DNA-metylering

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 3 december 2019; kontroller kräver 9 redigeringar .

DNA-metylering är en modifiering av DNA-  molekylen utan att ändra själva DNA-nukleotidsekvensen, vilket kan betraktas som en del av den epigenetiska komponenten i genomet [1] [2] [3] .

DNA-metylering består i tillägg av en metylgrupp till cytosin som en del av en CpG-dinukleotid vid C5-positionen i cytosinringen. Metylering i promotorregionen av en gen leder vanligtvis till suppression av motsvarande gen. Det metylerade cytosinet kan sedan oxideras av specifika enzymer, vilket så småningom leder till dess demetylering tillbaka till cytosin [4] .

DNA-metylering tros vara övervägande karakteristisk för eukaryoter . Hos människor är cirka 1 % av genomiskt DNA metylerat. I vuxna somatiska celler sker DNA-metylering vanligtvis vid CpG-dinukleotider ; DNA-metylering utanför CpG-dinukleotider sker i embryonala stamceller . [5] [6]

Dessutom är DNA-metylering utanför CpG-dinukleotider ett kännetecken för epigenomet hos pluripotenta stamceller, och en minskning av icke-CG-metylering är associerad med nedsatt förmåga att differentiera till endodermala cellinjer [7]

I växter sker cytosinmetylering både symmetriskt längs båda kedjorna (på CpG eller CpNpG) och asymmetriskt på endast en av de två kedjorna (på CpNpNp, där N står för valfri nukleotid).

DNA-metylering hos däggdjur

Cirka 60-70 % av alla CpG-dinukleotider i däggdjur är metylerade. Ometylerade CpG-dinukleotider grupperas i sk. " CpG - öar " som finns i de 5' regulatoriska regionerna av många gener . Olika sjukdomar, såsom cancer , åtföljs av en initial onormal DNA-hypometylering och efterföljande hypermetylering av CpG-öar i genernas promotorregioner, vilket leder till ihållande transkriptionell repression. Transkriptionell repression i detta fall medieras av proteiner som kan binda till metylerade CpG-dinukleotider. Dessa proteiner, som kallas metylcytosinbindande proteiner , rekryterar histondeacetylas (HDAC) och andra faktorer som är involverade i kromatinombyggnad. Det bildade komplexet kan modifiera histoner och bilda en kondenserad transkriptionellt inaktiv heterokromatinstruktur . DNA-metyleringens inverkan på kromatinets struktur är av stor betydelse för en levande organisms utveckling och funktion. Särskilt frånvaron av metylcytosinbindande protein 2 (MeCP2), på grund av till exempel en mutation i motsvarande gen, leder till utvecklingen av Retts syndrom hos människor; inaktivering av metylcytosinbindande domänprotein 2 (MBD2), som är involverat i undertryckandet av transkription av hypermetylerade gener, har noterats vid onkologiska sjukdomar.

DNA-metylering hos människor

Hos människor är tre enzymer, kallade DNA-metyltransferaserna 1, 3a och 3b (DNMT1, DNMT3a, DNMT3b), ansvariga för DNA-metylering . Det antas att DNMT3a och DNMT3b är de novo metyltransferaser som bildar DNA-metyleringsmönstret i de tidiga utvecklingsstadierna, såväl som dess förändringar under celldifferentiering. Det finns en hypotes att de novo DNA-metylering orsakas, i synnerhet, av att störa RNA genom RNA-beroende DNA-metylering, en process som uppstod under evolutionen för att undertrycka mobila element i genomet. [8] DNMT1 är ett DNA-metyltransferas som upprätthåller det metylerade tillståndet av DNA genom att lägga till metylgrupper till en av DNA-strängarna vid punkter där en annan komplementär sträng är metylerad. Icke-polyadenylerade långa icke- kodande RNA (lncRNA) är tänkta att spela rollen som DNMT1-hämmare som reglerar DNA-metylering [9] DNMT3L-proteinet är homologt med andra DNMT-proteiner, men har ingen katalytisk aktivitet. Istället stöder DNMT3L de novo metyltransferaser genom att underlätta bindningen av dessa enzymer till DNA och stimulera deras aktivitet.

