fundusavbildning och dess genomomfattande associationsanalys ger bevis för en mänsklig åldrandeklocka för näthinnan . bioRxiv. doi : 10.1101/2022.07.25.501485
  55. ↑ Le Goallec, A., Diai, S., Collin, S., Vincent, T., & Patel, CJ (2021). Identifiera de genetiska och icke-genetiska faktorerna förknippade med accelererat ögonåldrande genom att använda djupinlärning för att förutsäga ålder från ögonbotten och bilder med optisk koherenstomografi . medRxiv.
  56. ↑ Tina Wang, Brian Tsui, Jason F. Kreisberg, Neil A. Robertson, Andrew M. Gross. Epigenetiska åldrande signaturer hos mösslever bromsas av dvärgväxt, kalorirestriktion och rapamycinbehandling  //  BioMed Central. — 2017-03-28. — Vol. 18 . — S. 57 . — ISSN 1474-760X . - doi : 10.1186/s13059-017-1186-2 .
  57. ↑ Daniel A. Petkovich, Dmitriy I. Podolskiy, Alexei V. Lobanov, Sang-Goo Lee, Richard A. Miller. Använda DNA-metyleringsprofilering för att utvärdera biologisk ålder och livslängdsinterventioner  // Cellmetabolism. - T. 25 , nej. 4 . - P. 954-960.e6 . - doi : 10.1016/j.cmet.2017.03.016 .
  58. ↑ Ricardo De Paoli-Iseppi, Bruce E. Deagle, Clive R. McMahon, Mark A. Hindell, Joanne L. Dickinson. Mätning av djurs ålder med DNA-metylering: Från människor till vilda djur  //  Frontiers in Genetics. - 2017. - Vol. 8 . - ISSN 1664-8021 . - doi : 10.3389/fgene.2017.00106 .

Litteratur

  Gå till Wikidata-objektet  Ordböcker och uppslagsverk