Ro oberoende uppsägning

Intern terminering , även ρ-oberoende terminering , Rho - oberoende terminering , är en  mekanism för att stoppa gentranskription i prokaryoter [1] . Kärnan i denna mekanism är som följer: mRNA innehåller en guanin-cytosin-berikad sekvens, som kan bilda hårnålsstrukturer med en längd på 7-20 baspar. Guanin och cytosin bildar tre vätebindningar med varandra och är därför ganska starkt bundna [2] . Omedelbart efter hårnålen finns ett område berikat med uracil . Bindningarna mellan uracil och adenin är mycket svaga. Det RNA-polymerasassocierade proteinet ( nusA ) binder så hårt till hårnålen att det gör att polymeraset tillfälligt stängs av och transkriptionen upphör [3] . Vid denna tidpunkt är polymeraset lokaliserat på polyuracilregionen av sekvensen. Svaga adenin-uracilbindningar minskar destabiliseringsenergin hos RNA-DNA-duplexet, vilket gör att de kan försvaga spänningen i polynukleotidkedjan och dissociera från RNA-polymeras [2] .

Rho-element som inte innehåller en polyuracilsekvens kan stoppa RNA-polymeras, men det fortsätter vanligtvis transkriptionen efter ett tag, eftersom duplexet är för stabilt för att orsaka dissociation av RNA-polymeras och efterföljande terminering.

Rho-oberoende transkriptionsterminering är en vanlig mekanism som ligger till grund för aktiviteten av cis -regulatoriska RNA- element såsom riboswitches .

Anteckningar

1. ↑ Farnham, PJ; Platt, T. Rho-oberoende terminering: dyadsymmetri i DNA får RNA-polymeras att pausa under transkription in vitro  //  Nucleic Acids Research : journal. - 1981. - 11 februari ( vol. 9 , nr 3 ). - s. 563-577 . doi : 10.1093 / nar/9.3.563 . — PMID 7012794 .
2. ↑ 1 2 Lewin, Benjamin. Gener IX  (neopr.) . — Sudbury, MA: Jones and Bartlett Publishers, 2007. - ISBN 0-7637-4063-2 .
3. ↑ Wilson KS, von Hippel PH Transkriptionsavslutning vid inneboende terminatorer: rollen för RNA-hårnålen  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1995. - September ( vol. 92 , nr 19 ). - P. 8793-8797 . - doi : 10.1073/pnas.92.19.8793 . — PMID 7568019 .