Viktiga stadier i utvecklingen av maligna neoplasmer är preliminär DNA-hypometylering [10] och efterföljande inaktivering av tumörtillväxtsuppressorgener [11] . I fallet där inaktivering berodde på metylering av promotorregionen av genen, utfördes experiment för att återställa uttryck genom att hämma DNMT. 5-aza-2'-deoxicytidin ( decitabin ) är en nukleosidanalog som hämmar DNMT-metyltransferaser. Läkemedlets verkningsmekanism är baserad på den kovalenta bindningen av enzymet i komplex med DNA, vilket gör det omöjligt för enzymet att utföra sin funktion och leder till nedbrytning av metyltransferas. Men för att decitabin ska vara aktivt måste det integreras i cellens arvsmassa , men detta kan i sin tur orsaka mutationer i dotterceller om cellen inte dör och fortsätter att dela sig. Dessutom är decitabin giftigt för benmärgen, vilket begränsar dess terapeutiska användning. Dessa begränsningar har lett till ett intensivt sökande efter terapeutiska ingrepp baserat på användningen av "antisense" RNA som motverkar DNMT genom att bryta ned dess mRNA och därför blockerar translation . Förmågan att selektivt demetylera en gen och därmed ändra dess uttryck tillhandahålls av upptäckten av det så kallade extrakodande RNA:t, som kan binda till DNMT1, vilket blockerar dess förmåga att metylera en viss gen [12] . Frågan kvarstår dock om hämning av DNMT1-funktion är ett tillräckligt villkor för ökat uttryck av suppressorgener vars transkription nedregleras av DNA-metylering.

Analys av mänskliga personliga transkriptomer och metylomer visade att korrelationen mellan metylering och genuttryck endast observeras i mindre än 20% av generna [13]

Young et al. utvecklat en effektiv metod för selektiv riktad demetylering av specifika CpGs i mänskliga celler med hjälp av TALE (transcription activator-like effector) selektiva DNA-bindande domänen kombinerad av molekylär ingenjörskonst och TET1 katalytiska hydroxylasdomänen, som katalyserar omvandlingen av 5-metylcytosin till 5-hydroximetylcytosin [14] . Med hjälp av denna fusion TALE-TET1-molekyl visade de att demetylering av vissa CpG- promotorer kan leda till en signifikant ökning av uttrycket av motsvarande mänskliga gener. Utvecklingen av ett enzym baserat på en inaktiverad dCas9- molekyl (som inte kan skära DNA) kommer att avsevärt förenkla skapandet av selektiva demetylaser . Detta kommer att tillåta demetylaset att riktas till de hypermetylerade genpromotorerna som väljs för aktivering av guide-RNA:t. [femton]

Ett medium har utvecklats som orsakar DNA-hypometylering i celler in vitro. Detta medium, som kallas 2i, innehåller två små molekylhämmare, varav en hämmar ERK1/2 -signalvägen och den andra Gsk3β . Det används ofta för att omprogrammera och upprätthålla det pluripotenta tillståndet hos celler [16] [17] .

Förändringar i DNA-metylering med åldrande

Tillbaka på 1970-talet, i verk av Vanyushin B.F. och ett antal andra anställda vid den biologiska fakulteten vid Moscow State University avslöjade sambandet mellan stadierna av individuell utveckling och åldrande av djur och människor med förändringar i en sådan enzymatisk modifiering som DNA-metylering [18] . För serien av verk "DNA-metylering - epigenetisk kontroll över kroppens genetiska funktioner" Vanyushin B.F. tilldelades priset uppkallat efter A. N. Belozersky .

Det är nu välkänt att det genomiska DNA-metyleringslandskapet förändras med åldern [19] [20] [21] [22] [23] . Denna process, som kallas "epigenetisk drift" [24] [25] , är nära relaterad till kronologisk ålder och är samtidigt, enligt vissa författare, inte en markör för replikativ cellulär åldrande , eftersom den också finns i "icke -åldrande” stamceller [26 ] [27] . För replikativt cellulärt åldrande har lite olika epigenetiska biomarkörer hittats, även baserade på förändringar i DNA-metylering på vissa platser i genomet [28]. Att bestämma epigenetiskt åldrande genom DNA-metylering av generna ITGA2B, ASPA och PDE4C gör det möjligt att bestämma den biologiska åldern för en person med en genomsnittlig absolut avvikelse från kronologisk ålder på högst 5 år [29] . Denna noggrannhet är bättre än åldersförutsägelser baserade på telomerlängd .

I processen för åldrande av människokroppen reduceras den funktionella potentialen hos hematopoetiska stamceller (HSC) signifikant , vilket bidrar till utvecklingen av hematopoetisk patofysiologi hos äldre [30] . Denna åldersrelaterade minskning av antalet HSC och deras förmåga att föröka sig beror, som det visade sig, i större utsträckning inte på telomerlängden, utan på DNA-hypermetylering av gener som regleras av Polycomb Repressor Complex 2-proteiner [31] .

Enligt kinesiska forskare [32] kan DNA-metylering bidra till hälsosamt mänskligt åldrande genom att reglera gener som är mottagliga för åldersrelaterade sjukdomar. Till exempel vid Alzheimers sjukdom uttrycks CASP3- kaspas 3 -genen aktivt , som är involverad i klyvningen av beta-amyloid 4A-prekursorproteinet, vilket leder till neuronal död, medan CASP3-genen hos hundraåringar blockeras av hypermetylering av plats nära platsen för transkriptionsinitiering av denna gen. Ett annat exempel: interleukinreceptorgenen IL1R2 har lågt uttryck i fallet med åderförkalkning , medan dess aktivitet hos hundraåringar inte reduceras på grund av den hypometylerade regionen nära platsen för dess transkriptionsinitiering [32] [33] .

Se även: Epigenetisk klocka , samt en recension på ryska [34] och en detaljerad recension på engelska [35]

Rollen av metylering i onkogenes

Epigenetisk ålder har visat sig påverka sannolikheten för att utveckla cancer. En algoritm utvecklades för att beräkna epigenetisk ålder från blodets DNA-metyleringsdata. Algoritmen är baserad på 71 DNA-metyleringsmarkörer, som kan förändras beroende på personens miljö, träning och kost. En studie med denna algoritm på en insamling av blodprover som samlats in under 15 år visade att de med en epigenetisk ålder som är ungefär ett år äldre än sin kronologiska ålder har en 6 % större risk att utveckla cancer inom tre år, och de som är ungefär 2 år. äldre än sin kronologiska ålder De 2 år äldre än sin kronologiska ålder har en 17% ökad risk att dö i cancer inom fem år [36] [37] .

Jämförelse av data om genotypen av personer som är predisponerade för cancer med deras DNA-metyleringsprofil antydde att i cirka 20 % av fallen av ärftlig cancer, hittas ett samband mellan nivån av metylering av vissa loci och genpolymorfismer associerade med risken för cancer. I synnerhet observerades en mycket signifikant korrelation mellan nivån av CpG-metylering och uttrycket av viktiga cancergener som MYC, TERT och TP63 [38] .

Ungefär en tredjedel av alla solida tumörer är associerade med en mutation i KRAS-genen eller med mutationer i de KRAS-associerade vägarna. KRAS stänger av TET1-enzymet, som främjar geninaktivering genom metylering. TET1 katalyserar det inledande steget av aktiv järn- och alfa-ketoglutarat-beroende DNA-demetylering hos däggdjur, omvandlingen av 5-metylcytosin (5-MC) till 5-hydroximetylcytosin (5-HMC) genom oxidation av 5-MC. Tillägget av TET1 till dessa mutanta celler aktiverar tumörsuppressorgener, vilket verkar vara tillräckligt för att minska den onormala proliferationen. Det är dock tillräckligt att inaktivera TET1 för att göra dessa celler maligna igen, även utan KRAS [39] .

En viktig biomarkör för onkogenes är hypermetylering av CpG-öar inom promotorn för ZNF154-genen ( zinkfingerprotein 154) [40] [41] . Hypermetylering av ZNF154 observerades i de allra flesta tumörceller, men var frånvarande i normala celler [42] . Vilken funktion ZNF154-genen utför i kroppen är ännu inte klart. Samtidig hypometylering observeras vanligtvis i två genomiska regioner associerade med Casp8 ( kaspas -8) och VHL (Hippel-Lindau tumörsuppressor) [42] .

DNA-metylering hos insekter

Nivån av DNA-metylering i Drosophila melanogaster , ett favoritobjekt för genetiker , är mycket låg, vilket förhindrade dess studie med bisulfitsekvenseringsmetoder [43] . Takayama et al. [44] utvecklade en mycket känslig metod som gjorde det möjligt att upptäcka att metyleringsprofilen för DNA-sekvenser i fluggenomet skiljer sig mycket från metyleringsprofilen för människans, djurets eller växternas genom. Drosophila-genommetylering är koncentrerad i vissa korta bassekvenser (om 5 baspar) som är rika på CA och CT men utarmade på guanin. Dessutom visade det sig vara oberoende av DNMT2-aktivitet. Ytterligare studier av DNA-metylering i Drosophila kommer att hjälpa till att identifiera åldersrelaterade förändringar i epigenomet.

DNA-metylering i växter

Nyligen har det skett ett betydande genombrott för att förstå processen för DNA-metylering i växter, särskilt i Arabidopsis thaliana . De huvudsakliga DNA-metyltransferaserna i A. thaliana är Met1, Cmt3 och Drm2, som på aminosyrasekvensnivå liknar de ovan beskrivna DNA-metyltransferaserna hos däggdjur. Drm2 tros vara involverad i både de-novo DNA-metylering och underhåll av metylering senare i utvecklingen. Cmt3 och Met1 tjänar huvudsakligen till att upprätthålla DNA-metylering. [45] Andra DNA-metyltransferaser finns också i växter, men deras funktion har ännu inte klarlagts (se [1] ). Man tror att specificiteten för metyltransferas under DNA-metylering moduleras av RNA. Specifika RNA-transkript transkriberas från vissa regioner av matrisen - genomiskt DNA. Dessa RNA-transkript kan bilda dubbelsträngade RNA-molekyler. Dubbelsträngade RNA, genom regulatoriska signalvägar associerade med antingen små störande RNA (siRNA) eller mikroRNA (miRNA), bestämmer lokaliseringen av DNA-metyltransferaser på platser för specifika nukleotidsekvenser i genomet [46] .

Se även

Länkar

  1. ↑ Bethany A. Buck-Koehntop och Pierre-Antoine Defossez (2013) Om hur transkriptionsfaktorer för däggdjur känner igen metylerat DNA. 8(2), 131-137 https://dx.doi.org/10.4161/epi.23632
  2. ↑ Seisenberger S, Peat JR, Hore TA, Santos F, Dean W, Reik W. (2013) Omprogrammering av DNA-metylering i däggdjurens livscykel: bygga och bryta epigenetiska barriärer. Phil. Trans. R. Soc. B 368, 20110330. doi:10.1098/rstb.2011.0330
  3. ↑ Kelsey G, Feil R. (2013) Nya insikter om etablering och underhåll av DNA-metyleringsavtryck hos däggdjur. Phil. Trans. R. Soc. B 368, 20110336. doi:10.1098/rstb.2011.0336
  4. ↑ Rahul M. Kohli & Yi Zhang (2013) TET-enzymer, TDG och dynamiken i DNA-demetylering. Nature 502(7472), 472-479 doi:10.1038/nature12750
  5. ↑ Dodge, Jonathan E.; Bernard H. Ramsahoyeb, Z. Galen Woa, Masaki Okanoa, En Li. De novo-metylering av MMLV-provirus i embryonala stamceller: CpG kontra icke-CpG-metylering  // ScienceDirect  :  journal. - 2002. - Maj.
  6. ↑ Haines, Thomas R. Allel-specifik Non-CpG-metylering av Nf1-genen under tidig musutveckling  // ScienceDirect  :  journal. - 2001. - December.
  7. ↑ Lee M. Butcher, Mitsuteru Ito, Minodora Brimpari, Tiffany J. Morris, Filipa AC Soares, Lars Ährlund-Richter, Nessa Carey, Ludovic Vallier, Anne C. Ferguson-Smith, Stephan Beck. (2016). Icke-CG DNA-metylering är en biomarkör för att bedöma endodermal differentieringskapacitet i pluripotenta stamceller. Nature Communications 7, Artikelnummer: 10458 doi : 10.1038/ncomms10458
  8. ↑ Galitsky V.A. Hypotes om mekanismen för initiering av de novo DNA-metylering och allelisk uteslutning av små RNA  (ryska)  // Tsitol. - 2008. - T. 50 (4) . - S. 277-286 .
  9. ↑ Fan Lai och Ramin Shiekhattar (januari 2014). Där långa icke-kodande RNA möter DNA-metylering Arkiverad 23 februari 2014 på Wayback Machine . Cellforskning, doi: 10.1038/cr.2014.13
  10. ↑ Elias Daura-Oller, Maria Cabre, Miguel A Montero, Jose L Paternain och Antoni Romeu (2009) "Specific gen hypomethylation and cancer: New insights into coding region feature trends". bioinformation. 2009; 3(8): 340-343.PMID PMC2720671
  11. ↑ Stepanenko, AA, & Kavsan, VM (2012) Immortalisering och malign transformation av eukaryota celler. Cytology and Genetics, 46(2), 96-129
  12. ↑ Di Ruscio, A., Ebralidze, A.K., Benoukraf, T. et al. & Tenen, DG (2013) DNMT1-interagerande RNA blockerar genspecifik DNA-metylering . natur; DOI: 10.1038/nature12598
  13. ↑ Rubina Tabassum, Ambily Sivadas, Vartika Agrawal, Haozheng Tian, ​​Dalia Arafat och Greg Gibson (2015). Omic personlighet: implikationer av stabila transkriptions- och metyleringsprofiler för personlig medicin Arkiverad 11 september 2015 på Wayback Machine . Genome Medicine 2015 07:88 doi : 10.1186/s13073-015-0209-4
  14. ↑ Maeder, ML, Angstman, JF, Richardson, ME, et al. & Joung, JK (2013). Riktad DNA-demetylering och aktivering av endogena gener med hjälp av programmerbara TALE-TET1-fusionsproteiner. naturbioteknik. doi:10.1038/nbt.2726
  15. ↑ Xu, X., Tao, Y., Gao, X., Zhang, L., Li, X., Zou, W., ... & Hu, R. (2016). En CRISPR-baserad metod för riktad DNA-demetylering Arkiverad 10 september 2016 på Wayback Machine . Cell Discovery, 2. , Artikelnummer: 16009(2016) doi : 10.1038/celldisc.2016.9
  16. ↑ Gabriella Ficz, Timothy A. Hore, Fatima Santos, et al. & Wolf Reik (2013) FGF-signaleringshämning i ESC driver snabb genomomfattande demetylering till det epigenetiska grundtillståndet för pluripotens Arkiverad 24 september 2015 på Wayback Machine . Cell Stem Cell, 13(3), 351-359 https://dx.doi.org/10.1016/j.stem.2013.06.004
  17. ↑ Hakan Bagci, Amanda G. Fisher (2013) DNA-demetylering i pluripotens och omprogrammering: Tet-proteinernas och celldelningens roll. Cell Stem Cell, 13(3), 265-269 doi: 10.1016/j.stem.2013.08.005
  18. ↑ Vanyushin B., Berdyshev G. (1977). Molekylärgenetiska mekanismer för åldrande Arkiverad 12 mars 2016 på Wayback Machine . Förlaget Medicin. Moskva. Bookinistisk upplaga.
  19. ↑ Johansson Å, Enroth S, Gyllensten U (2013) Continuous Aging of the Human DNA Methylome Through the Human Lifespan. PLoS ONE 8(6): e67378. doi:10.1371/journal.pone.0067378
  20. ↑ Hannum, G., Guinney, J., Zhao, L., et al. & Zhang, K. (2013). Genomomfattande metyleringsprofiler avslöjar kvantitativa synpunkter på mänskliga åldrande. Molecular cell, 49(2), 359-367.
  21. ↑ Heyn H, Li N, Ferreira HJ, Moran S, Pisano DG, et al. (2012) Distinkta DNA-metylomer hos nyfödda och hundraåringar. Proc Natl Acad Sci USA 109: 10522-10527. doi:10.1073/pnas.1120658109
  22. ↑ Pogribny, IP, & Vanyushin, BF (2010). Åldersrelaterad genetisk hypometylering. I Epigenetics of Aging (s. 11-27). Springer New York. DOI: 10.1007/978-1-4419-0639-7_2
  23. ↑ Florath, I., Butterbach, K., Müller, H., Bewerunge-Hudler, M., et al. & Baca, V. (2013). Tvärsnitts- och longitudinella förändringar i DNA-metylering med ålder: En epigenomomfattande analys som avslöjar över nya åldersassocierade CpG-ställen. Human molekylär genetik, doi: 10.1093/hmg/ddt531
  24. ↑ Teschendorff, A.E., West, J., & Beck, S. (2013). Åldersassocierad epigenetisk drift: implikationer och ett fall av epigenetisk sparsamhet?. Brum. Mol. Genet. 22(R1):R7-R15 doi:10.1093/hmg/ddt375
  25. ↑ West, J., Widschwendter, M., & Teschendorff, A.E. (2013). Distinkt topologi av åldersassocierad epigenetisk drift i den mänskliga interaktomen. PNAS, 110(35), 14138-14143. doi:10.1073/pnas.1307242110
  26. ↑ Steve Horvath (2013) DNA-metyleringsålder för mänskliga vävnader och celltyper Arkiverad 20 januari 2018 på Wayback Machine . Genome Biology, 14(10):R115 doi:10.1186/gb-2013-14-10-r115
  27. ↑ Bocklandt S, Lin W, Sehl ME, Sánchez FJ, Sinsheimer JS, et al. (2011) Epigenetic Predictor of Age Arkiverad 4 november 2013 på Wayback Machine . PLoS ONE 6(6): e14821. doi:10.1371/journal.pone.0014821
  28. ↑ Koch, CM, & Wagner, W. (2013). Epigenetisk biomarkör för att bestämma replikativ åldrande av odlade celler. I biologiskt åldrande. Ser.: Methods in Molecular Biology, vol. 1048, (sid. 309-321). Humana Press. DOI: 10.1007/978-1-62703-556-9_20
  29. ↑ Carola Ingrid Weidner, Qiong Lin, Carmen Maike Koch et al. och Wolfgang Wagner (februari 2014). Åldrande av blod kan spåras av DNA-metyleringsförändringar på bara tre CpG-ställen Arkiverad 9 februari 2014 på Wayback Machine . Genome Biology, 15:R24 doi:10.1186/gb-2014-15-2-r24
  30. ↑ Myung Geun Shin (2014). Åldrande och nedsatt hematopoiesis. J Korean Med Assoc.; 57(4), 334-340. https://dx.doi.org/10.5124/jkma.2014.57.4.334
  31. ↑ Beerman, I., Bock, C., Garrison, BS, Smith, ZD, Gu, H., Meissner, A., & Rossi, DJ (2013). Proliferationsberoende förändringar av DNA-metyleringslandskapet ligger bakom hematopoetisk stamcells åldrande. Cell Stem Cell, 12(4), 413-425 doi : 10.1016/j.stem.2013.01.017
  32. ↑ 1 2 Xiao FH, He YH, Li QG, Wu H, Luo LH, Kong QP (2015). En genomomfattande skanning avslöjar viktiga roller för DNA-metylering i mänsklig livslängd genom att reglera åldersrelaterade sjukdomsgener Arkiverad 18 maj 2015 på Wayback Machine . PLoS ONE 10(3): e0120388. doi : 10.1371/journal.pone.0120388
  33. ↑ Jones, MJ, Goodman, SJ och Kobor, MS (2015), DNA-metylering och hälsosamt mänskligt åldrande Arkiverad 10 juli 2015 på Wayback Machine . åldrande cell. doi : 10.1111/acel.12349
  34. ↑ Åldrandets epigenetik: en banbrytande riktning inom gerontologi? . Hämtad 21 februari 2020. Arkiverad från originalet 21 februari 2020.
  35. ↑ Horvath, S., & Raj, K. (2018). DNA-metyleringsbaserade biomarkörer och den epigenetiska klockteorin om åldrande. Nature Reviews Genetics, doi : 10.1038/s41576-018-0004-3 PMID 29643443
  36. ↑ Epigenetisk-kronologisk åldersfelmatchning varnar för cancer Arkiverad 21 februari 2016 på Wayback Machine . Nyheter om genteknik och bioteknik. 18 februari 2016
  37. ↑ Zheng, Y., Joyce, BT, Colicino, E., Liu, L., Zhang, W., Dai, Q., ... & Jafari, N. (2016). Blodets epigenetiska ålder kan förutsäga cancerincidens och dödlighet. EBioMedicine. doi : 10.1016/j.ebiom.2016.02.008
  38. ↑ Heyn H, Sayols S, Moutinho C, et al. & Esteller M. (2014) Koppling av DNA-metylering kvantitativa egenskapslägen till mänsklig cancerrisk. Cell Reports, https://dx.doi.org/10.1016/j.celrep.2014.03.016
  39. ↑ Bo-Kuan Wu, Charles Brenner (2014). Undertryckande av TET1-beroende DNA-demetylering är väsentligt för KRAS-medierad transformation. Cell Reports, DOI: https://dx.doi.org/10.1016/j.celrep.2014.10.063
  40. ↑ Gennady Margolin, Hanna M. Petrykowska, Nader Jameel, Daphne W. Bell, Alice C. Young, Laura Elnitski (2016). Robust detektion av DNA-hypermetylering av ZNF154 som ett pan-cancerlokus med in Silico-modellering för blodbaserad diagnostisk utveckling. Journal of Molecular Diagnostics. DOI: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmoldx.2015.11.004
  41. ↑ Forskare identifierar slående genomisk signatur som delas av fem typer av cancer . Hämtad 5 februari 2016. Arkiverad från originalet 6 februari 2016.
  42. ↑ 1 2 Sánchez-Vega, F., Gotea, V., Petrykowska, HM, Margolin, G., Krivak, TC, DeLoia, JA, ... & Elnitski, L. (2013). Återkommande mönster av DNA-metylering i ZNF154-, CASP8- och VHL-promotorerna över ett brett spektrum av humana solida epiteltumörer och cancercellinjer. Epigenetics, 8(12), 1355-1372. doi : 10.4161/epi.26701
  43. ↑ Capuano F., Mülleder M., Kok RM, Blom HJ, Ralser M. Cytosine DNA-metylering finns i Drosophila melanogaster men saknas i Saccharomyces cerevisiae , Schizosaccharomyces pombe och andra jästarter  (engelska)  // Analytical journal Chemistry . - 2014. - Vol. 86 , nr. 8 . - P. 3697-3702 . doi : 10.1021 / ac500447w . — PMID 24640988 .
  44. ↑ S. Takayama, J. Dhahbi, A. Roberts, G. Mao, S.-J. Heo, L. Pachter, DIK Martin, D. Boffelli (2014). Genommetylering i D. melanogaster finns vid specifika korta motiv och är oberoende av DNMT2-aktivitet. Genomforskning, doi : 10.1101/gr.162412.113
  45. ↑ Cao, Xiaofeng; Jacobsen, Steven E. Lokusspecifik kontroll av asymmetrisk metylering och CpNpG-metylering av DRM- och CMT3-metyltransferasgener // Proceedings of the National Academy of Sciences  : journal  . jul. – 2003.  
  46. ↑ Aufsatz, Werner; M. Florian Mette, Johannes van der Winden, Antonius JM Matzke, Marjori Matzke. RNA-riktad DNA-metylering i Arabidopsis  (neopr.)  // Proceedings of the National Academy of Sciences . — Dec. – 2002.

Litteratur

Länkar

 Transkription (biologi)
Transkriptionsreglering
_
prokaryoter
eukaryoter
Histonmodifieringsenzymer ( histoner / nukleosom )
_
_
DNA-metyleringDNA-metyltransferas
Kromatin ombyggnad
CHD7
Gemensamt för
pro- och eukaryoter
Aktivering
InitieringStartsida för transkription
Förlängning
Uppsägning